Protein–RNA interactions for Protein: A0A088AWK7

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A088AWK7 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
A0A088AWK7 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
A0A088AWK7 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
A0A088AWK7 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
A0A088AWK7 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
A0A088AWK7 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
A0A088AWK7 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
A0A088AWK7 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
A0A088AWK7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
A0A088AWK7 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
A0A088AWK7 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
A0A088AWK7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
A0A088AWK7 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
A0A088AWK7 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
A0A088AWK7 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
A0A088AWK7 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
A0A088AWK7 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
A0A088AWK7 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
A0A088AWK7 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
A0A088AWK7 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
A0A088AWK7 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
A0A088AWK7 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
A0A088AWK7 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
A0A088AWK7 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
A0A088AWK7 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
A0A088AWK7 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
A0A088AWK7 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
A0A088AWK7 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
A0A088AWK7 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
A0A088AWK7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
A0A088AWK7 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
A0A088AWK7 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
A0A088AWK7 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
A0A088AWK7 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
A0A088AWK7 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
A0A088AWK7 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
A0A088AWK7 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
A0A088AWK7 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
A0A088AWK7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
A0A088AWK7 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
A0A088AWK7 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
A0A088AWK7 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A088AWK7 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A088AWK7 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A088AWK7 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A088AWK7 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A088AWK7 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A088AWK7 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A088AWK7 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A088AWK7 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A088AWK7 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A088AWK7 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A088AWK7 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A088AWK7 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A088AWK7 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A088AWK7 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A088AWK7 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A088AWK7 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A088AWK7 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A088AWK7 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A088AWK7 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
A0A088AWK7 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
A0A088AWK7 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
A0A088AWK7 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
A0A088AWK7 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
A0A088AWK7 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
A0A088AWK7 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
A0A088AWK7 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
A0A088AWK7 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
A0A088AWK7 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A088AWK7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A088AWK7 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A088AWK7 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A088AWK7 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A088AWK7 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A088AWK7 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A088AWK7 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A088AWK7 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A088AWK7 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
A0A088AWK7 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
A0A088AWK7 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
A0A088AWK7 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
A0A088AWK7 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A088AWK7 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A088AWK7 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A088AWK7 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A088AWK7 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A088AWK7 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A088AWK7 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A088AWK7 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A088AWK7 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A088AWK7 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A088AWK7 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A088AWK7 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A088AWK7 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A088AWK7 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A088AWK7 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A088AWK7 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A088AWK7 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A088AWK7 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms