Protein–RNA interactions for Protein: Q96BW1

UPRT, Uracil phosphoribosyltransferase homolog, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPRTQ96BW1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UPRTQ96BW1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UPRTQ96BW1 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
UPRTQ96BW1 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UPRTQ96BW1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UPRTQ96BW1 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UPRTQ96BW1 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
UPRTQ96BW1 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
UPRTQ96BW1 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
UPRTQ96BW1 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
UPRTQ96BW1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
UPRTQ96BW1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
UPRTQ96BW1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
UPRTQ96BW1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
UPRTQ96BW1 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
UPRTQ96BW1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
UPRTQ96BW1 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UPRTQ96BW1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
UPRTQ96BW1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
UPRTQ96BW1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
UPRTQ96BW1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
UPRTQ96BW1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
UPRTQ96BW1 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
UPRTQ96BW1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UPRTQ96BW1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
UPRTQ96BW1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
UPRTQ96BW1 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UPRTQ96BW1 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UPRTQ96BW1 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
UPRTQ96BW1 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UPRTQ96BW1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UPRTQ96BW1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UPRTQ96BW1 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UPRTQ96BW1 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UPRTQ96BW1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
UPRTQ96BW1 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UPRTQ96BW1 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
UPRTQ96BW1 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UPRTQ96BW1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UPRTQ96BW1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UPRTQ96BW1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
UPRTQ96BW1 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UPRTQ96BW1 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
UPRTQ96BW1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
UPRTQ96BW1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
UPRTQ96BW1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
UPRTQ96BW1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UPRTQ96BW1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
UPRTQ96BW1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UPRTQ96BW1 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UPRTQ96BW1 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UPRTQ96BW1 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
UPRTQ96BW1 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
UPRTQ96BW1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
UPRTQ96BW1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
UPRTQ96BW1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
UPRTQ96BW1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
UPRTQ96BW1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
UPRTQ96BW1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
UPRTQ96BW1 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
UPRTQ96BW1 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
UPRTQ96BW1 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
UPRTQ96BW1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
UPRTQ96BW1 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
UPRTQ96BW1 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
UPRTQ96BW1 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
UPRTQ96BW1 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
UPRTQ96BW1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
UPRTQ96BW1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
UPRTQ96BW1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
UPRTQ96BW1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
UPRTQ96BW1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
UPRTQ96BW1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
UPRTQ96BW1 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
UPRTQ96BW1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
UPRTQ96BW1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
UPRTQ96BW1 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
UPRTQ96BW1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
UPRTQ96BW1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
UPRTQ96BW1 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
UPRTQ96BW1 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
UPRTQ96BW1 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
UPRTQ96BW1 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
UPRTQ96BW1 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
UPRTQ96BW1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
UPRTQ96BW1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
UPRTQ96BW1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
UPRTQ96BW1 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
UPRTQ96BW1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
UPRTQ96BW1 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
UPRTQ96BW1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
UPRTQ96BW1 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
UPRTQ96BW1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
UPRTQ96BW1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
UPRTQ96BW1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
UPRTQ96BW1 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
UPRTQ96BW1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UPRTQ96BW1 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
UPRTQ96BW1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UPRTQ96BW1 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms