Protein–RNA interactions for Protein: Q6W4X9

MUC6, Mucin-6, humanhuman

Predictions only

Length 2,439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MUC6Q6W4X9 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
MUC6Q6W4X9 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MUC6Q6W4X9 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MUC6Q6W4X9 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MUC6Q6W4X9 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MUC6Q6W4X9 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MUC6Q6W4X9 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MUC6Q6W4X9 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MUC6Q6W4X9 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MUC6Q6W4X9 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MUC6Q6W4X9 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MUC6Q6W4X9 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MUC6Q6W4X9 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MUC6Q6W4X9 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MUC6Q6W4X9 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MUC6Q6W4X9 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MUC6Q6W4X9 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MUC6Q6W4X9 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MUC6Q6W4X9 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MUC6Q6W4X9 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MUC6Q6W4X9 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MUC6Q6W4X9 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MUC6Q6W4X9 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MUC6Q6W4X9 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
MUC6Q6W4X9 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MUC6Q6W4X9 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
MUC6Q6W4X9 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MUC6Q6W4X9 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MUC6Q6W4X9 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MUC6Q6W4X9 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
MUC6Q6W4X9 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MUC6Q6W4X9 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MUC6Q6W4X9 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
MUC6Q6W4X9 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MUC6Q6W4X9 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MUC6Q6W4X9 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
MUC6Q6W4X9 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MUC6Q6W4X9 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MUC6Q6W4X9 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MUC6Q6W4X9 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MUC6Q6W4X9 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
MUC6Q6W4X9 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
MUC6Q6W4X9 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
MUC6Q6W4X9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MUC6Q6W4X9 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MUC6Q6W4X9 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MUC6Q6W4X9 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MUC6Q6W4X9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MUC6Q6W4X9 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MUC6Q6W4X9 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MUC6Q6W4X9 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MUC6Q6W4X9 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MUC6Q6W4X9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MUC6Q6W4X9 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MUC6Q6W4X9 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MUC6Q6W4X9 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MUC6Q6W4X9 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MUC6Q6W4X9 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MUC6Q6W4X9 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MUC6Q6W4X9 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MUC6Q6W4X9 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MUC6Q6W4X9 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MUC6Q6W4X9 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MUC6Q6W4X9 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MUC6Q6W4X9 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MUC6Q6W4X9 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MUC6Q6W4X9 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MUC6Q6W4X9 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
MUC6Q6W4X9 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
MUC6Q6W4X9 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MUC6Q6W4X9 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MUC6Q6W4X9 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MUC6Q6W4X9 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MUC6Q6W4X9 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MUC6Q6W4X9 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MUC6Q6W4X9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MUC6Q6W4X9 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MUC6Q6W4X9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MUC6Q6W4X9 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MUC6Q6W4X9 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MUC6Q6W4X9 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MUC6Q6W4X9 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MUC6Q6W4X9 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MUC6Q6W4X9 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MUC6Q6W4X9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MUC6Q6W4X9 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MUC6Q6W4X9 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MUC6Q6W4X9 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MUC6Q6W4X9 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MUC6Q6W4X9 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MUC6Q6W4X9 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MUC6Q6W4X9 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MUC6Q6W4X9 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MUC6Q6W4X9 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MUC6Q6W4X9 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MUC6Q6W4X9 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MUC6Q6W4X9 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MUC6Q6W4X9 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MUC6Q6W4X9 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MUC6Q6W4X9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms