RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528201.1

PACSIN3-204, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 3

Gene PACSIN3, Length 864 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-204ENST00000528201 NISCHQ9Y2I1 1504 aa59.38■■■■■ 7.1
PACSIN3-204ENST00000528201 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa52.91■■■■■ 6.06
PACSIN3-204ENST00000528201 ABCC9O60706 1549 aa52.59■■■■■ 6.01
PACSIN3-204ENST00000528201 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa50.16■■■■■ 5.62
PACSIN3-204ENST00000528201 NACADO15069 1562 aa49.96■■■■■ 5.59
PACSIN3-204ENST00000528201 DCAF8L2P0C7V8 631 aa49.89■■■■■ 5.58
PACSIN3-204ENST00000528201 MYO15BQ96JP2 1530 aa49.46■■■■■ 5.51
PACSIN3-204ENST00000528201 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP49.34■■■■■ 5.49
PACSIN3-204ENST00000528201 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP49.1■■■■■ 5.45
PACSIN3-204ENST00000528201 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa49.04■■■■■ 5.44
PACSIN3-204ENST00000528201 DNAJC5BQ9UF47 199 aa48.99■■■■■ 5.43
PACSIN3-204ENST00000528201 UNC13AQ9UPW8 1703 aa48.97■■■■■ 5.43
PACSIN3-204ENST00000528201 BICRAQ9NZM4 1560 aa48.79■■■■■ 5.4
PACSIN3-204ENST00000528201 SCRIBQ14160 1630 aa48.36■■■■■ 5.33
PACSIN3-204ENST00000528201 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa48.08■■■■■ 5.29
PACSIN3-204ENST00000528201 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP47.5■■■■■ 5.19
PACSIN3-204ENST00000528201 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa47.46■■■■■ 5.19
PACSIN3-204ENST00000528201 CECR2Q9BXF3 1484 aa47.29■■■■■ 5.16
PACSIN3-204ENST00000528201 NCAPD3P42695 1498 aa46.19■■■■■ 4.99
PACSIN3-204ENST00000528201 SMARCA4P51532 1647 aa46.16■■■■■ 4.98
PACSIN3-204ENST00000528201 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa46.15■■■■■ 4.98
PACSIN3-204ENST00000528201 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP46■■■■■ 4.95
PACSIN3-204ENST00000528201 SMARCA2P51531 1590 aa45.95■■■■■ 4.95
PACSIN3-204ENST00000528201 HMGXB3Q12766 1538 aa45.84■■■■■ 4.93
PACSIN3-204ENST00000528201 MROH2BQ7Z745 1585 aa45.8■■■■■ 4.92
PACSIN3-204ENST00000528201 PEG3Q9GZU2 1588 aa45.72■■■■■ 4.91
PACSIN3-204ENST00000528201 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP45.68■■■■■ 4.9
PACSIN3-204ENST00000528201 NESP48681 1621 aa45.35■■■■■ 4.85
PACSIN3-204ENST00000528201 ERCC6Q03468 1493 aa45.29■■■■■ 4.84
PACSIN3-204ENST00000528201 WIZO95785 1651 aa45.21■■■■■ 4.83
PACSIN3-204ENST00000528201 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP45.06■■■■■ 4.8
PACSIN3-204ENST00000528201 CUX2O14529 1486 aa45.03■■■■■ 4.8
PACSIN3-204ENST00000528201 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa44.98■■■■■ 4.79
PACSIN3-204ENST00000528201 CADPSQ9ULU8 1353 aa44.82■■■■■ 4.77
PACSIN3-204ENST00000528201 PDS5BQ9NTI5 1447 aa44.75■■■■■ 4.75
PACSIN3-204ENST00000528201 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP44.7■■■■■ 4.75
PACSIN3-204ENST00000528201 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP44.68■■■■■ 4.74
PACSIN3-204ENST00000528201 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa44.63■■■■■ 4.73
PACSIN3-204ENST00000528201 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa44.49■■■■■ 4.71
PACSIN3-204ENST00000528201 CFTRP13569 1480 aa44.42■■■■■ 4.7
PACSIN3-204ENST00000528201 MRC2Q9UBG0 1479 aa44.35■■■■■ 4.69
PACSIN3-204ENST00000528201 FANCD2Q9BXW9 1451 aa44.3■■■■■ 4.68
PACSIN3-204ENST00000528201 CEP164Q9UPV0 1460 aa44.27■■■■■ 4.68
PACSIN3-204ENST00000528201 CCDC88BA6NC98 1476 aa44.22■■■■■ 4.67
PACSIN3-204ENST00000528201 WDR62O43379 1518 aa44.22■■■■■ 4.67
PACSIN3-204ENST00000528201 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP43.94■■■■■ 4.63
PACSIN3-204ENST00000528201 PRDM2Q13029 1718 aa43.79■■■■■ 4.6
PACSIN3-204ENST00000528201 TOPBP1Q92547 1522 aa43.53■■■■■ 4.56
PACSIN3-204ENST00000528201 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP43.44■■■■■ 4.54
PACSIN3-204ENST00000528201 IFT140Q96RY7 1462 aa43.37■■■■■ 4.53
PACSIN3-204ENST00000528201 ABCC8Q09428 1581 aa43.36■■■■■ 4.53
PACSIN3-204ENST00000528201 DNMBPQ6XZF7 1577 aa43.36■■■■■ 4.53
PACSIN3-204ENST00000528201 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP43.33■■■■■ 4.53
PACSIN3-204ENST00000528201 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP43.13■■■■■ 4.49
PACSIN3-204ENST00000528201 OSCARQ8IYS5 282 aa43.08■■■■■ 4.49
PACSIN3-204ENST00000528201 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP43.08■■■■■ 4.49
PACSIN3-204ENST00000528201 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP43.02■■■■■ 4.48
PACSIN3-204ENST00000528201 CUX1P39880 1505 aa43■■■■■ 4.47
PACSIN3-204ENST00000528201 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP43■■■■■ 4.471e-6■■■■□ 23.2
PACSIN3-204ENST00000528201 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa43■■■■■ 4.47
PACSIN3-204ENST00000528201 SOGA1O94964 1423 aa42.93■■■■■ 4.46
PACSIN3-204ENST00000528201 FGD5Q6ZNL6 1462 aa42.92■■■■■ 4.46
PACSIN3-204ENST00000528201 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP42.82■■■■■ 4.45
PACSIN3-204ENST00000528201 TRIM41Q8WV44 630 aa42.75■■■■■ 4.43
PACSIN3-204ENST00000528201 WDR97A6NE52 1622 aa42.57■■■■■ 4.4
PACSIN3-204ENST00000528201 FBLN2P98095 1184 aa42.56■■■■■ 4.4
PACSIN3-204ENST00000528201 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa42.55■■■■■ 4.4
PACSIN3-204ENST00000528201 CHD1O14646 1710 aa42.53■■■■■ 4.4
PACSIN3-204ENST00000528201 GRIN2BQ13224 1484 aa42.47■■■■■ 4.39
PACSIN3-204ENST00000528201 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa42.46■■■■■ 4.39
PACSIN3-204ENST00000528201 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP42.45■■■■■ 4.39
PACSIN3-204ENST00000528201 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa42.44■■■■■ 4.38
PACSIN3-204ENST00000528201 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa42.44■■■■■ 4.38
PACSIN3-204ENST00000528201 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa42.44■■■■■ 4.38
PACSIN3-204ENST00000528201 ARHGEF11O15085 1522 aa42.41■■■■■ 4.38
PACSIN3-204ENST00000528201 GAPVD1Q14C86 1478 aa42.4■■■■■ 4.38
PACSIN3-204ENST00000528201 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP42.4■■■■■ 4.38
PACSIN3-204ENST00000528201 SYNJ1O43426 1573 aa42.39■■■■■ 4.38
PACSIN3-204ENST00000528201 TOP2BQ02880 1626 aa42.37■■■■■ 4.37
PACSIN3-204ENST00000528201 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa42.33■■■■■ 4.37
PACSIN3-204ENST00000528201 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa42.31■■■■■ 4.36
PACSIN3-204ENST00000528201 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP42.31■■■■■ 4.36
PACSIN3-204ENST00000528201 SYNJ2O15056 1496 aa42.27■■■■■ 4.36
PACSIN3-204ENST00000528201 PBRM1Q86U86 1689 aa42.23■■■■■ 4.35
PACSIN3-204ENST00000528201 CLASP1Q7Z460 1538 aa42.17■■■■■ 4.34
PACSIN3-204ENST00000528201 CYB5RLQ6IPT4 315 aa42.09■■■■■ 4.33
PACSIN3-204ENST00000528201 ARAP1Q96P48 1450 aa42.07■■■■■ 4.33
PACSIN3-204ENST00000528201 ADAMTS12P58397 1594 aa41.97■■■■■ 4.31
PACSIN3-204ENST00000528201 GRIN2AQ12879 1464 aa41.94■■■■■ 4.3
PACSIN3-204ENST00000528201 ERICH3Q5RHP9 1530 aa41.89■■■■■ 4.3
PACSIN3-204ENST00000528201 FHAD1B1AJZ9 1412 aa41.88■■■■■ 4.3
PACSIN3-204ENST00000528201 NUP160Q12769 1436 aa41.81■■■■■ 4.28
PACSIN3-204ENST00000528201 CEP170Q5SW79 1584 aa41.78■■■■■ 4.28
PACSIN3-204ENST00000528201 ERCC6L2Q5T890 1561 aa41.62■■■■■ 4.25
PACSIN3-204ENST00000528201 IGF1RP08069 1367 aa41.59■■■■■ 4.25
PACSIN3-204ENST00000528201 KIF27Q86VH2 1401 aa41.58■■■■■ 4.25
PACSIN3-204ENST00000528201 SHROOM2Q13796 1616 aa41.49■■■■■ 4.23
PACSIN3-204ENST00000528201 TRHP20396 242 aaPredicted RBP41.39■■■■■ 4.22
PACSIN3-204ENST00000528201 JPH4Q96JJ6 628 aa41.37■■■■■ 4.21
PACSIN3-204ENST00000528201 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa41.36■■■■■ 4.21
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