Protein–RNA interactions for Protein: P26368

U2AF2, Splicing factor U2AF 65 kDa subunit, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2AF2P26368 SPIRE1-213ENST00000592156 863 ntTSL 34.03□□□□□ -1.768e-9■■■■■ 32.9
U2AF2P26368 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.98e-8■■■■■ 32.8
U2AF2P26368 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.868e-8■■■■■ 32.8
U2AF2P26368 TRAM1-203ENST00000520700 542 ntTSL 519.89■□□□□ 0.778e-8■■■■■ 32.8
U2AF2P26368 TRAM1-204ENST00000521049 872 ntTSL 517.84■□□□□ 0.458e-8■■■■■ 32.8
U2AF2P26368 YLPM1-203ENST00000547879 2316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)4.95□□□□□ -1.628e-8■■■■■ 32.8
U2AF2P26368 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.423e-11■■■■■ 32.8
U2AF2P26368 CREB3L2-201ENST00000330387 7412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.73e-11■■■■■ 32.8
U2AF2P26368 CREB3L2-207ENST00000616381 7133 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.733e-11■■■■■ 32.8
U2AF2P26368 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.779e-27■■■■■ 32.8
U2AF2P26368 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.499e-27■■■■■ 32.8
U2AF2P26368 C6orf106-201ENST00000374021 916 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.24□□□□□ -1.099e-27■■■■■ 32.8
U2AF2P26368 HSPA8-211ENST00000527983 1509 ntTSL 1 (best)13.4□□□□□ -0.262e-17■■■■■ 32.8
U2AF2P26368 WDR73-208ENST00000559126 2031 ntTSL 222.31■■□□□ 1.161e-7■■■■■ 32.8
U2AF2P26368 WDR73-213ENST00000559994 2063 ntTSL 517.83■□□□□ 0.451e-7■■■■■ 32.8
U2AF2P26368 WDR73-207ENST00000559015 2140 ntTSL 217.59■□□□□ 0.411e-7■■■■■ 32.8
U2AF2P26368 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.354e-15■■■■■ 32.8
U2AF2P26368 WDR73-206ENST00000558608 2154 ntTSL 216.97■□□□□ 0.311e-7■■■■■ 32.8
U2AF2P26368 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.164e-15■■■■■ 32.8
U2AF2P26368 WDR73-201ENST00000398528 1915 ntTSL 1 (best)15.86■□□□□ 0.131e-7■■■■■ 32.8
U2AF2P26368 WDR73-218ENST00000560966 5071 ntTSL 215.64■□□□□ 0.091e-7■■■■■ 32.8
U2AF2P26368 WDR73-202ENST00000434634 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.111e-7■■■■■ 32.8
U2AF2P26368 ZNF800-202ENST00000393312 2375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.194e-15■■■■■ 32.8
U2AF2P26368 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.457e-8■■■■■ 32.8
U2AF2P26368 KIFC3-213ENST00000563028 681 ntTSL 426.11■■□□□ 1.774e-7■■■■■ 32.8
U2AF2P26368 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.277e-8■■■■■ 32.8
U2AF2P26368 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.197e-8■■■■■ 32.8
U2AF2P26368 ATRAID-202ENST00000405489 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.037e-8■■■■■ 32.8
U2AF2P26368 ATRAID-204ENST00000472515 561 ntTSL 24.5□□□□□ -1.697e-8■■■■■ 32.8
U2AF2P26368 ZNF841-203ENST00000594295 3819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.992e-24■■■■■ 32.7
U2AF2P26368 EIF3B-203ENST00000413917 962 ntTSL 222.73■■□□□ 1.233e-8■■■■■ 32.7
U2AF2P26368 WDR73-205ENST00000558521 997 ntTSL 319.44■□□□□ 0.71e-7■■■■■ 32.7
U2AF2P26368 WDR73-210ENST00000559224 788 ntTSL 519.44■□□□□ 0.71e-7■■■■■ 32.7
U2AF2P26368 WDR73-211ENST00000559452 1240 ntTSL 316.93■□□□□ 0.31e-7■■■■■ 32.7
U2AF2P26368 WDR73-219ENST00000561329 1007 ntTSL 212.37□□□□□ -0.431e-7■■■■■ 32.7
U2AF2P26368 WDR73-217ENST00000560835 582 ntTSL 210.76□□□□□ -0.691e-7■■■■■ 32.7
U2AF2P26368 WDR73-209ENST00000559178 933 ntTSL 310.4□□□□□ -0.741e-7■■■■■ 32.7
U2AF2P26368 WDR73-214ENST00000560088 526 ntTSL 310.24□□□□□ -0.771e-7■■■■■ 32.7
U2AF2P26368 WDR73-221ENST00000561447 560 ntTSL 49.88□□□□□ -0.831e-7■■■■■ 32.7
U2AF2P26368 KATNBL1-217ENST00000561371 555 ntTSL 413.52□□□□□ -0.251e-9■■■■■ 32.7
U2AF2P26368 HERC1-204ENST00000559715 495 ntTSL 212.16□□□□□ -0.462e-16■■■■■ 32.7
U2AF2P26368 KIAA0100-202ENST00000528896 7407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.72e-11■■■■■ 32.7
U2AF2P26368 KIAA0100-201ENST00000389003 6852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.932e-11■■■■■ 32.7
U2AF2P26368 KIAA0100-203ENST00000544884 6856 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.952e-11■■■■■ 32.7
U2AF2P26368 UBR3-209ENST00000477461 595 ntTSL 43.83□□□□□ -1.84e-14■■■■■ 32.6
U2AF2P26368 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.921e-7■■■■■ 32.6
U2AF2P26368 UBP1-205ENST00000456378 581 ntTSL 426.59■■□□□ 1.851e-7■■■■■ 32.6
U2AF2P26368 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.811e-7■■■■■ 32.6
U2AF2P26368 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.751e-7■■■■■ 32.6
U2AF2P26368 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.751e-7■■■■■ 32.6
U2AF2P26368 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.621e-7■■■■■ 32.6
U2AF2P26368 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.231e-7■■■■■ 32.6
U2AF2P26368 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.941e-7■■■■■ 32.6
U2AF2P26368 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.941e-7■■■■■ 32.6
U2AF2P26368 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.931e-7■■■■■ 32.6
U2AF2P26368 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.881e-7■■■■■ 32.6
U2AF2P26368 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.821e-7■■■■■ 32.6
U2AF2P26368 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.771e-7■■■■■ 32.6
U2AF2P26368 AP3D1-211ENST00000591650 1437 ntTSL 1 (best)19.73■□□□□ 0.751e-7■■■■■ 32.6
U2AF2P26368 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.661e-7■■■■■ 32.6
U2AF2P26368 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.651e-7■■■■■ 32.6
U2AF2P26368 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.631e-7■■■■■ 32.6
U2AF2P26368 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.631e-7■■■■■ 32.6
U2AF2P26368 AP3D1-207ENST00000589369 618 ntTSL 318.83■□□□□ 0.61e-7■■■■■ 32.6
U2AF2P26368 IRF3-219ENST00000597636 2874 ntTSL 518.58■□□□□ 0.561e-7■■■■■ 32.6
U2AF2P26368 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.561e-7■■■■■ 32.6
U2AF2P26368 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.51e-7■■■■■ 32.6
U2AF2P26368 IRF3-211ENST00000596644 550 ntTSL 216.89■□□□□ 0.291e-7■■■■■ 32.6
U2AF2P26368 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.171e-7■■■■■ 32.6
U2AF2P26368 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.141e-7■■■■■ 32.6
U2AF2P26368 IRF3-224ENST00000599680 472 ntTSL 315.95■□□□□ 0.141e-7■■■■■ 32.6
U2AF2P26368 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.11e-7■■■■■ 32.6
U2AF2P26368 SMIM14-201ENST00000295958 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.061e-7■■■■■ 32.6
U2AF2P26368 NMRAL2P-204ENST00000423298 1792 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.046e-7■■■■■ 32.6
U2AF2P26368 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.021e-7■■■■■ 32.6
U2AF2P26368 CASP8-215ENST00000444430 1275 ntTSL 515.13■□□□□ 0.011e-7■■■■■ 32.6
U2AF2P26368 IRF3-213ENST00000596765 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.011e-7■■■■■ 32.6
U2AF2P26368 RAPGEF1-204ENST00000414781 957 ntTSL 515.07■□□□□ 01e-7■■■■■ 32.6
U2AF2P26368 IRF3-212ENST00000596756 931 ntTSL 514.96□□□□□ -0.011e-7■■■■■ 32.6
U2AF2P26368 RAPGEF1-201ENST00000372189 6085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.041e-7■■■■■ 32.6
U2AF2P26368 AP3D1-203ENST00000585652 4433 ntTSL 214.65□□□□□ -0.061e-7■■■■■ 32.6
U2AF2P26368 SMIM14-205ENST00000511809 830 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.151e-7■■■■■ 32.6
U2AF2P26368 SMIM14-202ENST00000505729 612 ntTSL 413.93□□□□□ -0.181e-7■■■■■ 32.6
U2AF2P26368 AP3D1-206ENST00000589223 3357 ntTSL 213.89□□□□□ -0.191e-7■■■■■ 32.6
U2AF2P26368 KNOP1-204ENST00000567367 595 ntAPPRIS ALT2 TSL 313.32□□□□□ -0.281e-7■■■■■ 32.6
U2AF2P26368 CHD7-207ENST00000527921 527 ntTSL 413.25□□□□□ -0.291e-7■■■■■ 32.6
U2AF2P26368 THOC5-204ENST00000397873 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.31e-7■■■■■ 32.6
U2AF2P26368 TMEM9B-AS1-202ENST00000532599 615 ntTSL 312.43□□□□□ -0.421e-7■■■■■ 32.6
U2AF2P26368 KNOP1-201ENST00000219837 6432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.461e-7■■■■■ 32.6
U2AF2P26368 NMRAL2P-201ENST00000306399 891 ntBASIC12.11□□□□□ -0.476e-7■■■■■ 32.6
U2AF2P26368 COA4-205ENST00000544575 449 ntTSL 311.77□□□□□ -0.534e-14■■■■■ 32.6
U2AF2P26368 THOC5-201ENST00000358079 2427 ntTSL 511.77□□□□□ -0.531e-7■■■■■ 32.6
U2AF2P26368 THOC5-210ENST00000443089 786 ntTSL 211.67□□□□□ -0.541e-7■■■■■ 32.6
U2AF2P26368 COA4-201ENST00000355693 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.554e-14■■■■■ 32.6
U2AF2P26368 MYO9A-201ENST00000356056 12411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.581e-7■■■■■ 32.6
U2AF2P26368 COA4-202ENST00000537289 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.64e-14■■■■■ 32.6
U2AF2P26368 COA4-206ENST00000545127 922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.674e-14■■■■■ 32.6
U2AF2P26368 COA4-203ENST00000537581 566 ntTSL 410.26□□□□□ -0.774e-14■■■■■ 32.6
U2AF2P26368 CNST-201ENST00000366511 645 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.81e-7■■■■■ 32.6
U2AF2P26368 CASP8-205ENST00000358485 2930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.811e-7■■■■■ 32.6
Retrieved 100 of 36,523 protein–RNA pairs in 411 ms