Protein–RNA interactions for Protein: A6NF36

CCDC182, Coiled-coil domain-containing protein 182, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC182A6NF36 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC182A6NF36 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC182A6NF36 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC182A6NF36 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC182A6NF36 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC182A6NF36 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC182A6NF36 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC182A6NF36 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC182A6NF36 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC182A6NF36 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC182A6NF36 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC182A6NF36 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC182A6NF36 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC182A6NF36 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC182A6NF36 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC182A6NF36 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC182A6NF36 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC182A6NF36 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC182A6NF36 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC182A6NF36 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC182A6NF36 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC182A6NF36 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC182A6NF36 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC182A6NF36 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC182A6NF36 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC182A6NF36 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC182A6NF36 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC182A6NF36 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC182A6NF36 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC182A6NF36 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC182A6NF36 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC182A6NF36 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC182A6NF36 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC182A6NF36 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC182A6NF36 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC182A6NF36 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC182A6NF36 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC182A6NF36 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC182A6NF36 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC182A6NF36 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC182A6NF36 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC182A6NF36 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC182A6NF36 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC182A6NF36 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC182A6NF36 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC182A6NF36 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC182A6NF36 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC182A6NF36 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC182A6NF36 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC182A6NF36 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC182A6NF36 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC182A6NF36 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC182A6NF36 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC182A6NF36 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC182A6NF36 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC182A6NF36 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC182A6NF36 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC182A6NF36 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC182A6NF36 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC182A6NF36 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC182A6NF36 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC182A6NF36 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC182A6NF36 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC182A6NF36 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC182A6NF36 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
CCDC182A6NF36 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC182A6NF36 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC182A6NF36 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC182A6NF36 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC182A6NF36 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC182A6NF36 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC182A6NF36 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC182A6NF36 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC182A6NF36 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC182A6NF36 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC182A6NF36 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC182A6NF36 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC182A6NF36 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC182A6NF36 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC182A6NF36 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC182A6NF36 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC182A6NF36 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC182A6NF36 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC182A6NF36 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC182A6NF36 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC182A6NF36 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC182A6NF36 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC182A6NF36 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC182A6NF36 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC182A6NF36 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC182A6NF36 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC182A6NF36 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC182A6NF36 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC182A6NF36 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC182A6NF36 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC182A6NF36 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC182A6NF36 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC182A6NF36 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC182A6NF36 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC182A6NF36 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.6 ms