Protein–RNA interactions for Protein: P54219

SLC18A1, Chromaffin granule amine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A1P54219 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC18A1P54219 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC18A1P54219 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC18A1P54219 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC18A1P54219 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC18A1P54219 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC18A1P54219 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC18A1P54219 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC18A1P54219 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC18A1P54219 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC18A1P54219 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC18A1P54219 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC18A1P54219 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC18A1P54219 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC18A1P54219 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC18A1P54219 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC18A1P54219 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC18A1P54219 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC18A1P54219 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC18A1P54219 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC18A1P54219 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC18A1P54219 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC18A1P54219 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC18A1P54219 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC18A1P54219 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC18A1P54219 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC18A1P54219 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC18A1P54219 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC18A1P54219 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC18A1P54219 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC18A1P54219 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC18A1P54219 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC18A1P54219 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC18A1P54219 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC18A1P54219 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC18A1P54219 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC18A1P54219 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC18A1P54219 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC18A1P54219 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC18A1P54219 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC18A1P54219 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC18A1P54219 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC18A1P54219 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC18A1P54219 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC18A1P54219 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC18A1P54219 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC18A1P54219 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC18A1P54219 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC18A1P54219 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC18A1P54219 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC18A1P54219 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC18A1P54219 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC18A1P54219 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC18A1P54219 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC18A1P54219 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC18A1P54219 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC18A1P54219 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC18A1P54219 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLC18A1P54219 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLC18A1P54219 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLC18A1P54219 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLC18A1P54219 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLC18A1P54219 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC18A1P54219 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC18A1P54219 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC18A1P54219 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC18A1P54219 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC18A1P54219 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC18A1P54219 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC18A1P54219 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC18A1P54219 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC18A1P54219 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC18A1P54219 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC18A1P54219 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC18A1P54219 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC18A1P54219 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC18A1P54219 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC18A1P54219 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC18A1P54219 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC18A1P54219 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC18A1P54219 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC18A1P54219 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC18A1P54219 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC18A1P54219 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC18A1P54219 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC18A1P54219 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC18A1P54219 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC18A1P54219 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC18A1P54219 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC18A1P54219 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC18A1P54219 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC18A1P54219 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC18A1P54219 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC18A1P54219 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC18A1P54219 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC18A1P54219 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC18A1P54219 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC18A1P54219 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC18A1P54219 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC18A1P54219 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms