Protein–RNA interactions for Protein: P49765

VEGFB, Vascular endothelial growth factor B, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFBP49765 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
VEGFBP49765 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC27.55■■■□□ 2
VEGFBP49765 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
VEGFBP49765 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC27.55■■■□□ 2
VEGFBP49765 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC27.55■■■□□ 2
VEGFBP49765 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC27.55■■■□□ 2
VEGFBP49765 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC27.55■■■□□ 2
VEGFBP49765 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC27.55■■■□□ 2
VEGFBP49765 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC27.55■■■□□ 2
VEGFBP49765 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC27.55■■■□□ 2
VEGFBP49765 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC27.55■■■□□ 2
VEGFBP49765 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
VEGFBP49765 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
VEGFBP49765 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
VEGFBP49765 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
VEGFBP49765 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
VEGFBP49765 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
VEGFBP49765 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
VEGFBP49765 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
VEGFBP49765 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
VEGFBP49765 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
VEGFBP49765 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
VEGFBP49765 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
VEGFBP49765 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
VEGFBP49765 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
VEGFBP49765 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
VEGFBP49765 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
VEGFBP49765 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
VEGFBP49765 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
VEGFBP49765 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
VEGFBP49765 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
VEGFBP49765 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
VEGFBP49765 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
VEGFBP49765 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
VEGFBP49765 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
VEGFBP49765 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
VEGFBP49765 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
VEGFBP49765 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
VEGFBP49765 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
VEGFBP49765 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
VEGFBP49765 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
VEGFBP49765 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
VEGFBP49765 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
VEGFBP49765 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
VEGFBP49765 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
VEGFBP49765 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
VEGFBP49765 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
VEGFBP49765 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
VEGFBP49765 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
VEGFBP49765 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
VEGFBP49765 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
VEGFBP49765 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
VEGFBP49765 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
VEGFBP49765 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
VEGFBP49765 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
VEGFBP49765 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
VEGFBP49765 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
VEGFBP49765 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
VEGFBP49765 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
VEGFBP49765 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
VEGFBP49765 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
VEGFBP49765 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
VEGFBP49765 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
VEGFBP49765 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
VEGFBP49765 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
VEGFBP49765 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
VEGFBP49765 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
VEGFBP49765 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
VEGFBP49765 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
VEGFBP49765 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
VEGFBP49765 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
VEGFBP49765 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
VEGFBP49765 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
VEGFBP49765 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
VEGFBP49765 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
VEGFBP49765 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
VEGFBP49765 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
VEGFBP49765 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
VEGFBP49765 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
VEGFBP49765 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
VEGFBP49765 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
VEGFBP49765 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
VEGFBP49765 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
VEGFBP49765 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
VEGFBP49765 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
VEGFBP49765 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
VEGFBP49765 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
VEGFBP49765 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
VEGFBP49765 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
VEGFBP49765 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
VEGFBP49765 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
VEGFBP49765 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
VEGFBP49765 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
VEGFBP49765 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
VEGFBP49765 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
VEGFBP49765 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
VEGFBP49765 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
VEGFBP49765 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
VEGFBP49765 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
VEGFBP49765 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117 ms