RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492213.5

POLR2F-212, Transcript of RNA polymerase II subunit F, humanhuman

TSL 4

Gene POLR2F, Length 550 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2F-212ENST00000492213 NISCHQ9Y2I1 1504 aa52.05■■■■■ 5.92
POLR2F-212ENST00000492213 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa46.26■■■■■ 5
POLR2F-212ENST00000492213 ABCC9O60706 1549 aa45.35■■■■■ 4.85
POLR2F-212ENST00000492213 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa43.56■■■■■ 4.56
POLR2F-212ENST00000492213 NACADO15069 1562 aa43.52■■■■■ 4.56
POLR2F-212ENST00000492213 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP43.38■■■■■ 4.53
POLR2F-212ENST00000492213 DCAF8L2P0C7V8 631 aa43.34■■■■■ 4.53
POLR2F-212ENST00000492213 MYO15BQ96JP2 1530 aa43.28■■■■■ 4.52
POLR2F-212ENST00000492213 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa43.08■■■■■ 4.49
POLR2F-212ENST00000492213 UNC13AQ9UPW8 1703 aa42.6■■■■■ 4.41
POLR2F-212ENST00000492213 BICRAQ9NZM4 1560 aa42.35■■■■■ 4.37
POLR2F-212ENST00000492213 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP42.35■■■■■ 4.37
POLR2F-212ENST00000492213 SCRIBQ14160 1630 aa42.2■■■■■ 4.35
POLR2F-212ENST00000492213 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa41.84■■■■■ 4.29
POLR2F-212ENST00000492213 DNAJC5BQ9UF47 199 aa41.77■■■■■ 4.28
POLR2F-212ENST00000492213 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP41.18■■■■■ 4.18
POLR2F-212ENST00000492213 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa41.02■■■■■ 4.16
POLR2F-212ENST00000492213 CECR2Q9BXF3 1484 aa40.75■■■■■ 4.11
POLR2F-212ENST00000492213 SMARCA4P51532 1647 aa40.38■■■■■ 4.06
POLR2F-212ENST00000492213 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP40.3■■■■■ 4.04
POLR2F-212ENST00000492213 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa40.21■■■■■ 4.03
POLR2F-212ENST00000492213 NCAPD3P42695 1498 aa40.19■■■■■ 4.03
POLR2F-212ENST00000492213 MROH2BQ7Z745 1585 aa40.14■■■■■ 4.02
POLR2F-212ENST00000492213 SMARCA2P51531 1590 aa40.1■■■■■ 4.01
POLR2F-212ENST00000492213 PEG3Q9GZU2 1588 aa40.03■■■■■ 4
POLR2F-212ENST00000492213 HMGXB3Q12766 1538 aa39.97■■■■□ 3.99
POLR2F-212ENST00000492213 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP39.81■■■■□ 3.96
POLR2F-212ENST00000492213 WIZO95785 1651 aa39.65■■■■□ 3.94
POLR2F-212ENST00000492213 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP39.65■■■■□ 3.94
POLR2F-212ENST00000492213 NESP48681 1621 aa39.25■■■■□ 3.87
POLR2F-212ENST00000492213 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP39.24■■■■□ 3.87
POLR2F-212ENST00000492213 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa39.09■■■■□ 3.85
POLR2F-212ENST00000492213 ERCC6Q03468 1493 aa39.02■■■■□ 3.84
POLR2F-212ENST00000492213 CADPSQ9ULU8 1353 aa38.99■■■■□ 3.83
POLR2F-212ENST00000492213 PDS5BQ9NTI5 1447 aa38.8■■■■□ 3.8
POLR2F-212ENST00000492213 CCDC88BA6NC98 1476 aa38.79■■■■□ 3.8
POLR2F-212ENST00000492213 CFTRP13569 1480 aa38.78■■■■□ 3.8
POLR2F-212ENST00000492213 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa38.74■■■■□ 3.79
POLR2F-212ENST00000492213 CUX2O14529 1486 aa38.7■■■■□ 3.79
POLR2F-212ENST00000492213 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP38.69■■■■□ 3.78
POLR2F-212ENST00000492213 FANCD2Q9BXW9 1451 aa38.54■■■■□ 3.76
POLR2F-212ENST00000492213 CEP164Q9UPV0 1460 aa38.47■■■■□ 3.75
POLR2F-212ENST00000492213 MRC2Q9UBG0 1479 aa38.47■■■■□ 3.75
POLR2F-212ENST00000492213 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP38.46■■■■□ 3.75
POLR2F-212ENST00000492213 PRDM2Q13029 1718 aa38.4■■■■□ 3.74
POLR2F-212ENST00000492213 WDR62O43379 1518 aa38.36■■■■□ 3.73
POLR2F-212ENST00000492213 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP38.21■■■■□ 3.71
POLR2F-212ENST00000492213 TOPBP1Q92547 1522 aa37.94■■■■□ 3.66
POLR2F-212ENST00000492213 DNMBPQ6XZF7 1577 aa37.87■■■■□ 3.65
POLR2F-212ENST00000492213 ABCC8Q09428 1581 aa37.86■■■■□ 3.65
POLR2F-212ENST00000492213 IFT140Q96RY7 1462 aa37.7■■■■□ 3.63
POLR2F-212ENST00000492213 CUX1P39880 1505 aa37.65■■■■□ 3.62
POLR2F-212ENST00000492213 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP37.62■■■■□ 3.61
POLR2F-212ENST00000492213 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa37.6■■■■□ 3.61
POLR2F-212ENST00000492213 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP37.58■■■■□ 3.61
POLR2F-212ENST00000492213 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP37.54■■■■□ 3.6
POLR2F-212ENST00000492213 FGD5Q6ZNL6 1462 aa37.5■■■■□ 3.59
POLR2F-212ENST00000492213 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa37.45■■■■□ 3.59
POLR2F-212ENST00000492213 SOGA1O94964 1423 aa37.41■■■■□ 3.58
POLR2F-212ENST00000492213 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP37.38■■■■□ 3.58
POLR2F-212ENST00000492213 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP37.33■■■■□ 3.57
POLR2F-212ENST00000492213 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP37.32■■■■□ 3.565e-7■■■■■ 39.8
POLR2F-212ENST00000492213 SYNJ1O43426 1573 aa37.29■■■■□ 3.56
POLR2F-212ENST00000492213 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa37.28■■■■□ 3.56
POLR2F-212ENST00000492213 TOP2BQ02880 1626 aa37.27■■■■□ 3.56
POLR2F-212ENST00000492213 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP37.23■■■■□ 3.55
POLR2F-212ENST00000492213 WDR97A6NE52 1622 aa37.21■■■■□ 3.55
POLR2F-212ENST00000492213 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa37.15■■■■□ 3.54
POLR2F-212ENST00000492213 OSCARQ8IYS5 282 aa37.02■■■■□ 3.52
POLR2F-212ENST00000492213 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa37.02■■■■□ 3.52
POLR2F-212ENST00000492213 GRIN2BQ13224 1484 aa37■■■■□ 3.51
POLR2F-212ENST00000492213 GAPVD1Q14C86 1478 aa36.98■■■■□ 3.51
POLR2F-212ENST00000492213 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa36.98■■■■□ 3.51
POLR2F-212ENST00000492213 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP36.91■■■■□ 3.5
POLR2F-212ENST00000492213 CHD1O14646 1710 aa36.9■■■■□ 3.5
POLR2F-212ENST00000492213 PBRM1Q86U86 1689 aa36.9■■■■□ 3.5
POLR2F-212ENST00000492213 SYNJ2O15056 1496 aa36.77■■■■□ 3.48
POLR2F-212ENST00000492213 FBLN2P98095 1184 aa36.77■■■■□ 3.48
POLR2F-212ENST00000492213 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP36.68■■■■□ 3.46
POLR2F-212ENST00000492213 ERICH3Q5RHP9 1530 aa36.68■■■■□ 3.46
POLR2F-212ENST00000492213 ADAMTS12P58397 1594 aa36.66■■■■□ 3.46
POLR2F-212ENST00000492213 CLASP1Q7Z460 1538 aa36.58■■■■□ 3.45
POLR2F-212ENST00000492213 FHAD1B1AJZ9 1412 aa36.57■■■■□ 3.44
POLR2F-212ENST00000492213 GRIN2AQ12879 1464 aa36.53■■■■□ 3.44
POLR2F-212ENST00000492213 KIF27Q86VH2 1401 aa36.52■■■■□ 3.44
POLR2F-212ENST00000492213 ARHGEF11O15085 1522 aa36.5■■■■□ 3.43
POLR2F-212ENST00000492213 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa36.5■■■■□ 3.43
POLR2F-212ENST00000492213 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa36.5■■■■□ 3.43
POLR2F-212ENST00000492213 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa36.5■■■■□ 3.43
POLR2F-212ENST00000492213 IGF1RP08069 1367 aa36.46■■■■□ 3.43
POLR2F-212ENST00000492213 NUP160Q12769 1436 aa36.42■■■■□ 3.42
POLR2F-212ENST00000492213 CEP170Q5SW79 1584 aa36.38■■■■□ 3.41
POLR2F-212ENST00000492213 TRIM41Q8WV44 630 aa36.31■■■■□ 3.4
POLR2F-212ENST00000492213 CUL7Q14999 1698 aa36.29■■■■□ 3.4
POLR2F-212ENST00000492213 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa36.26■■■■□ 3.4
POLR2F-212ENST00000492213 ARAP1Q96P48 1450 aa36.24■■■■□ 3.39
POLR2F-212ENST00000492213 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa36.19■■■■□ 3.38
POLR2F-212ENST00000492213 SHROOM2Q13796 1616 aa36.14■■■■□ 3.38
POLR2F-212ENST00000492213 CYB5RLQ6IPT4 315 aa36.09■■■■□ 3.37
POLR2F-212ENST00000492213 ERCC6L2Q5T890 1561 aa36.08■■■■□ 3.37
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