Protein–RNA interactions for Protein: Q86YN6

PPARGC1B, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,023 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1BQ86YN6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
PPARGC1BQ86YN6 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
PPARGC1BQ86YN6 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
PPARGC1BQ86YN6 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
PPARGC1BQ86YN6 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
PPARGC1BQ86YN6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC36.79■■■■□ 3.48
PPARGC1BQ86YN6 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
PPARGC1BQ86YN6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
PPARGC1BQ86YN6 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
PPARGC1BQ86YN6 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
PPARGC1BQ86YN6 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
PPARGC1BQ86YN6 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
PPARGC1BQ86YN6 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
PPARGC1BQ86YN6 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
PPARGC1BQ86YN6 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC36.78■■■■□ 3.48
PPARGC1BQ86YN6 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
PPARGC1BQ86YN6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
PPARGC1BQ86YN6 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC36.77■■■■□ 3.48
PPARGC1BQ86YN6 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC36.77■■■■□ 3.48
PPARGC1BQ86YN6 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.77■■■■□ 3.48
PPARGC1BQ86YN6 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
PPARGC1BQ86YN6 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC36.76■■■■□ 3.48
PPARGC1BQ86YN6 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC36.76■■■■□ 3.48
PPARGC1BQ86YN6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.47
PPARGC1BQ86YN6 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
PPARGC1BQ86YN6 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
PPARGC1BQ86YN6 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
PPARGC1BQ86YN6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
PPARGC1BQ86YN6 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
PPARGC1BQ86YN6 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
PPARGC1BQ86YN6 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
PPARGC1BQ86YN6 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
PPARGC1BQ86YN6 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
PPARGC1BQ86YN6 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
PPARGC1BQ86YN6 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
PPARGC1BQ86YN6 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
PPARGC1BQ86YN6 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC36.74■■■■□ 3.47
PPARGC1BQ86YN6 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
PPARGC1BQ86YN6 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
PPARGC1BQ86YN6 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
PPARGC1BQ86YN6 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
PPARGC1BQ86YN6 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC36.72■■■■□ 3.47
PPARGC1BQ86YN6 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC36.72■■■■□ 3.47
PPARGC1BQ86YN6 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC36.72■■■■□ 3.47
PPARGC1BQ86YN6 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
PPARGC1BQ86YN6 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC36.71■■■■□ 3.47
PPARGC1BQ86YN6 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
PPARGC1BQ86YN6 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
PPARGC1BQ86YN6 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
PPARGC1BQ86YN6 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
PPARGC1BQ86YN6 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.47
PPARGC1BQ86YN6 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
PPARGC1BQ86YN6 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
PPARGC1BQ86YN6 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
PPARGC1BQ86YN6 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC36.7■■■■□ 3.47
PPARGC1BQ86YN6 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.7■■■■□ 3.47
PPARGC1BQ86YN6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.46
PPARGC1BQ86YN6 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
PPARGC1BQ86YN6 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
PPARGC1BQ86YN6 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
PPARGC1BQ86YN6 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
PPARGC1BQ86YN6 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
PPARGC1BQ86YN6 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
PPARGC1BQ86YN6 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
PPARGC1BQ86YN6 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
PPARGC1BQ86YN6 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
PPARGC1BQ86YN6 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
PPARGC1BQ86YN6 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
PPARGC1BQ86YN6 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
PPARGC1BQ86YN6 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
PPARGC1BQ86YN6 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.68■■■■□ 3.46
PPARGC1BQ86YN6 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
PPARGC1BQ86YN6 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC36.68■■■■□ 3.46
PPARGC1BQ86YN6 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
PPARGC1BQ86YN6 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
PPARGC1BQ86YN6 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC36.68■■■■□ 3.46
PPARGC1BQ86YN6 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC36.68■■■■□ 3.46
PPARGC1BQ86YN6 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC36.68■■■■□ 3.46
PPARGC1BQ86YN6 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC36.68■■■■□ 3.46
PPARGC1BQ86YN6 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
PPARGC1BQ86YN6 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.67■■■■□ 3.46
PPARGC1BQ86YN6 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.67■■■■□ 3.46
PPARGC1BQ86YN6 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
PPARGC1BQ86YN6 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
PPARGC1BQ86YN6 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
PPARGC1BQ86YN6 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC36.66■■■■□ 3.46
PPARGC1BQ86YN6 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
PPARGC1BQ86YN6 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
PPARGC1BQ86YN6 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
PPARGC1BQ86YN6 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC36.66■■■■□ 3.46
PPARGC1BQ86YN6 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
PPARGC1BQ86YN6 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC36.66■■■■□ 3.46
PPARGC1BQ86YN6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
PPARGC1BQ86YN6 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
PPARGC1BQ86YN6 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC36.65■■■■□ 3.46
PPARGC1BQ86YN6 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.65■■■■□ 3.46
PPARGC1BQ86YN6 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
PPARGC1BQ86YN6 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC36.65■■■■□ 3.46
PPARGC1BQ86YN6 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
PPARGC1BQ86YN6 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC36.65■■■■□ 3.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms