Protein–RNA interactions for Protein: Q14524

SCN5A, Sodium channel protein type 5 subunit alpha, humanhuman

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Length 2,016 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN5AQ14524 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SCN5AQ14524 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SCN5AQ14524 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
SCN5AQ14524 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SCN5AQ14524 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SCN5AQ14524 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SCN5AQ14524 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCN5AQ14524 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCN5AQ14524 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCN5AQ14524 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCN5AQ14524 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SCN5AQ14524 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SCN5AQ14524 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SCN5AQ14524 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SCN5AQ14524 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SCN5AQ14524 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SCN5AQ14524 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SCN5AQ14524 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SCN5AQ14524 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SCN5AQ14524 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SCN5AQ14524 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SCN5AQ14524 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SCN5AQ14524 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SCN5AQ14524 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SCN5AQ14524 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SCN5AQ14524 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SCN5AQ14524 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SCN5AQ14524 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SCN5AQ14524 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SCN5AQ14524 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SCN5AQ14524 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SCN5AQ14524 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SCN5AQ14524 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SCN5AQ14524 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SCN5AQ14524 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SCN5AQ14524 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SCN5AQ14524 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SCN5AQ14524 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SCN5AQ14524 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
SCN5AQ14524 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SCN5AQ14524 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SCN5AQ14524 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SCN5AQ14524 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SCN5AQ14524 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SCN5AQ14524 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SCN5AQ14524 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SCN5AQ14524 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SCN5AQ14524 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SCN5AQ14524 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SCN5AQ14524 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SCN5AQ14524 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SCN5AQ14524 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SCN5AQ14524 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SCN5AQ14524 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SCN5AQ14524 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SCN5AQ14524 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SCN5AQ14524 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SCN5AQ14524 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SCN5AQ14524 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SCN5AQ14524 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SCN5AQ14524 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SCN5AQ14524 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SCN5AQ14524 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SCN5AQ14524 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCN5AQ14524 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCN5AQ14524 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCN5AQ14524 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCN5AQ14524 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCN5AQ14524 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SCN5AQ14524 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCN5AQ14524 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCN5AQ14524 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SCN5AQ14524 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SCN5AQ14524 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SCN5AQ14524 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SCN5AQ14524 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SCN5AQ14524 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SCN5AQ14524 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SCN5AQ14524 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SCN5AQ14524 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SCN5AQ14524 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SCN5AQ14524 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SCN5AQ14524 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SCN5AQ14524 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SCN5AQ14524 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SCN5AQ14524 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SCN5AQ14524 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SCN5AQ14524 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SCN5AQ14524 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SCN5AQ14524 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SCN5AQ14524 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SCN5AQ14524 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SCN5AQ14524 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SCN5AQ14524 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SCN5AQ14524 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SCN5AQ14524 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SCN5AQ14524 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SCN5AQ14524 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SCN5AQ14524 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SCN5AQ14524 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
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