Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NFIAQ12857 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NFIAQ12857 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
NFIAQ12857 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NFIAQ12857 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
NFIAQ12857 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NFIAQ12857 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NFIAQ12857 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NFIAQ12857 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NFIAQ12857 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NFIAQ12857 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NFIAQ12857 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NFIAQ12857 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NFIAQ12857 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NFIAQ12857 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NFIAQ12857 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NFIAQ12857 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NFIAQ12857 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NFIAQ12857 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NFIAQ12857 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NFIAQ12857 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NFIAQ12857 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NFIAQ12857 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NFIAQ12857 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NFIAQ12857 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NFIAQ12857 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NFIAQ12857 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NFIAQ12857 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NFIAQ12857 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NFIAQ12857 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NFIAQ12857 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
NFIAQ12857 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NFIAQ12857 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NFIAQ12857 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NFIAQ12857 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NFIAQ12857 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
NFIAQ12857 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NFIAQ12857 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NFIAQ12857 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NFIAQ12857 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NFIAQ12857 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NFIAQ12857 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NFIAQ12857 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NFIAQ12857 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NFIAQ12857 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NFIAQ12857 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NFIAQ12857 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NFIAQ12857 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NFIAQ12857 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NFIAQ12857 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
NFIAQ12857 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NFIAQ12857 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NFIAQ12857 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NFIAQ12857 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NFIAQ12857 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NFIAQ12857 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NFIAQ12857 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NFIAQ12857 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NFIAQ12857 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NFIAQ12857 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NFIAQ12857 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NFIAQ12857 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NFIAQ12857 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
NFIAQ12857 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NFIAQ12857 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NFIAQ12857 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NFIAQ12857 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NFIAQ12857 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NFIAQ12857 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NFIAQ12857 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NFIAQ12857 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NFIAQ12857 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
NFIAQ12857 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NFIAQ12857 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NFIAQ12857 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NFIAQ12857 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NFIAQ12857 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NFIAQ12857 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NFIAQ12857 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NFIAQ12857 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NFIAQ12857 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NFIAQ12857 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NFIAQ12857 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NFIAQ12857 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NFIAQ12857 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NFIAQ12857 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NFIAQ12857 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NFIAQ12857 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NFIAQ12857 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NFIAQ12857 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NFIAQ12857 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NFIAQ12857 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NFIAQ12857 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NFIAQ12857 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
NFIAQ12857 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
NFIAQ12857 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NFIAQ12857 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NFIAQ12857 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NFIAQ12857 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NFIAQ12857 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
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