Protein–RNA interactions for Protein: P55157

MTTP, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTTPP55157 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MTTPP55157 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MTTPP55157 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MTTPP55157 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MTTPP55157 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
MTTPP55157 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MTTPP55157 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MTTPP55157 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MTTPP55157 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MTTPP55157 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MTTPP55157 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MTTPP55157 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MTTPP55157 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MTTPP55157 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MTTPP55157 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
MTTPP55157 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MTTPP55157 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MTTPP55157 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MTTPP55157 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MTTPP55157 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MTTPP55157 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
MTTPP55157 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MTTPP55157 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MTTPP55157 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MTTPP55157 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MTTPP55157 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MTTPP55157 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MTTPP55157 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MTTPP55157 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MTTPP55157 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MTTPP55157 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MTTPP55157 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MTTPP55157 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
MTTPP55157 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MTTPP55157 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MTTPP55157 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MTTPP55157 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MTTPP55157 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MTTPP55157 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MTTPP55157 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MTTPP55157 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MTTPP55157 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MTTPP55157 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MTTPP55157 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MTTPP55157 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MTTPP55157 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MTTPP55157 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MTTPP55157 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MTTPP55157 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MTTPP55157 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MTTPP55157 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MTTPP55157 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MTTPP55157 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MTTPP55157 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MTTPP55157 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MTTPP55157 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MTTPP55157 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
MTTPP55157 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MTTPP55157 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MTTPP55157 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MTTPP55157 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MTTPP55157 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MTTPP55157 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MTTPP55157 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MTTPP55157 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MTTPP55157 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MTTPP55157 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MTTPP55157 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MTTPP55157 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MTTPP55157 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
MTTPP55157 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MTTPP55157 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MTTPP55157 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
MTTPP55157 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MTTPP55157 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MTTPP55157 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MTTPP55157 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MTTPP55157 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MTTPP55157 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MTTPP55157 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MTTPP55157 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
MTTPP55157 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MTTPP55157 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MTTPP55157 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MTTPP55157 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MTTPP55157 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MTTPP55157 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MTTPP55157 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MTTPP55157 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MTTPP55157 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MTTPP55157 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MTTPP55157 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MTTPP55157 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MTTPP55157 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MTTPP55157 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MTTPP55157 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MTTPP55157 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MTTPP55157 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MTTPP55157 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MTTPP55157 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.5 ms