Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NEDD8Q15843 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NEDD8Q15843 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NEDD8Q15843 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NEDD8Q15843 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
NEDD8Q15843 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NEDD8Q15843 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NEDD8Q15843 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NEDD8Q15843 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
NEDD8Q15843 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NEDD8Q15843 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NEDD8Q15843 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
NEDD8Q15843 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NEDD8Q15843 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
NEDD8Q15843 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NEDD8Q15843 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NEDD8Q15843 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NEDD8Q15843 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NEDD8Q15843 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NEDD8Q15843 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NEDD8Q15843 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NEDD8Q15843 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NEDD8Q15843 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NEDD8Q15843 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NEDD8Q15843 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NEDD8Q15843 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
NEDD8Q15843 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
NEDD8Q15843 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
NEDD8Q15843 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEDD8Q15843 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEDD8Q15843 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEDD8Q15843 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEDD8Q15843 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEDD8Q15843 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEDD8Q15843 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEDD8Q15843 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEDD8Q15843 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEDD8Q15843 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEDD8Q15843 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEDD8Q15843 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEDD8Q15843 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEDD8Q15843 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEDD8Q15843 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEDD8Q15843 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEDD8Q15843 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEDD8Q15843 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NEDD8Q15843 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NEDD8Q15843 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NEDD8Q15843 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NEDD8Q15843 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NEDD8Q15843 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NEDD8Q15843 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NEDD8Q15843 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NEDD8Q15843 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NEDD8Q15843 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NEDD8Q15843 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NEDD8Q15843 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NEDD8Q15843 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NEDD8Q15843 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NEDD8Q15843 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NEDD8Q15843 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NEDD8Q15843 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NEDD8Q15843 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NEDD8Q15843 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NEDD8Q15843 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NEDD8Q15843 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NEDD8Q15843 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NEDD8Q15843 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NEDD8Q15843 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NEDD8Q15843 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NEDD8Q15843 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NEDD8Q15843 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NEDD8Q15843 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NEDD8Q15843 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NEDD8Q15843 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NEDD8Q15843 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NEDD8Q15843 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NEDD8Q15843 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NEDD8Q15843 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NEDD8Q15843 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NEDD8Q15843 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NEDD8Q15843 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NEDD8Q15843 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NEDD8Q15843 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NEDD8Q15843 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NEDD8Q15843 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NEDD8Q15843 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NEDD8Q15843 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NEDD8Q15843 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NEDD8Q15843 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
NEDD8Q15843 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NEDD8Q15843 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NEDD8Q15843 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NEDD8Q15843 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
NEDD8Q15843 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NEDD8Q15843 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NEDD8Q15843 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NEDD8Q15843 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NEDD8Q15843 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NEDD8Q15843 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
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