Protein–RNA interactions for Protein: O43172

PRPF4, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4O43172 PFN2-204ENST00000460404 942 ntTSL 1 (best)14□□□□□ -0.172e-7■□□□□ 8.3
PRPF4O43172 PROC-206ENST00000429925 581 ntTSL 313.77□□□□□ -0.212e-7■□□□□ 8.3
PRPF4O43172 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.222e-7■□□□□ 8.3
PRPF4O43172 SLC26A6-218ENST00000482282 1029 ntTSL 513.61□□□□□ -0.232e-7■□□□□ 8.3
PRPF4O43172 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.292e-7■□□□□ 8.3
PRPF4O43172 PFN2-212ENST00000490975 858 ntTSL 4 BASIC12.93□□□□□ -0.342e-7■□□□□ 8.3
PRPF4O43172 PROC-207ENST00000431364 566 ntTSL 412.33□□□□□ -0.442e-7■□□□□ 8.3
PRPF4O43172 PROC-205ENST00000427769 598 ntTSL 411.93□□□□□ -0.52e-7■□□□□ 8.3
PRPF4O43172 PFN2-216ENST00000498169 662 ntTSL 211.46□□□□□ -0.572e-7■□□□□ 8.3
PRPF4O43172 PFN2-207ENST00000468323 894 ntTSL 211.13□□□□□ -0.632e-7■□□□□ 8.3
PRPF4O43172 SLC26A6-210ENST00000431213 556 ntTSL 410.86□□□□□ -0.672e-7■□□□□ 8.3
PRPF4O43172 PROC-210ENST00000474030 501 ntTSL 410.47□□□□□ -0.732e-7■□□□□ 8.3
PRPF4O43172 PFN2-208ENST00000475518 637 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.742e-7■□□□□ 8.3
PRPF4O43172 TNFRSF10D-201ENST00000312584 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.842e-7■□□□□ 8.3
PRPF4O43172 PFN2-217ENST00000498307 556 ntTSL 4 BASIC7.48□□□□□ -1.212e-7■□□□□ 8.3
PRPF4O43172 PFN2-213ENST00000494827 793 ntTSL 4 BASIC6.46□□□□□ -1.382e-7■□□□□ 8.3
PRPF4O43172 PFN2-209ENST00000481275 560 ntTSL 4 BASIC6.14□□□□□ -1.432e-7■□□□□ 8.3
PRPF4O43172 NINL-207ENST00000496509 735 ntTSL 513.64□□□□□ -0.238e-8■□□□□ 8.3
PRPF4O43172 ZFHX3-203ENST00000397992 13841 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.872e-6■□□□□ 8.3
PRPF4O43172 ZFHX3-201ENST00000268489 16064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.942e-6■□□□□ 8.3
PRPF4O43172 ZFHX3-207ENST00000641206 16414 ntAPPRIS P1 BASIC7.72□□□□□ -1.172e-6■□□□□ 8.3
PRPF4O43172 IGF2BP3-210ENST00000476938 500 ntTSL 215.06■□□□□ 02e-7■□□□□ 8.3
PRPF4O43172 IGF2BP3-206ENST00000468005 2948 ntTSL 514.92□□□□□ -0.022e-7■□□□□ 8.3
PRPF4O43172 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.693e-6■□□□□ 8.3
PRPF4O43172 KMT2A-209ENST00000531904 4320 ntTSL 219.11■□□□□ 0.653e-6■□□□□ 8.3
PRPF4O43172 KMT2A-210ENST00000532204 499 ntTSL 218.74■□□□□ 0.593e-6■□□□□ 8.3
PRPF4O43172 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.453e-6■□□□□ 8.3
PRPF4O43172 IL32-224ENST00000534748 580 ntTSL 317.7■□□□□ 0.423e-6■□□□□ 8.3
PRPF4O43172 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.423e-6■□□□□ 8.3
PRPF4O43172 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.343e-6■□□□□ 8.3
PRPF4O43172 KMT2A-206ENST00000527869 481 ntTSL 317.09■□□□□ 0.333e-6■□□□□ 8.3
PRPF4O43172 KMT2A-211ENST00000533790 804 ntTSL 217.09■□□□□ 0.333e-6■□□□□ 8.3
PRPF4O43172 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.213e-6■□□□□ 8.3
PRPF4O43172 HAGLR-201ENST00000413969 545 ntTSL 316.07■□□□□ 0.163e-6■□□□□ 8.3
PRPF4O43172 BAG6-246ENST00000438149 714 ntTSL 315.61■□□□□ 0.093e-6■□□□□ 8.3
PRPF4O43172 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.033e-6■□□□□ 8.3
PRPF4O43172 HAGLR-203ENST00000417086 984 ntTSL 214.52□□□□□ -0.093e-6■□□□□ 8.3
PRPF4O43172 KMT2A-208ENST00000529852 3323 ntTSL 213.08□□□□□ -0.313e-6■□□□□ 8.3
PRPF4O43172 UCKL1-204ENST00000430743 888 ntTSL 313□□□□□ -0.333e-6■□□□□ 8.3
PRPF4O43172 BAG6-252ENST00000453833 554 ntTSL 512.16□□□□□ -0.463e-6■□□□□ 8.3
PRPF4O43172 HAGLR-205ENST00000436126 945 ntTSL 411.98□□□□□ -0.493e-6■□□□□ 8.3
PRPF4O43172 KMT2A-201ENST00000389506 13655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.493e-6■□□□□ 8.3
PRPF4O43172 MIR1914-201ENST00000607800 80 ntBASIC11.91□□□□□ -0.53e-6■□□□□ 8.3
PRPF4O43172 HS1BP3-IT1-201ENST00000449391 600 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.553e-6■□□□□ 8.3
PRPF4O43172 TTLL4-219ENST00000480929 2421 ntTSL 210.93□□□□□ -0.663e-6■□□□□ 8.3
PRPF4O43172 TTLL4-202ENST00000392102 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.683e-6■□□□□ 8.3
PRPF4O43172 BAG6-261ENST00000469182 653 ntTSL 310.2□□□□□ -0.783e-6■□□□□ 8.3
PRPF4O43172 TTLL4-201ENST00000258398 4730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.93e-6■□□□□ 8.3
PRPF4O43172 TTLL4-213ENST00000461181 590 ntTSL 48.61□□□□□ -1.033e-6■□□□□ 8.3
PRPF4O43172 TTLL4-217ENST00000475950 587 ntTSL 38.34□□□□□ -1.073e-6■□□□□ 8.3
PRPF4O43172 KMT2A-213ENST00000534358 16602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.13e-6■□□□□ 8.3
PRPF4O43172 TTLL4-214ENST00000465558 1688 ntTSL 27.69□□□□□ -1.183e-6■□□□□ 8.3
PRPF4O43172 TTLL4-221ENST00000494428 829 ntTSL 37.68□□□□□ -1.183e-6■□□□□ 8.3
PRPF4O43172 TTLL4-204ENST00000417196 811 ntTSL 57.45□□□□□ -1.223e-6■□□□□ 8.3
PRPF4O43172 TTLL4-207ENST00000434241 476 ntTSL 57.26□□□□□ -1.253e-6■□□□□ 8.3
PRPF4O43172 TTLL4-218ENST00000480472 765 ntTSL 47.11□□□□□ -1.273e-6■□□□□ 8.3
PRPF4O43172 TTLL4-210ENST00000442769 3971 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.313e-6■□□□□ 8.3
PRPF4O43172 TTLL4-215ENST00000467841 973 ntTSL 46.78□□□□□ -1.323e-6■□□□□ 8.3
PRPF4O43172 OGT-205ENST00000459760 541 ntTSL 54.03□□□□□ -1.761e-6■□□□□ 8.3
PRPF4O43172 JMJD8-212ENST00000568689 1998 ntTSL 329.92■■■□□ 2.389e-6■□□□□ 8.2
PRPF4O43172 JMJD8-209ENST00000567120 2205 ntTSL 1 (best)29.56■■■□□ 2.329e-6■□□□□ 8.2
PRPF4O43172 JMJD8-214ENST00000569441 1428 ntTSL 528.96■■■□□ 2.239e-6■□□□□ 8.2
PRPF4O43172 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.889e-6■□□□□ 8.2
PRPF4O43172 JMJD8-208ENST00000566199 719 ntTSL 325.02■■□□□ 1.69e-6■□□□□ 8.2
PRPF4O43172 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.579e-6■□□□□ 8.2
PRPF4O43172 AK4-206ENST00000497030 834 ntTSL 1 (best)24.82■■□□□ 1.569e-6■□□□□ 8.2
PRPF4O43172 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.549e-6■□□□□ 8.2
PRPF4O43172 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.397e-9■□□□□ 8.2
PRPF4O43172 SAMD4B-212ENST00000602243 672 ntTSL 323.5■■□□□ 1.357e-9■□□□□ 8.2
PRPF4O43172 JMJD8-207ENST00000565302 1975 ntTSL 323.39■■□□□ 1.339e-6■□□□□ 8.2
PRPF4O43172 POLR2F-206ENST00000443002 1890 ntTSL 223.28■■□□□ 1.329e-6■□□□□ 8.2
PRPF4O43172 JMJD8-213ENST00000569396 729 ntTSL 523.02■■□□□ 1.289e-6■□□□□ 8.2
PRPF4O43172 PACSIN3-204ENST00000528201 864 ntTSL 322.69■■□□□ 1.229e-6■□□□□ 8.2
PRPF4O43172 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.229e-6■□□□□ 8.2
PRPF4O43172 AK4-203ENST00000470888 1043 ntTSL 222.55■■□□□ 1.29e-6■□□□□ 8.2
PRPF4O43172 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.119e-6■□□□□ 8.2
PRPF4O43172 PACSIN3-205ENST00000528462 1560 ntTSL 221.45■■□□□ 1.029e-6■□□□□ 8.2
PRPF4O43172 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.019e-6■□□□□ 8.2
PRPF4O43172 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.999e-6■□□□□ 8.2
PRPF4O43172 PACSIN3-207ENST00000530513 912 ntTSL 321.22■□□□□ 0.999e-6■□□□□ 8.2
PRPF4O43172 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.919e-6■□□□□ 8.2
PRPF4O43172 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.71■□□□□ 0.919e-6■□□□□ 8.2
PRPF4O43172 JMJD8-210ENST00000567901 785 ntTSL 320.39■□□□□ 0.859e-6■□□□□ 8.2
PRPF4O43172 POLR2F-212ENST00000492213 550 ntTSL 420.14■□□□□ 0.819e-6■□□□□ 8.2
PRPF4O43172 PACSIN3-203ENST00000525725 683 ntTSL 220.11■□□□□ 0.819e-6■□□□□ 8.2
PRPF4O43172 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.789e-6■□□□□ 8.2
PRPF4O43172 RSAD1-208ENST00000515221 1029 ntTSL 219.83■□□□□ 0.779e-6■□□□□ 8.2
PRPF4O43172 DECR2-216ENST00000633348 762 ntTSL 319.77■□□□□ 0.769e-6■□□□□ 8.2
PRPF4O43172 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.689e-6■□□□□ 8.2
PRPF4O43172 CTSA-206ENST00000480961 513 ntTSL 219.27■□□□□ 0.689e-6■□□□□ 8.2
PRPF4O43172 ARFGAP1-209ENST00000518794 2727 ntTSL 1 (best)19.02■□□□□ 0.649e-6■□□□□ 8.2
PRPF4O43172 ZNF326-204ENST00000394583 1956 ntTSL 1 (best)18.79■□□□□ 0.69e-6■□□□□ 8.2
PRPF4O43172 DECR2-217ENST00000633923 509 ntTSL 318.48■□□□□ 0.559e-6■□□□□ 8.2
PRPF4O43172 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.549e-6■□□□□ 8.2
PRPF4O43172 DECR2-204ENST00000437024 1738 ntTSL 218.39■□□□□ 0.539e-6■□□□□ 8.2
PRPF4O43172 DECR2-206ENST00000445291 1078 ntTSL 518.18■□□□□ 0.59e-6■□□□□ 8.2
PRPF4O43172 ARFGAP1-205ENST00000468975 2640 ntTSL 218.13■□□□□ 0.499e-6■□□□□ 8.2
PRPF4O43172 PACSIN3-208ENST00000531226 654 ntTSL 518.08■□□□□ 0.489e-6■□□□□ 8.2
PRPF4O43172 DECR2-205ENST00000439661 1618 ntTSL 217.83■□□□□ 0.449e-6■□□□□ 8.2
PRPF4O43172 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.399e-6■□□□□ 8.2
Retrieved 100 of 20,551 protein–RNA pairs in 333.4 ms