Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSTF3Q12996 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSTF3Q12996 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSTF3Q12996 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CSTF3Q12996 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSTF3Q12996 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSTF3Q12996 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSTF3Q12996 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSTF3Q12996 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSTF3Q12996 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSTF3Q12996 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSTF3Q12996 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSTF3Q12996 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSTF3Q12996 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CSTF3Q12996 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSTF3Q12996 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CSTF3Q12996 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSTF3Q12996 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSTF3Q12996 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSTF3Q12996 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSTF3Q12996 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSTF3Q12996 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSTF3Q12996 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSTF3Q12996 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSTF3Q12996 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSTF3Q12996 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSTF3Q12996 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSTF3Q12996 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSTF3Q12996 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSTF3Q12996 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSTF3Q12996 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CSTF3Q12996 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSTF3Q12996 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSTF3Q12996 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSTF3Q12996 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSTF3Q12996 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSTF3Q12996 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSTF3Q12996 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSTF3Q12996 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSTF3Q12996 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSTF3Q12996 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSTF3Q12996 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSTF3Q12996 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSTF3Q12996 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSTF3Q12996 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSTF3Q12996 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CSTF3Q12996 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSTF3Q12996 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSTF3Q12996 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CSTF3Q12996 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSTF3Q12996 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSTF3Q12996 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSTF3Q12996 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSTF3Q12996 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSTF3Q12996 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSTF3Q12996 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSTF3Q12996 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSTF3Q12996 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSTF3Q12996 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSTF3Q12996 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSTF3Q12996 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CSTF3Q12996 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSTF3Q12996 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSTF3Q12996 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSTF3Q12996 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSTF3Q12996 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSTF3Q12996 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSTF3Q12996 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSTF3Q12996 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSTF3Q12996 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSTF3Q12996 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CSTF3Q12996 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSTF3Q12996 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSTF3Q12996 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSTF3Q12996 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSTF3Q12996 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSTF3Q12996 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CSTF3Q12996 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSTF3Q12996 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSTF3Q12996 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSTF3Q12996 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSTF3Q12996 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSTF3Q12996 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSTF3Q12996 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSTF3Q12996 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSTF3Q12996 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CSTF3Q12996 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSTF3Q12996 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSTF3Q12996 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSTF3Q12996 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSTF3Q12996 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSTF3Q12996 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSTF3Q12996 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSTF3Q12996 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CSTF3Q12996 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CSTF3Q12996 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CSTF3Q12996 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSTF3Q12996 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSTF3Q12996 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSTF3Q12996 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
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