Protein–RNA interactions for Protein: Q6SA08

TSSK4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK4Q6SA08 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TSSK4Q6SA08 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TSSK4Q6SA08 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TSSK4Q6SA08 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TSSK4Q6SA08 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TSSK4Q6SA08 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TSSK4Q6SA08 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TSSK4Q6SA08 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TSSK4Q6SA08 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TSSK4Q6SA08 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TSSK4Q6SA08 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TSSK4Q6SA08 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TSSK4Q6SA08 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TSSK4Q6SA08 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TSSK4Q6SA08 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TSSK4Q6SA08 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TSSK4Q6SA08 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TSSK4Q6SA08 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TSSK4Q6SA08 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TSSK4Q6SA08 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TSSK4Q6SA08 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TSSK4Q6SA08 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSSK4Q6SA08 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSSK4Q6SA08 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSSK4Q6SA08 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSSK4Q6SA08 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSSK4Q6SA08 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSSK4Q6SA08 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSSK4Q6SA08 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TSSK4Q6SA08 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TSSK4Q6SA08 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TSSK4Q6SA08 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TSSK4Q6SA08 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TSSK4Q6SA08 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TSSK4Q6SA08 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TSSK4Q6SA08 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TSSK4Q6SA08 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TSSK4Q6SA08 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TSSK4Q6SA08 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TSSK4Q6SA08 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TSSK4Q6SA08 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TSSK4Q6SA08 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TSSK4Q6SA08 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TSSK4Q6SA08 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TSSK4Q6SA08 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TSSK4Q6SA08 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TSSK4Q6SA08 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TSSK4Q6SA08 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TSSK4Q6SA08 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TSSK4Q6SA08 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TSSK4Q6SA08 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TSSK4Q6SA08 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TSSK4Q6SA08 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TSSK4Q6SA08 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TSSK4Q6SA08 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TSSK4Q6SA08 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TSSK4Q6SA08 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TSSK4Q6SA08 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TSSK4Q6SA08 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TSSK4Q6SA08 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TSSK4Q6SA08 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TSSK4Q6SA08 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TSSK4Q6SA08 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TSSK4Q6SA08 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TSSK4Q6SA08 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TSSK4Q6SA08 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TSSK4Q6SA08 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TSSK4Q6SA08 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TSSK4Q6SA08 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSSK4Q6SA08 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSSK4Q6SA08 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSSK4Q6SA08 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSSK4Q6SA08 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSSK4Q6SA08 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSSK4Q6SA08 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TSSK4Q6SA08 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSSK4Q6SA08 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSSK4Q6SA08 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSSK4Q6SA08 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSSK4Q6SA08 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TSSK4Q6SA08 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TSSK4Q6SA08 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSSK4Q6SA08 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TSSK4Q6SA08 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TSSK4Q6SA08 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TSSK4Q6SA08 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TSSK4Q6SA08 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TSSK4Q6SA08 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TSSK4Q6SA08 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TSSK4Q6SA08 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TSSK4Q6SA08 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TSSK4Q6SA08 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TSSK4Q6SA08 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TSSK4Q6SA08 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TSSK4Q6SA08 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TSSK4Q6SA08 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TSSK4Q6SA08 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TSSK4Q6SA08 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TSSK4Q6SA08 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSSK4Q6SA08 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms