Protein–RNA interactions for Protein: P31321

PRKAR1B, cAMP-dependent protein kinase type I-beta regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAR1BP31321 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRKAR1BP31321 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRKAR1BP31321 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRKAR1BP31321 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRKAR1BP31321 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRKAR1BP31321 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRKAR1BP31321 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRKAR1BP31321 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRKAR1BP31321 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRKAR1BP31321 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRKAR1BP31321 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRKAR1BP31321 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PRKAR1BP31321 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRKAR1BP31321 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRKAR1BP31321 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRKAR1BP31321 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRKAR1BP31321 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRKAR1BP31321 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PRKAR1BP31321 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRKAR1BP31321 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PRKAR1BP31321 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRKAR1BP31321 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRKAR1BP31321 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRKAR1BP31321 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRKAR1BP31321 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRKAR1BP31321 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRKAR1BP31321 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PRKAR1BP31321 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PRKAR1BP31321 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRKAR1BP31321 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRKAR1BP31321 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRKAR1BP31321 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRKAR1BP31321 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRKAR1BP31321 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRKAR1BP31321 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRKAR1BP31321 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRKAR1BP31321 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRKAR1BP31321 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRKAR1BP31321 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRKAR1BP31321 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PRKAR1BP31321 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRKAR1BP31321 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRKAR1BP31321 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRKAR1BP31321 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRKAR1BP31321 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRKAR1BP31321 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRKAR1BP31321 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRKAR1BP31321 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRKAR1BP31321 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRKAR1BP31321 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRKAR1BP31321 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRKAR1BP31321 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRKAR1BP31321 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRKAR1BP31321 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRKAR1BP31321 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRKAR1BP31321 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRKAR1BP31321 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRKAR1BP31321 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRKAR1BP31321 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRKAR1BP31321 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRKAR1BP31321 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRKAR1BP31321 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRKAR1BP31321 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRKAR1BP31321 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRKAR1BP31321 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRKAR1BP31321 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PRKAR1BP31321 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRKAR1BP31321 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PRKAR1BP31321 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRKAR1BP31321 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRKAR1BP31321 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRKAR1BP31321 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRKAR1BP31321 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRKAR1BP31321 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRKAR1BP31321 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRKAR1BP31321 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRKAR1BP31321 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRKAR1BP31321 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRKAR1BP31321 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PRKAR1BP31321 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRKAR1BP31321 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRKAR1BP31321 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRKAR1BP31321 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRKAR1BP31321 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRKAR1BP31321 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRKAR1BP31321 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRKAR1BP31321 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PRKAR1BP31321 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRKAR1BP31321 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRKAR1BP31321 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRKAR1BP31321 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRKAR1BP31321 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRKAR1BP31321 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRKAR1BP31321 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRKAR1BP31321 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRKAR1BP31321 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRKAR1BP31321 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRKAR1BP31321 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRKAR1BP31321 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRKAR1BP31321 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms