Protein–RNA interactions for Protein: O43172

PRPF4, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4O43172 TBC1D9B-216ENST00000522224 532 ntTSL 517.43■□□□□ 0.389e-6■□□□□ 8.2
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PRPF4O43172 DOT1L-207ENST00000586024 725 ntTSL 317.35■□□□□ 0.379e-6■□□□□ 8.2
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PRPF4O43172 STX16-206ENST00000371132 4552 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.731e-30■□□□□ 8.2
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PRPF4O43172 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.532e-7■□□□□ 8.2
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PRPF4O43172 ABCC3-201ENST00000285238 5716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.312e-7■□□□□ 8.2
PRPF4O43172 ABCC3-207ENST00000505699 5271 ntTSL 212.84□□□□□ -0.352e-7■□□□□ 8.2
PRPF4O43172 ABCC3-203ENST00000502426 5326 ntTSL 212.83□□□□□ -0.352e-7■□□□□ 8.2
PRPF4O43172 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.622e-6■□□□□ 8.2
PRPF4O43172 NUDC-203ENST00000452707 816 ntTSL 321.3■■□□□ 15e-10■□□□□ 8.2
PRPF4O43172 AMDHD2-207ENST00000563453 555 ntTSL 216.37■□□□□ 0.215e-10■□□□□ 8.2
PRPF4O43172 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.27e-6■□□□□ 8.2
PRPF4O43172 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.457e-6■□□□□ 8.2
PRPF4O43172 KLF3-202ENST00000482150 517 ntTSL 213.54□□□□□ -0.247e-6■□□□□ 8.2
PRPF4O43172 INF2-208ENST00000481338 1102 ntTSL 216.84■□□□□ 0.293e-10■□□□□ 8.2
PRPF4O43172 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.013e-10■□□□□ 8.2
PRPF4O43172 INF2-201ENST00000252527 3050 ntTSL 214.74□□□□□ -0.053e-10■□□□□ 8.2
PRPF4O43172 SRRM2-226ENST00000576415 461 ntTSL 224.58■■□□□ 1.534e-15■□□□□ 8.1
PRPF4O43172 SRRM2-223ENST00000575701 860 ntTSL 324.14■■□□□ 1.454e-15■□□□□ 8.1
PRPF4O43172 SRRM2-219ENST00000574340 579 ntTSL 318.58■□□□□ 0.564e-15■□□□□ 8.1
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