Protein–RNA interactions for Protein: F8W1W9

NPIPB9, Nuclear pore complex-interacting protein family member B9, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB9F8W1W9 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NPIPB9F8W1W9 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NPIPB9F8W1W9 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NPIPB9F8W1W9 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NPIPB9F8W1W9 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NPIPB9F8W1W9 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NPIPB9F8W1W9 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NPIPB9F8W1W9 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NPIPB9F8W1W9 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NPIPB9F8W1W9 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NPIPB9F8W1W9 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NPIPB9F8W1W9 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NPIPB9F8W1W9 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NPIPB9F8W1W9 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
NPIPB9F8W1W9 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NPIPB9F8W1W9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NPIPB9F8W1W9 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NPIPB9F8W1W9 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NPIPB9F8W1W9 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NPIPB9F8W1W9 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NPIPB9F8W1W9 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NPIPB9F8W1W9 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NPIPB9F8W1W9 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NPIPB9F8W1W9 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
NPIPB9F8W1W9 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NPIPB9F8W1W9 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NPIPB9F8W1W9 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NPIPB9F8W1W9 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NPIPB9F8W1W9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NPIPB9F8W1W9 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NPIPB9F8W1W9 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NPIPB9F8W1W9 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
NPIPB9F8W1W9 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NPIPB9F8W1W9 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NPIPB9F8W1W9 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NPIPB9F8W1W9 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NPIPB9F8W1W9 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NPIPB9F8W1W9 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NPIPB9F8W1W9 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NPIPB9F8W1W9 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NPIPB9F8W1W9 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NPIPB9F8W1W9 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NPIPB9F8W1W9 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NPIPB9F8W1W9 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NPIPB9F8W1W9 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NPIPB9F8W1W9 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NPIPB9F8W1W9 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NPIPB9F8W1W9 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NPIPB9F8W1W9 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NPIPB9F8W1W9 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NPIPB9F8W1W9 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NPIPB9F8W1W9 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NPIPB9F8W1W9 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NPIPB9F8W1W9 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NPIPB9F8W1W9 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NPIPB9F8W1W9 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NPIPB9F8W1W9 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NPIPB9F8W1W9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NPIPB9F8W1W9 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NPIPB9F8W1W9 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NPIPB9F8W1W9 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NPIPB9F8W1W9 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NPIPB9F8W1W9 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NPIPB9F8W1W9 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NPIPB9F8W1W9 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NPIPB9F8W1W9 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NPIPB9F8W1W9 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NPIPB9F8W1W9 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NPIPB9F8W1W9 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NPIPB9F8W1W9 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NPIPB9F8W1W9 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NPIPB9F8W1W9 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NPIPB9F8W1W9 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NPIPB9F8W1W9 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NPIPB9F8W1W9 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NPIPB9F8W1W9 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NPIPB9F8W1W9 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NPIPB9F8W1W9 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NPIPB9F8W1W9 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NPIPB9F8W1W9 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NPIPB9F8W1W9 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NPIPB9F8W1W9 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NPIPB9F8W1W9 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NPIPB9F8W1W9 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NPIPB9F8W1W9 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NPIPB9F8W1W9 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NPIPB9F8W1W9 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NPIPB9F8W1W9 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NPIPB9F8W1W9 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NPIPB9F8W1W9 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NPIPB9F8W1W9 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NPIPB9F8W1W9 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NPIPB9F8W1W9 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NPIPB9F8W1W9 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NPIPB9F8W1W9 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NPIPB9F8W1W9 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NPIPB9F8W1W9 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NPIPB9F8W1W9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NPIPB9F8W1W9 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NPIPB9F8W1W9 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms