Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
PSME1Q06323 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
PSME1Q06323 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
PSME1Q06323 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
PSME1Q06323 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
PSME1Q06323 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
PSME1Q06323 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
PSME1Q06323 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
PSME1Q06323 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
PSME1Q06323 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
PSME1Q06323 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
PSME1Q06323 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
PSME1Q06323 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
PSME1Q06323 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
PSME1Q06323 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
PSME1Q06323 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
PSME1Q06323 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
PSME1Q06323 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
PSME1Q06323 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
PSME1Q06323 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
PSME1Q06323 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
PSME1Q06323 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
PSME1Q06323 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
PSME1Q06323 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
PSME1Q06323 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
PSME1Q06323 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
PSME1Q06323 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
PSME1Q06323 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
PSME1Q06323 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
PSME1Q06323 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
PSME1Q06323 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
PSME1Q06323 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
PSME1Q06323 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
PSME1Q06323 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
PSME1Q06323 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
PSME1Q06323 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
PSME1Q06323 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
PSME1Q06323 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC32.12■■■□□ 2.73
PSME1Q06323 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
PSME1Q06323 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
PSME1Q06323 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
PSME1Q06323 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
PSME1Q06323 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
PSME1Q06323 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
PSME1Q06323 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
PSME1Q06323 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
PSME1Q06323 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
PSME1Q06323 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
PSME1Q06323 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
PSME1Q06323 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
PSME1Q06323 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
PSME1Q06323 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
PSME1Q06323 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
PSME1Q06323 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
PSME1Q06323 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
PSME1Q06323 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
PSME1Q06323 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
PSME1Q06323 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
PSME1Q06323 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
PSME1Q06323 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
PSME1Q06323 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
PSME1Q06323 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
PSME1Q06323 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
PSME1Q06323 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
PSME1Q06323 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
PSME1Q06323 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
PSME1Q06323 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
PSME1Q06323 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
PSME1Q06323 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
PSME1Q06323 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
PSME1Q06323 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
PSME1Q06323 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
PSME1Q06323 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
PSME1Q06323 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
PSME1Q06323 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
PSME1Q06323 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
PSME1Q06323 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
PSME1Q06323 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
PSME1Q06323 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
PSME1Q06323 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
PSME1Q06323 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
PSME1Q06323 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
PSME1Q06323 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
PSME1Q06323 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
PSME1Q06323 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
PSME1Q06323 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
PSME1Q06323 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
PSME1Q06323 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
PSME1Q06323 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
PSME1Q06323 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC32.03■■■□□ 2.72
PSME1Q06323 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
PSME1Q06323 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
PSME1Q06323 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
PSME1Q06323 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
PSME1Q06323 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
PSME1Q06323 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
PSME1Q06323 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
PSME1Q06323 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
PSME1Q06323 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
PSME1Q06323 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 170.9 ms