Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDE5

SVEP1, Sushi, von Willebrand factor type A, EGF and pentraxin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 3,571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVEP1Q4LDE5 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SVEP1Q4LDE5 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SVEP1Q4LDE5 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SVEP1Q4LDE5 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SVEP1Q4LDE5 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SVEP1Q4LDE5 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SVEP1Q4LDE5 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SVEP1Q4LDE5 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SVEP1Q4LDE5 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SVEP1Q4LDE5 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SVEP1Q4LDE5 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SVEP1Q4LDE5 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SVEP1Q4LDE5 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SVEP1Q4LDE5 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SVEP1Q4LDE5 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SVEP1Q4LDE5 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SVEP1Q4LDE5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SVEP1Q4LDE5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SVEP1Q4LDE5 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SVEP1Q4LDE5 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SVEP1Q4LDE5 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SVEP1Q4LDE5 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SVEP1Q4LDE5 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SVEP1Q4LDE5 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SVEP1Q4LDE5 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SVEP1Q4LDE5 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SVEP1Q4LDE5 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SVEP1Q4LDE5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SVEP1Q4LDE5 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SVEP1Q4LDE5 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SVEP1Q4LDE5 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SVEP1Q4LDE5 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SVEP1Q4LDE5 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SVEP1Q4LDE5 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SVEP1Q4LDE5 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SVEP1Q4LDE5 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SVEP1Q4LDE5 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SVEP1Q4LDE5 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SVEP1Q4LDE5 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SVEP1Q4LDE5 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SVEP1Q4LDE5 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SVEP1Q4LDE5 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SVEP1Q4LDE5 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SVEP1Q4LDE5 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SVEP1Q4LDE5 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SVEP1Q4LDE5 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SVEP1Q4LDE5 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SVEP1Q4LDE5 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SVEP1Q4LDE5 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SVEP1Q4LDE5 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SVEP1Q4LDE5 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SVEP1Q4LDE5 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SVEP1Q4LDE5 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SVEP1Q4LDE5 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SVEP1Q4LDE5 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SVEP1Q4LDE5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SVEP1Q4LDE5 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SVEP1Q4LDE5 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SVEP1Q4LDE5 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SVEP1Q4LDE5 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SVEP1Q4LDE5 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SVEP1Q4LDE5 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SVEP1Q4LDE5 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SVEP1Q4LDE5 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SVEP1Q4LDE5 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SVEP1Q4LDE5 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SVEP1Q4LDE5 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SVEP1Q4LDE5 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SVEP1Q4LDE5 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SVEP1Q4LDE5 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SVEP1Q4LDE5 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SVEP1Q4LDE5 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SVEP1Q4LDE5 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SVEP1Q4LDE5 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SVEP1Q4LDE5 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SVEP1Q4LDE5 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SVEP1Q4LDE5 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SVEP1Q4LDE5 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SVEP1Q4LDE5 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SVEP1Q4LDE5 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SVEP1Q4LDE5 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SVEP1Q4LDE5 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SVEP1Q4LDE5 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SVEP1Q4LDE5 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SVEP1Q4LDE5 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SVEP1Q4LDE5 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SVEP1Q4LDE5 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SVEP1Q4LDE5 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SVEP1Q4LDE5 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SVEP1Q4LDE5 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SVEP1Q4LDE5 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SVEP1Q4LDE5 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SVEP1Q4LDE5 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SVEP1Q4LDE5 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SVEP1Q4LDE5 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SVEP1Q4LDE5 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SVEP1Q4LDE5 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SVEP1Q4LDE5 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SVEP1Q4LDE5 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SVEP1Q4LDE5 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms