Protein–RNA interactions for Protein: A6PVS8

LRRIQ3, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ3A6PVS8 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRRIQ3A6PVS8 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRRIQ3A6PVS8 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRRIQ3A6PVS8 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRRIQ3A6PVS8 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRRIQ3A6PVS8 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRRIQ3A6PVS8 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRRIQ3A6PVS8 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRRIQ3A6PVS8 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRRIQ3A6PVS8 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRRIQ3A6PVS8 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRRIQ3A6PVS8 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRRIQ3A6PVS8 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRIQ3A6PVS8 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRIQ3A6PVS8 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRIQ3A6PVS8 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRIQ3A6PVS8 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRIQ3A6PVS8 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRIQ3A6PVS8 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRIQ3A6PVS8 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRIQ3A6PVS8 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRIQ3A6PVS8 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRIQ3A6PVS8 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRIQ3A6PVS8 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRIQ3A6PVS8 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRIQ3A6PVS8 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRIQ3A6PVS8 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRIQ3A6PVS8 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRIQ3A6PVS8 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRIQ3A6PVS8 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRIQ3A6PVS8 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRIQ3A6PVS8 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRIQ3A6PVS8 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRIQ3A6PVS8 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRIQ3A6PVS8 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRIQ3A6PVS8 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRIQ3A6PVS8 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRIQ3A6PVS8 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRIQ3A6PVS8 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRIQ3A6PVS8 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRIQ3A6PVS8 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRIQ3A6PVS8 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRIQ3A6PVS8 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRIQ3A6PVS8 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRIQ3A6PVS8 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRIQ3A6PVS8 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRIQ3A6PVS8 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRIQ3A6PVS8 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRIQ3A6PVS8 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRIQ3A6PVS8 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRRIQ3A6PVS8 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRRIQ3A6PVS8 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRRIQ3A6PVS8 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRRIQ3A6PVS8 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRRIQ3A6PVS8 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRRIQ3A6PVS8 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRRIQ3A6PVS8 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRIQ3A6PVS8 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRIQ3A6PVS8 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRIQ3A6PVS8 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRIQ3A6PVS8 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRIQ3A6PVS8 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRIQ3A6PVS8 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRIQ3A6PVS8 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRIQ3A6PVS8 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRIQ3A6PVS8 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRIQ3A6PVS8 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRIQ3A6PVS8 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRIQ3A6PVS8 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRIQ3A6PVS8 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRIQ3A6PVS8 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRIQ3A6PVS8 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRIQ3A6PVS8 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRIQ3A6PVS8 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRIQ3A6PVS8 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRIQ3A6PVS8 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRIQ3A6PVS8 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRIQ3A6PVS8 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRIQ3A6PVS8 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRIQ3A6PVS8 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRIQ3A6PVS8 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRIQ3A6PVS8 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRIQ3A6PVS8 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRIQ3A6PVS8 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRIQ3A6PVS8 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRIQ3A6PVS8 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRIQ3A6PVS8 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRIQ3A6PVS8 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRIQ3A6PVS8 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRIQ3A6PVS8 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRIQ3A6PVS8 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
LRRIQ3A6PVS8 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRIQ3A6PVS8 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRIQ3A6PVS8 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRIQ3A6PVS8 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRIQ3A6PVS8 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRIQ3A6PVS8 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRIQ3A6PVS8 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRIQ3A6PVS8 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRIQ3A6PVS8 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms