Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W5

DNAAF3, Dynein assembly factor 3, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF3Q8N9W5 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
DNAAF3Q8N9W5 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DNAAF3Q8N9W5 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DNAAF3Q8N9W5 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DNAAF3Q8N9W5 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DNAAF3Q8N9W5 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DNAAF3Q8N9W5 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DNAAF3Q8N9W5 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DNAAF3Q8N9W5 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DNAAF3Q8N9W5 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DNAAF3Q8N9W5 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DNAAF3Q8N9W5 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DNAAF3Q8N9W5 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DNAAF3Q8N9W5 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DNAAF3Q8N9W5 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DNAAF3Q8N9W5 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DNAAF3Q8N9W5 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DNAAF3Q8N9W5 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DNAAF3Q8N9W5 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DNAAF3Q8N9W5 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DNAAF3Q8N9W5 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DNAAF3Q8N9W5 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DNAAF3Q8N9W5 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DNAAF3Q8N9W5 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DNAAF3Q8N9W5 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
DNAAF3Q8N9W5 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
DNAAF3Q8N9W5 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
DNAAF3Q8N9W5 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
DNAAF3Q8N9W5 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DNAAF3Q8N9W5 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DNAAF3Q8N9W5 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DNAAF3Q8N9W5 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
DNAAF3Q8N9W5 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DNAAF3Q8N9W5 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
DNAAF3Q8N9W5 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DNAAF3Q8N9W5 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
DNAAF3Q8N9W5 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DNAAF3Q8N9W5 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DNAAF3Q8N9W5 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DNAAF3Q8N9W5 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DNAAF3Q8N9W5 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DNAAF3Q8N9W5 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DNAAF3Q8N9W5 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DNAAF3Q8N9W5 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DNAAF3Q8N9W5 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DNAAF3Q8N9W5 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DNAAF3Q8N9W5 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DNAAF3Q8N9W5 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DNAAF3Q8N9W5 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DNAAF3Q8N9W5 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DNAAF3Q8N9W5 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DNAAF3Q8N9W5 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DNAAF3Q8N9W5 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DNAAF3Q8N9W5 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DNAAF3Q8N9W5 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DNAAF3Q8N9W5 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DNAAF3Q8N9W5 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DNAAF3Q8N9W5 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DNAAF3Q8N9W5 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DNAAF3Q8N9W5 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DNAAF3Q8N9W5 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DNAAF3Q8N9W5 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DNAAF3Q8N9W5 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DNAAF3Q8N9W5 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DNAAF3Q8N9W5 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DNAAF3Q8N9W5 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DNAAF3Q8N9W5 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DNAAF3Q8N9W5 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DNAAF3Q8N9W5 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
DNAAF3Q8N9W5 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DNAAF3Q8N9W5 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DNAAF3Q8N9W5 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DNAAF3Q8N9W5 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DNAAF3Q8N9W5 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
DNAAF3Q8N9W5 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DNAAF3Q8N9W5 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DNAAF3Q8N9W5 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DNAAF3Q8N9W5 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DNAAF3Q8N9W5 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DNAAF3Q8N9W5 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DNAAF3Q8N9W5 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DNAAF3Q8N9W5 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
DNAAF3Q8N9W5 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
DNAAF3Q8N9W5 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
DNAAF3Q8N9W5 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
DNAAF3Q8N9W5 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DNAAF3Q8N9W5 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DNAAF3Q8N9W5 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DNAAF3Q8N9W5 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DNAAF3Q8N9W5 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DNAAF3Q8N9W5 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
DNAAF3Q8N9W5 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DNAAF3Q8N9W5 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DNAAF3Q8N9W5 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DNAAF3Q8N9W5 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DNAAF3Q8N9W5 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
DNAAF3Q8N9W5 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DNAAF3Q8N9W5 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DNAAF3Q8N9W5 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DNAAF3Q8N9W5 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms