Protein–RNA interactions for Protein: P05106

ITGB3, Integrin beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3P05106 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ITGB3P05106 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ITGB3P05106 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ITGB3P05106 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ITGB3P05106 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ITGB3P05106 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ITGB3P05106 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ITGB3P05106 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
ITGB3P05106 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ITGB3P05106 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ITGB3P05106 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ITGB3P05106 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ITGB3P05106 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ITGB3P05106 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
ITGB3P05106 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ITGB3P05106 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ITGB3P05106 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ITGB3P05106 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ITGB3P05106 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ITGB3P05106 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
ITGB3P05106 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
ITGB3P05106 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ITGB3P05106 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ITGB3P05106 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ITGB3P05106 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ITGB3P05106 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ITGB3P05106 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ITGB3P05106 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ITGB3P05106 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ITGB3P05106 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ITGB3P05106 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
ITGB3P05106 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ITGB3P05106 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
ITGB3P05106 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ITGB3P05106 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ITGB3P05106 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ITGB3P05106 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ITGB3P05106 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ITGB3P05106 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ITGB3P05106 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ITGB3P05106 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ITGB3P05106 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ITGB3P05106 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ITGB3P05106 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ITGB3P05106 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ITGB3P05106 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ITGB3P05106 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ITGB3P05106 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
ITGB3P05106 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ITGB3P05106 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ITGB3P05106 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ITGB3P05106 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ITGB3P05106 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ITGB3P05106 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ITGB3P05106 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ITGB3P05106 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ITGB3P05106 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ITGB3P05106 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
ITGB3P05106 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ITGB3P05106 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ITGB3P05106 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ITGB3P05106 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ITGB3P05106 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
ITGB3P05106 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ITGB3P05106 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ITGB3P05106 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ITGB3P05106 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ITGB3P05106 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ITGB3P05106 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ITGB3P05106 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ITGB3P05106 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ITGB3P05106 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ITGB3P05106 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ITGB3P05106 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ITGB3P05106 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
ITGB3P05106 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
ITGB3P05106 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ITGB3P05106 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ITGB3P05106 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ITGB3P05106 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ITGB3P05106 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
ITGB3P05106 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ITGB3P05106 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
ITGB3P05106 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
ITGB3P05106 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ITGB3P05106 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ITGB3P05106 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ITGB3P05106 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ITGB3P05106 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ITGB3P05106 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ITGB3P05106 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ITGB3P05106 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ITGB3P05106 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ITGB3P05106 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ITGB3P05106 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ITGB3P05106 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ITGB3P05106 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ITGB3P05106 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ITGB3P05106 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ITGB3P05106 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms