RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475950.5

TTLL4-217, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 4, humanhuman

TSL 3

Gene TTLL4, Length 587 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL4-217ENST00000475950 NISCHQ9Y2I1 1504 aa20.81■□□□□ 0.92
TTLL4-217ENST00000475950 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa18.39■□□□□ 0.53
TTLL4-217ENST00000475950 ABCC9O60706 1549 aa17.88■□□□□ 0.45
TTLL4-217ENST00000475950 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP17.38■□□□□ 0.37
TTLL4-217ENST00000475950 DCAF8L2P0C7V8 631 aa17.37■□□□□ 0.37
TTLL4-217ENST00000475950 NACADO15069 1562 aa17.25■□□□□ 0.35
TTLL4-217ENST00000475950 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa17.23■□□□□ 0.35
TTLL4-217ENST00000475950 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa17.19■□□□□ 0.34
TTLL4-217ENST00000475950 MYO15BQ96JP2 1530 aa17.17■□□□□ 0.34
TTLL4-217ENST00000475950 SCRIBQ14160 1630 aa16.88■□□□□ 0.29
TTLL4-217ENST00000475950 UNC13AQ9UPW8 1703 aa16.84■□□□□ 0.29
TTLL4-217ENST00000475950 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP16.75■□□□□ 0.27
TTLL4-217ENST00000475950 BICRAQ9NZM4 1560 aa16.71■□□□□ 0.27
TTLL4-217ENST00000475950 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa16.65■□□□□ 0.26
TTLL4-217ENST00000475950 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP16.26■□□□□ 0.19
TTLL4-217ENST00000475950 CECR2Q9BXF3 1484 aa16.22■□□□□ 0.19
TTLL4-217ENST00000475950 DNAJC5BQ9UF47 199 aa16.21■□□□□ 0.19
TTLL4-217ENST00000475950 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa16.16■□□□□ 0.18
TTLL4-217ENST00000475950 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
TTLL4-217ENST00000475950 SMARCA4P51532 1647 aa16.12■□□□□ 0.17
TTLL4-217ENST00000475950 MROH2BQ7Z745 1585 aa16.06■□□□□ 0.16
TTLL4-217ENST00000475950 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa15.97■□□□□ 0.15
TTLL4-217ENST00000475950 SMARCA2P51531 1590 aa15.96■□□□□ 0.14
TTLL4-217ENST00000475950 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
TTLL4-217ENST00000475950 PEG3Q9GZU2 1588 aa15.92■□□□□ 0.14
TTLL4-217ENST00000475950 NCAPD3P42695 1498 aa15.91■□□□□ 0.14
TTLL4-217ENST00000475950 WIZO95785 1651 aa15.9■□□□□ 0.14
TTLL4-217ENST00000475950 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
TTLL4-217ENST00000475950 HMGXB3Q12766 1538 aa15.87■□□□□ 0.13
TTLL4-217ENST00000475950 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP15.74■□□□□ 0.11
TTLL4-217ENST00000475950 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP15.73■□□□□ 0.11
TTLL4-217ENST00000475950 CCDC88BA6NC98 1476 aa15.55■□□□□ 0.08
TTLL4-217ENST00000475950 NESP48681 1621 aa15.53■□□□□ 0.08
TTLL4-217ENST00000475950 CADPSQ9ULU8 1353 aa15.48■□□□□ 0.07
TTLL4-217ENST00000475950 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa15.47■□□□□ 0.07
TTLL4-217ENST00000475950 CFTRP13569 1480 aa15.42■□□□□ 0.06
TTLL4-217ENST00000475950 ERCC6Q03468 1493 aa15.4■□□□□ 0.06
TTLL4-217ENST00000475950 PDS5BQ9NTI5 1447 aa15.37■□□□□ 0.05
TTLL4-217ENST00000475950 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa15.33■□□□□ 0.04
TTLL4-217ENST00000475950 FANCD2Q9BXW9 1451 aa15.33■□□□□ 0.04
TTLL4-217ENST00000475950 PRDM2Q13029 1718 aa15.31■□□□□ 0.04
TTLL4-217ENST00000475950 CEP164Q9UPV0 1460 aa15.28■□□□□ 0.04
TTLL4-217ENST00000475950 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP15.23■□□□□ 0.03
TTLL4-217ENST00000475950 MRC2Q9UBG0 1479 aa15.22■□□□□ 0.03
TTLL4-217ENST00000475950 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
TTLL4-217ENST00000475950 WDR62O43379 1518 aa15.15■□□□□ 0.02
TTLL4-217ENST00000475950 CUX2O14529 1486 aa15.12■□□□□ 0.01
TTLL4-217ENST00000475950 TOPBP1Q92547 1522 aa15.09■□□□□ 0.01
TTLL4-217ENST00000475950 DNMBPQ6XZF7 1577 aa15.09■□□□□ 0.01
TTLL4-217ENST00000475950 ABCC8Q09428 1581 aa15.08■□□□□ 0
TTLL4-217ENST00000475950 CUX1P39880 1505 aa15.06■□□□□ 0
TTLL4-217ENST00000475950 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP15.03■□□□□ -0
TTLL4-217ENST00000475950 SYNJ1O43426 1573 aa15□□□□□ -0.01
TTLL4-217ENST00000475950 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
TTLL4-217ENST00000475950 FGD5Q6ZNL6 1462 aa14.98□□□□□ -0.01
TTLL4-217ENST00000475950 TOP2BQ02880 1626 aa14.96□□□□□ -0.01
TTLL4-217ENST00000475950 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa14.95□□□□□ -0.02
TTLL4-217ENST00000475950 IFT140Q96RY7 1462 aa14.94□□□□□ -0.02
TTLL4-217ENST00000475950 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa14.93□□□□□ -0.02
TTLL4-217ENST00000475950 SOGA1O94964 1423 aa14.92□□□□□ -0.02
TTLL4-217ENST00000475950 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
TTLL4-217ENST00000475950 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
TTLL4-217ENST00000475950 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
TTLL4-217ENST00000475950 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
TTLL4-217ENST00000475950 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP14.82□□□□□ -0.046e-8■■□□□ 12.6
TTLL4-217ENST00000475950 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa14.82□□□□□ -0.04
TTLL4-217ENST00000475950 WDR97A6NE52 1622 aa14.82□□□□□ -0.04
TTLL4-217ENST00000475950 TRIM41Q8WV44 630 aa14.82□□□□□ -0.04
TTLL4-217ENST00000475950 CHIC1Q5VXU3 224 aa14.76□□□□□ -0.05
TTLL4-217ENST00000475950 GAPVD1Q14C86 1478 aa14.76□□□□□ -0.05
TTLL4-217ENST00000475950 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa14.75□□□□□ -0.05
TTLL4-217ENST00000475950 GRIN2BQ13224 1484 aa14.72□□□□□ -0.05
TTLL4-217ENST00000475950 PBRM1Q86U86 1689 aa14.71□□□□□ -0.05
TTLL4-217ENST00000475950 KIF27Q86VH2 1401 aa14.7□□□□□ -0.06
TTLL4-217ENST00000475950 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa14.69□□□□□ -0.06
TTLL4-217ENST00000475950 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
TTLL4-217ENST00000475950 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa14.65□□□□□ -0.06
TTLL4-217ENST00000475950 ERICH3Q5RHP9 1530 aa14.64□□□□□ -0.07
TTLL4-217ENST00000475950 FBLN2P98095 1184 aa14.63□□□□□ -0.07
TTLL4-217ENST00000475950 ADAMTS12P58397 1594 aa14.61□□□□□ -0.07
TTLL4-217ENST00000475950 IGF1RP08069 1367 aa14.6□□□□□ -0.07
TTLL4-217ENST00000475950 SYNJ2O15056 1496 aa14.6□□□□□ -0.07
TTLL4-217ENST00000475950 CHD1O14646 1710 aa14.6□□□□□ -0.07
TTLL4-217ENST00000475950 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
TTLL4-217ENST00000475950 FHAD1B1AJZ9 1412 aa14.58□□□□□ -0.08
TTLL4-217ENST00000475950 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
TTLL4-217ENST00000475950 CUL7Q14999 1698 aa14.55□□□□□ -0.08
TTLL4-217ENST00000475950 GRIN2AQ12879 1464 aa14.54□□□□□ -0.08
TTLL4-217ENST00000475950 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa14.53□□□□□ -0.08
TTLL4-217ENST00000475950 OSCARQ8IYS5 282 aa14.53□□□□□ -0.08
TTLL4-217ENST00000475950 EEA1Q15075 1411 aa14.52□□□□□ -0.08
TTLL4-217ENST00000475950 CSRNP3Q8WYN3 585 aa14.49□□□□□ -0.09
TTLL4-217ENST00000475950 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa14.47□□□□□ -0.09
TTLL4-217ENST00000475950 CEP170Q5SW79 1584 aa14.47□□□□□ -0.09
TTLL4-217ENST00000475950 PRXQ9BXM0 1461 aa14.45□□□□□ -0.1
TTLL4-217ENST00000475950 NUP160Q12769 1436 aa14.45□□□□□ -0.1
TTLL4-217ENST00000475950 CLASP1Q7Z460 1538 aa14.43□□□□□ -0.1
TTLL4-217ENST00000475950 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa14.41□□□□□ -0.1
TTLL4-217ENST00000475950 EHMT2Q96KQ7 1210 aa14.4□□□□□ -0.1
TTLL4-217ENST00000475950 KIF21BO75037 1637 aa14.37□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.9 ms