Protein–RNA interactions for Protein: Q15572

TAF1C, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1CQ15572 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
TAF1CQ15572 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
TAF1CQ15572 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TAF1CQ15572 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TAF1CQ15572 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TAF1CQ15572 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TAF1CQ15572 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
TAF1CQ15572 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TAF1CQ15572 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TAF1CQ15572 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TAF1CQ15572 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TAF1CQ15572 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TAF1CQ15572 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TAF1CQ15572 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TAF1CQ15572 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TAF1CQ15572 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TAF1CQ15572 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TAF1CQ15572 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TAF1CQ15572 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TAF1CQ15572 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TAF1CQ15572 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TAF1CQ15572 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TAF1CQ15572 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
TAF1CQ15572 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TAF1CQ15572 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TAF1CQ15572 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TAF1CQ15572 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TAF1CQ15572 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TAF1CQ15572 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TAF1CQ15572 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TAF1CQ15572 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TAF1CQ15572 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TAF1CQ15572 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TAF1CQ15572 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TAF1CQ15572 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TAF1CQ15572 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TAF1CQ15572 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TAF1CQ15572 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TAF1CQ15572 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TAF1CQ15572 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TAF1CQ15572 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TAF1CQ15572 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TAF1CQ15572 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TAF1CQ15572 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
TAF1CQ15572 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
TAF1CQ15572 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TAF1CQ15572 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TAF1CQ15572 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TAF1CQ15572 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TAF1CQ15572 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TAF1CQ15572 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TAF1CQ15572 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TAF1CQ15572 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TAF1CQ15572 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
TAF1CQ15572 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TAF1CQ15572 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TAF1CQ15572 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TAF1CQ15572 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TAF1CQ15572 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TAF1CQ15572 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TAF1CQ15572 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TAF1CQ15572 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TAF1CQ15572 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TAF1CQ15572 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TAF1CQ15572 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TAF1CQ15572 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
TAF1CQ15572 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TAF1CQ15572 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TAF1CQ15572 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
TAF1CQ15572 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TAF1CQ15572 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TAF1CQ15572 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TAF1CQ15572 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TAF1CQ15572 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TAF1CQ15572 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TAF1CQ15572 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TAF1CQ15572 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TAF1CQ15572 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TAF1CQ15572 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
TAF1CQ15572 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TAF1CQ15572 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TAF1CQ15572 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TAF1CQ15572 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TAF1CQ15572 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TAF1CQ15572 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TAF1CQ15572 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
TAF1CQ15572 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TAF1CQ15572 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TAF1CQ15572 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TAF1CQ15572 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TAF1CQ15572 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TAF1CQ15572 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TAF1CQ15572 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TAF1CQ15572 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TAF1CQ15572 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TAF1CQ15572 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TAF1CQ15572 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TAF1CQ15572 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TAF1CQ15572 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TAF1CQ15572 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
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