Protein–RNA interactions for Protein: A4QN01

LINC01553, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01553, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01553A4QN01 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LINC01553A4QN01 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
LINC01553A4QN01 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LINC01553A4QN01 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LINC01553A4QN01 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LINC01553A4QN01 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LINC01553A4QN01 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
LINC01553A4QN01 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LINC01553A4QN01 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
LINC01553A4QN01 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
LINC01553A4QN01 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LINC01553A4QN01 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LINC01553A4QN01 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LINC01553A4QN01 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LINC01553A4QN01 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LINC01553A4QN01 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LINC01553A4QN01 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LINC01553A4QN01 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LINC01553A4QN01 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LINC01553A4QN01 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LINC01553A4QN01 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LINC01553A4QN01 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LINC01553A4QN01 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LINC01553A4QN01 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LINC01553A4QN01 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
LINC01553A4QN01 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LINC01553A4QN01 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LINC01553A4QN01 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LINC01553A4QN01 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LINC01553A4QN01 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LINC01553A4QN01 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LINC01553A4QN01 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LINC01553A4QN01 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LINC01553A4QN01 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LINC01553A4QN01 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
LINC01553A4QN01 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LINC01553A4QN01 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LINC01553A4QN01 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LINC01553A4QN01 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LINC01553A4QN01 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LINC01553A4QN01 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LINC01553A4QN01 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LINC01553A4QN01 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LINC01553A4QN01 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LINC01553A4QN01 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LINC01553A4QN01 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LINC01553A4QN01 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LINC01553A4QN01 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
LINC01553A4QN01 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LINC01553A4QN01 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
LINC01553A4QN01 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LINC01553A4QN01 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LINC01553A4QN01 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LINC01553A4QN01 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LINC01553A4QN01 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
LINC01553A4QN01 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LINC01553A4QN01 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LINC01553A4QN01 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LINC01553A4QN01 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LINC01553A4QN01 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LINC01553A4QN01 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LINC01553A4QN01 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LINC01553A4QN01 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LINC01553A4QN01 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LINC01553A4QN01 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LINC01553A4QN01 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
LINC01553A4QN01 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
LINC01553A4QN01 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LINC01553A4QN01 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LINC01553A4QN01 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LINC01553A4QN01 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LINC01553A4QN01 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LINC01553A4QN01 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LINC01553A4QN01 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LINC01553A4QN01 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LINC01553A4QN01 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LINC01553A4QN01 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LINC01553A4QN01 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LINC01553A4QN01 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LINC01553A4QN01 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LINC01553A4QN01 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
LINC01553A4QN01 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LINC01553A4QN01 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LINC01553A4QN01 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LINC01553A4QN01 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LINC01553A4QN01 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
LINC01553A4QN01 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LINC01553A4QN01 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LINC01553A4QN01 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LINC01553A4QN01 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LINC01553A4QN01 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LINC01553A4QN01 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LINC01553A4QN01 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
LINC01553A4QN01 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LINC01553A4QN01 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LINC01553A4QN01 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LINC01553A4QN01 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LINC01553A4QN01 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LINC01553A4QN01 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LINC01553A4QN01 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms