Protein–RNA interactions for Protein: P29375

KDM5A, Lysine-specific demethylase 5A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5AP29375 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
KDM5AP29375 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
KDM5AP29375 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
KDM5AP29375 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
KDM5AP29375 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
KDM5AP29375 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
KDM5AP29375 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
KDM5AP29375 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
KDM5AP29375 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
KDM5AP29375 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
KDM5AP29375 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
KDM5AP29375 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
KDM5AP29375 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
KDM5AP29375 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
KDM5AP29375 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
KDM5AP29375 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
KDM5AP29375 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
KDM5AP29375 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
KDM5AP29375 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC33.95■■■■□ 3.03
KDM5AP29375 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.02
KDM5AP29375 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
KDM5AP29375 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.02
KDM5AP29375 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
KDM5AP29375 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
KDM5AP29375 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
KDM5AP29375 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
KDM5AP29375 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
KDM5AP29375 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
KDM5AP29375 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
KDM5AP29375 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
KDM5AP29375 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
KDM5AP29375 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
KDM5AP29375 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
KDM5AP29375 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
KDM5AP29375 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
KDM5AP29375 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
KDM5AP29375 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
KDM5AP29375 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
KDM5AP29375 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
KDM5AP29375 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
KDM5AP29375 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
KDM5AP29375 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
KDM5AP29375 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
KDM5AP29375 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
KDM5AP29375 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
KDM5AP29375 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
KDM5AP29375 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
KDM5AP29375 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
KDM5AP29375 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
KDM5AP29375 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
KDM5AP29375 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
KDM5AP29375 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
KDM5AP29375 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
KDM5AP29375 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
KDM5AP29375 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
KDM5AP29375 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
KDM5AP29375 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.01
KDM5AP29375 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
KDM5AP29375 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
KDM5AP29375 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
KDM5AP29375 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
KDM5AP29375 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
KDM5AP29375 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
KDM5AP29375 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
KDM5AP29375 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC33.87■■■■□ 3.01
KDM5AP29375 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
KDM5AP29375 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
KDM5AP29375 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.86■■■■□ 3.01
KDM5AP29375 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
KDM5AP29375 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
KDM5AP29375 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
KDM5AP29375 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
KDM5AP29375 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
KDM5AP29375 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
KDM5AP29375 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
KDM5AP29375 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
KDM5AP29375 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
KDM5AP29375 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
KDM5AP29375 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
KDM5AP29375 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
KDM5AP29375 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
KDM5AP29375 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
KDM5AP29375 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
KDM5AP29375 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC33.84■■■■□ 3.01
KDM5AP29375 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
KDM5AP29375 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
KDM5AP29375 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
KDM5AP29375 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
KDM5AP29375 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
KDM5AP29375 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
KDM5AP29375 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
KDM5AP29375 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
KDM5AP29375 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.81■■■■□ 3
KDM5AP29375 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
KDM5AP29375 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
KDM5AP29375 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
KDM5AP29375 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
KDM5AP29375 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
KDM5AP29375 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
KDM5AP29375 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC33.8■■■■□ 3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms