Protein–RNA interactions for Protein: P03372

ESR1, Estrogen receptor, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ESR1P03372 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ESR1P03372 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ESR1P03372 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ESR1P03372 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ESR1P03372 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ESR1P03372 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ESR1P03372 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ESR1P03372 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ESR1P03372 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ESR1P03372 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ESR1P03372 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ESR1P03372 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ESR1P03372 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ESR1P03372 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ESR1P03372 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ESR1P03372 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ESR1P03372 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ESR1P03372 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ESR1P03372 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ESR1P03372 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ESR1P03372 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ESR1P03372 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ESR1P03372 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ESR1P03372 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ESR1P03372 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ESR1P03372 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ESR1P03372 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ESR1P03372 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ESR1P03372 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ESR1P03372 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ESR1P03372 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ESR1P03372 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ESR1P03372 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ESR1P03372 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ESR1P03372 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ESR1P03372 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ESR1P03372 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ESR1P03372 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ESR1P03372 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ESR1P03372 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ESR1P03372 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ESR1P03372 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ESR1P03372 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ESR1P03372 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ESR1P03372 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ESR1P03372 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ESR1P03372 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ESR1P03372 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ESR1P03372 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ESR1P03372 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ESR1P03372 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ESR1P03372 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ESR1P03372 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ESR1P03372 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ESR1P03372 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ESR1P03372 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ESR1P03372 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ESR1P03372 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ESR1P03372 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ESR1P03372 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ESR1P03372 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ESR1P03372 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ESR1P03372 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ESR1P03372 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ESR1P03372 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ESR1P03372 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ESR1P03372 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ESR1P03372 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ESR1P03372 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ESR1P03372 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ESR1P03372 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ESR1P03372 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ESR1P03372 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ESR1P03372 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ESR1P03372 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ESR1P03372 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ESR1P03372 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ESR1P03372 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ESR1P03372 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ESR1P03372 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ESR1P03372 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ESR1P03372 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
ESR1P03372 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ESR1P03372 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ESR1P03372 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ESR1P03372 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ESR1P03372 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ESR1P03372 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ESR1P03372 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ESR1P03372 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ESR1P03372 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ESR1P03372 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ESR1P03372 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ESR1P03372 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ESR1P03372 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ESR1P03372 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ESR1P03372 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ESR1P03372 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ESR1P03372 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ESR1P03372 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.3 ms