Protein–RNA interactions for Protein: Q02447

SP3, Transcription factor Sp3, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP3Q02447 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
SP3Q02447 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SP3Q02447 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SP3Q02447 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SP3Q02447 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SP3Q02447 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SP3Q02447 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SP3Q02447 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SP3Q02447 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
SP3Q02447 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SP3Q02447 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SP3Q02447 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
SP3Q02447 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SP3Q02447 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SP3Q02447 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
SP3Q02447 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SP3Q02447 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SP3Q02447 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SP3Q02447 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SP3Q02447 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
SP3Q02447 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SP3Q02447 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SP3Q02447 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SP3Q02447 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SP3Q02447 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SP3Q02447 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SP3Q02447 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SP3Q02447 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SP3Q02447 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SP3Q02447 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SP3Q02447 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SP3Q02447 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SP3Q02447 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SP3Q02447 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SP3Q02447 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SP3Q02447 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SP3Q02447 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SP3Q02447 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SP3Q02447 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SP3Q02447 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SP3Q02447 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SP3Q02447 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SP3Q02447 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SP3Q02447 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SP3Q02447 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SP3Q02447 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SP3Q02447 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SP3Q02447 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
SP3Q02447 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
SP3Q02447 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SP3Q02447 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SP3Q02447 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SP3Q02447 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SP3Q02447 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SP3Q02447 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SP3Q02447 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SP3Q02447 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SP3Q02447 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SP3Q02447 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SP3Q02447 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SP3Q02447 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SP3Q02447 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
SP3Q02447 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SP3Q02447 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SP3Q02447 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SP3Q02447 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
SP3Q02447 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SP3Q02447 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SP3Q02447 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SP3Q02447 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SP3Q02447 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SP3Q02447 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SP3Q02447 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SP3Q02447 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SP3Q02447 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SP3Q02447 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SP3Q02447 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SP3Q02447 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
SP3Q02447 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SP3Q02447 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SP3Q02447 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SP3Q02447 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SP3Q02447 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
SP3Q02447 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SP3Q02447 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SP3Q02447 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SP3Q02447 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SP3Q02447 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SP3Q02447 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SP3Q02447 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SP3Q02447 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SP3Q02447 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SP3Q02447 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SP3Q02447 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SP3Q02447 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SP3Q02447 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SP3Q02447 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SP3Q02447 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
SP3Q02447 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SP3Q02447 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.4 ms