Protein–RNA interactions for Protein: P48764

SLC9A3, Sodium/hydrogen exchanger 3, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A3P48764 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC9A3P48764 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC9A3P48764 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC9A3P48764 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SLC9A3P48764 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC9A3P48764 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC9A3P48764 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC9A3P48764 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC9A3P48764 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC9A3P48764 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC9A3P48764 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC9A3P48764 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC9A3P48764 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC9A3P48764 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SLC9A3P48764 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC9A3P48764 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC9A3P48764 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC9A3P48764 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC9A3P48764 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC9A3P48764 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC9A3P48764 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC9A3P48764 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC9A3P48764 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC9A3P48764 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC9A3P48764 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC9A3P48764 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC9A3P48764 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC9A3P48764 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC9A3P48764 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC9A3P48764 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC9A3P48764 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC9A3P48764 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC9A3P48764 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC9A3P48764 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC9A3P48764 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC9A3P48764 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC9A3P48764 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC9A3P48764 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC9A3P48764 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC9A3P48764 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC9A3P48764 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC9A3P48764 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC9A3P48764 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC9A3P48764 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC9A3P48764 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC9A3P48764 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC9A3P48764 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC9A3P48764 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC9A3P48764 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC9A3P48764 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC9A3P48764 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC9A3P48764 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC9A3P48764 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC9A3P48764 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC9A3P48764 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC9A3P48764 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC9A3P48764 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC9A3P48764 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC9A3P48764 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC9A3P48764 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC9A3P48764 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC9A3P48764 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC9A3P48764 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC9A3P48764 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC9A3P48764 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC9A3P48764 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC9A3P48764 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC9A3P48764 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC9A3P48764 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC9A3P48764 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC9A3P48764 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC9A3P48764 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC9A3P48764 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC9A3P48764 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC9A3P48764 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC9A3P48764 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC9A3P48764 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC9A3P48764 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC9A3P48764 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC9A3P48764 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC9A3P48764 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC9A3P48764 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC9A3P48764 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC9A3P48764 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC9A3P48764 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC9A3P48764 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC9A3P48764 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC9A3P48764 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC9A3P48764 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC9A3P48764 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC9A3P48764 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC9A3P48764 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC9A3P48764 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC9A3P48764 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC9A3P48764 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC9A3P48764 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC9A3P48764 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC9A3P48764 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC9A3P48764 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC9A3P48764 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.6 ms