Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAE3

LINC01555, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01555, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01555Q8NAE3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LINC01555Q8NAE3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LINC01555Q8NAE3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LINC01555Q8NAE3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LINC01555Q8NAE3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LINC01555Q8NAE3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LINC01555Q8NAE3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LINC01555Q8NAE3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LINC01555Q8NAE3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LINC01555Q8NAE3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LINC01555Q8NAE3 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
LINC01555Q8NAE3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LINC01555Q8NAE3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LINC01555Q8NAE3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LINC01555Q8NAE3 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LINC01555Q8NAE3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LINC01555Q8NAE3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LINC01555Q8NAE3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LINC01555Q8NAE3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LINC01555Q8NAE3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LINC01555Q8NAE3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LINC01555Q8NAE3 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LINC01555Q8NAE3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LINC01555Q8NAE3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LINC01555Q8NAE3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LINC01555Q8NAE3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LINC01555Q8NAE3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LINC01555Q8NAE3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LINC01555Q8NAE3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LINC01555Q8NAE3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LINC01555Q8NAE3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LINC01555Q8NAE3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LINC01555Q8NAE3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LINC01555Q8NAE3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LINC01555Q8NAE3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LINC01555Q8NAE3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LINC01555Q8NAE3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LINC01555Q8NAE3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LINC01555Q8NAE3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LINC01555Q8NAE3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LINC01555Q8NAE3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LINC01555Q8NAE3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LINC01555Q8NAE3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LINC01555Q8NAE3 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LINC01555Q8NAE3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LINC01555Q8NAE3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LINC01555Q8NAE3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LINC01555Q8NAE3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
LINC01555Q8NAE3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LINC01555Q8NAE3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LINC01555Q8NAE3 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
LINC01555Q8NAE3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LINC01555Q8NAE3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LINC01555Q8NAE3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LINC01555Q8NAE3 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LINC01555Q8NAE3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LINC01555Q8NAE3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LINC01555Q8NAE3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LINC01555Q8NAE3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LINC01555Q8NAE3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LINC01555Q8NAE3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LINC01555Q8NAE3 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LINC01555Q8NAE3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LINC01555Q8NAE3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
LINC01555Q8NAE3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
LINC01555Q8NAE3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LINC01555Q8NAE3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LINC01555Q8NAE3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LINC01555Q8NAE3 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LINC01555Q8NAE3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LINC01555Q8NAE3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LINC01555Q8NAE3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LINC01555Q8NAE3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LINC01555Q8NAE3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LINC01555Q8NAE3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LINC01555Q8NAE3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LINC01555Q8NAE3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LINC01555Q8NAE3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LINC01555Q8NAE3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LINC01555Q8NAE3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LINC01555Q8NAE3 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LINC01555Q8NAE3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LINC01555Q8NAE3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
LINC01555Q8NAE3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
LINC01555Q8NAE3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LINC01555Q8NAE3 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LINC01555Q8NAE3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LINC01555Q8NAE3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LINC01555Q8NAE3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LINC01555Q8NAE3 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LINC01555Q8NAE3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LINC01555Q8NAE3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LINC01555Q8NAE3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LINC01555Q8NAE3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
LINC01555Q8NAE3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LINC01555Q8NAE3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LINC01555Q8NAE3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LINC01555Q8NAE3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LINC01555Q8NAE3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
LINC01555Q8NAE3 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.4 ms