Protein–RNA interactions for Protein: P08034

GJB1, Gap junction beta-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB1P08034 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GJB1P08034 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GJB1P08034 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GJB1P08034 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
GJB1P08034 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GJB1P08034 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GJB1P08034 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GJB1P08034 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GJB1P08034 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GJB1P08034 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GJB1P08034 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GJB1P08034 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
GJB1P08034 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GJB1P08034 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GJB1P08034 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GJB1P08034 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GJB1P08034 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GJB1P08034 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GJB1P08034 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GJB1P08034 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GJB1P08034 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GJB1P08034 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
GJB1P08034 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GJB1P08034 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GJB1P08034 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GJB1P08034 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
GJB1P08034 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GJB1P08034 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GJB1P08034 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GJB1P08034 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GJB1P08034 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
GJB1P08034 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
GJB1P08034 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
GJB1P08034 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
GJB1P08034 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
GJB1P08034 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
GJB1P08034 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
GJB1P08034 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
GJB1P08034 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
GJB1P08034 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
GJB1P08034 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GJB1P08034 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GJB1P08034 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GJB1P08034 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GJB1P08034 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GJB1P08034 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GJB1P08034 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GJB1P08034 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GJB1P08034 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GJB1P08034 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GJB1P08034 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GJB1P08034 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GJB1P08034 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GJB1P08034 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
GJB1P08034 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GJB1P08034 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GJB1P08034 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GJB1P08034 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GJB1P08034 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GJB1P08034 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GJB1P08034 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GJB1P08034 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GJB1P08034 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
GJB1P08034 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GJB1P08034 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GJB1P08034 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
GJB1P08034 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GJB1P08034 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GJB1P08034 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GJB1P08034 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GJB1P08034 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GJB1P08034 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GJB1P08034 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GJB1P08034 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
GJB1P08034 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GJB1P08034 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GJB1P08034 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GJB1P08034 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GJB1P08034 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GJB1P08034 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GJB1P08034 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GJB1P08034 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GJB1P08034 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GJB1P08034 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GJB1P08034 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GJB1P08034 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GJB1P08034 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GJB1P08034 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GJB1P08034 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GJB1P08034 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
GJB1P08034 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
GJB1P08034 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GJB1P08034 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GJB1P08034 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GJB1P08034 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GJB1P08034 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GJB1P08034 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GJB1P08034 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
GJB1P08034 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GJB1P08034 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.8 ms