Protein–RNA interactions for Protein: Q15286

RAB35, Ras-related protein Rab-35, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB35Q15286 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAB35Q15286 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
RAB35Q15286 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAB35Q15286 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAB35Q15286 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAB35Q15286 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAB35Q15286 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAB35Q15286 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAB35Q15286 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAB35Q15286 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
RAB35Q15286 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAB35Q15286 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB35Q15286 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB35Q15286 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB35Q15286 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB35Q15286 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB35Q15286 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB35Q15286 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB35Q15286 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB35Q15286 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB35Q15286 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB35Q15286 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB35Q15286 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB35Q15286 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB35Q15286 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB35Q15286 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB35Q15286 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB35Q15286 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB35Q15286 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB35Q15286 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB35Q15286 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB35Q15286 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB35Q15286 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
RAB35Q15286 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
RAB35Q15286 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB35Q15286 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB35Q15286 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB35Q15286 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB35Q15286 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB35Q15286 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB35Q15286 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB35Q15286 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB35Q15286 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB35Q15286 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB35Q15286 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB35Q15286 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB35Q15286 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB35Q15286 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB35Q15286 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB35Q15286 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB35Q15286 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB35Q15286 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB35Q15286 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB35Q15286 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB35Q15286 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB35Q15286 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB35Q15286 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB35Q15286 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB35Q15286 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB35Q15286 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB35Q15286 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB35Q15286 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB35Q15286 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB35Q15286 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB35Q15286 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB35Q15286 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB35Q15286 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB35Q15286 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB35Q15286 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB35Q15286 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB35Q15286 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB35Q15286 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB35Q15286 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB35Q15286 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB35Q15286 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB35Q15286 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB35Q15286 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB35Q15286 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB35Q15286 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB35Q15286 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB35Q15286 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB35Q15286 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB35Q15286 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB35Q15286 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB35Q15286 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB35Q15286 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB35Q15286 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB35Q15286 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB35Q15286 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB35Q15286 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB35Q15286 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB35Q15286 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB35Q15286 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB35Q15286 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
RAB35Q15286 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
RAB35Q15286 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB35Q15286 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB35Q15286 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB35Q15286 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB35Q15286 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms