RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531226.5

PACSIN3-208, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 5

Gene PACSIN3, Length 654 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-208ENST00000531226 NISCHQ9Y2I1 1504 aa46.25■■■■■ 4.99
PACSIN3-208ENST00000531226 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa41.22■■■■■ 4.19
PACSIN3-208ENST00000531226 ABCC9O60706 1549 aa40.11■■■■■ 4.01
PACSIN3-208ENST00000531226 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa38.69■■■■□ 3.78
PACSIN3-208ENST00000531226 NACADO15069 1562 aa38.65■■■■□ 3.78
PACSIN3-208ENST00000531226 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP38.57■■■■□ 3.76
PACSIN3-208ENST00000531226 DCAF8L2P0C7V8 631 aa38.45■■■■□ 3.75
PACSIN3-208ENST00000531226 MYO15BQ96JP2 1530 aa38.44■■■■□ 3.74
PACSIN3-208ENST00000531226 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa38.3■■■■□ 3.72
PACSIN3-208ENST00000531226 UNC13AQ9UPW8 1703 aa37.96■■■■□ 3.67
PACSIN3-208ENST00000531226 SCRIBQ14160 1630 aa37.53■■■■□ 3.6
PACSIN3-208ENST00000531226 BICRAQ9NZM4 1560 aa37.52■■■■□ 3.6
PACSIN3-208ENST00000531226 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP37.41■■■■□ 3.58
PACSIN3-208ENST00000531226 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa37.13■■■■□ 3.54
PACSIN3-208ENST00000531226 DNAJC5BQ9UF47 199 aa36.67■■■■□ 3.46
PACSIN3-208ENST00000531226 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP36.51■■■■□ 3.44
PACSIN3-208ENST00000531226 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa36.36■■■■□ 3.41
PACSIN3-208ENST00000531226 CECR2Q9BXF3 1484 aa36.03■■■■□ 3.36
PACSIN3-208ENST00000531226 SMARCA4P51532 1647 aa35.94■■■■□ 3.34
PACSIN3-208ENST00000531226 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP35.87■■■■□ 3.33
PACSIN3-208ENST00000531226 SMARCA2P51531 1590 aa35.65■■■■□ 3.3
PACSIN3-208ENST00000531226 MROH2BQ7Z745 1585 aa35.64■■■■□ 3.3
PACSIN3-208ENST00000531226 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa35.64■■■■□ 3.3
PACSIN3-208ENST00000531226 NCAPD3P42695 1498 aa35.6■■■■□ 3.29
PACSIN3-208ENST00000531226 PEG3Q9GZU2 1588 aa35.58■■■■□ 3.29
PACSIN3-208ENST00000531226 HMGXB3Q12766 1538 aa35.51■■■■□ 3.27
PACSIN3-208ENST00000531226 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP35.36■■■■□ 3.25
PACSIN3-208ENST00000531226 WIZO95785 1651 aa35.32■■■■□ 3.24
PACSIN3-208ENST00000531226 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP35.22■■■■□ 3.23
PACSIN3-208ENST00000531226 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP34.93■■■■□ 3.18
PACSIN3-208ENST00000531226 NESP48681 1621 aa34.73■■■■□ 3.15
PACSIN3-208ENST00000531226 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa34.73■■■■□ 3.15
PACSIN3-208ENST00000531226 ERCC6Q03468 1493 aa34.57■■■■□ 3.12
PACSIN3-208ENST00000531226 CADPSQ9ULU8 1353 aa34.54■■■■□ 3.12
PACSIN3-208ENST00000531226 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa34.46■■■■□ 3.11
PACSIN3-208ENST00000531226 CCDC88BA6NC98 1476 aa34.46■■■■□ 3.11
PACSIN3-208ENST00000531226 PDS5BQ9NTI5 1447 aa34.4■■■■□ 3.1
PACSIN3-208ENST00000531226 CFTRP13569 1480 aa34.39■■■■□ 3.1
PACSIN3-208ENST00000531226 PRDM2Q13029 1718 aa34.36■■■■□ 3.09
PACSIN3-208ENST00000531226 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP34.29■■■■□ 3.08
PACSIN3-208ENST00000531226 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP34.29■■■■□ 3.08
PACSIN3-208ENST00000531226 CUX2O14529 1486 aa34.21■■■■□ 3.07
PACSIN3-208ENST00000531226 FANCD2Q9BXW9 1451 aa34.19■■■■□ 3.06
PACSIN3-208ENST00000531226 CEP164Q9UPV0 1460 aa34.15■■■■□ 3.06
PACSIN3-208ENST00000531226 MRC2Q9UBG0 1479 aa34.08■■■■□ 3.05
PACSIN3-208ENST00000531226 WDR62O43379 1518 aa34.02■■■■□ 3.04
PACSIN3-208ENST00000531226 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP33.85■■■■□ 3.01
PACSIN3-208ENST00000531226 TOPBP1Q92547 1522 aa33.67■■■□□ 2.98
PACSIN3-208ENST00000531226 DNMBPQ6XZF7 1577 aa33.67■■■□□ 2.98
PACSIN3-208ENST00000531226 ABCC8Q09428 1581 aa33.66■■■□□ 2.98
PACSIN3-208ENST00000531226 CUX1P39880 1505 aa33.44■■■□□ 2.94
PACSIN3-208ENST00000531226 IFT140Q96RY7 1462 aa33.43■■■□□ 2.94
PACSIN3-208ENST00000531226 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP33.37■■■□□ 2.93
PACSIN3-208ENST00000531226 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP33.34■■■□□ 2.93
PACSIN3-208ENST00000531226 FGD5Q6ZNL6 1462 aa33.31■■■□□ 2.92
PACSIN3-208ENST00000531226 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa33.29■■■□□ 2.92
PACSIN3-208ENST00000531226 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa33.25■■■□□ 2.91
PACSIN3-208ENST00000531226 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP33.25■■■□□ 2.91
PACSIN3-208ENST00000531226 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP33.21■■■□□ 2.91
PACSIN3-208ENST00000531226 TOP2BQ02880 1626 aa33.21■■■□□ 2.91
PACSIN3-208ENST00000531226 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP33.21■■■□□ 2.91
PACSIN3-208ENST00000531226 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa33.2■■■□□ 2.91
PACSIN3-208ENST00000531226 SYNJ1O43426 1573 aa33.2■■■□□ 2.91
PACSIN3-208ENST00000531226 SOGA1O94964 1423 aa33.19■■■□□ 2.9
PACSIN3-208ENST00000531226 WDR97A6NE52 1622 aa33.17■■■□□ 2.9
PACSIN3-208ENST00000531226 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP33.05■■■□□ 2.884e-10■■■■□ 21.8
PACSIN3-208ENST00000531226 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa33■■■□□ 2.87
PACSIN3-208ENST00000531226 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP32.97■■■□□ 2.87
PACSIN3-208ENST00000531226 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa32.93■■■□□ 2.86
PACSIN3-208ENST00000531226 PBRM1Q86U86 1689 aa32.92■■■□□ 2.86
PACSIN3-208ENST00000531226 GAPVD1Q14C86 1478 aa32.85■■■□□ 2.85
PACSIN3-208ENST00000531226 CHD1O14646 1710 aa32.84■■■□□ 2.85
PACSIN3-208ENST00000531226 GRIN2BQ13224 1484 aa32.83■■■□□ 2.85
PACSIN3-208ENST00000531226 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa32.79■■■□□ 2.84
PACSIN3-208ENST00000531226 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP32.77■■■□□ 2.84
PACSIN3-208ENST00000531226 OSCARQ8IYS5 282 aa32.71■■■□□ 2.83
PACSIN3-208ENST00000531226 ERICH3Q5RHP9 1530 aa32.62■■■□□ 2.81
PACSIN3-208ENST00000531226 SYNJ2O15056 1496 aa32.62■■■□□ 2.81
PACSIN3-208ENST00000531226 ADAMTS12P58397 1594 aa32.59■■■□□ 2.81
PACSIN3-208ENST00000531226 FBLN2P98095 1184 aa32.57■■■□□ 2.8
PACSIN3-208ENST00000531226 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP32.52■■■□□ 2.8
PACSIN3-208ENST00000531226 KIF27Q86VH2 1401 aa32.51■■■□□ 2.8
PACSIN3-208ENST00000531226 FHAD1B1AJZ9 1412 aa32.46■■■□□ 2.79
PACSIN3-208ENST00000531226 GRIN2AQ12879 1464 aa32.42■■■□□ 2.78
PACSIN3-208ENST00000531226 CLASP1Q7Z460 1538 aa32.41■■■□□ 2.78
PACSIN3-208ENST00000531226 CUL7Q14999 1698 aa32.4■■■□□ 2.78
PACSIN3-208ENST00000531226 TRIM41Q8WV44 630 aa32.39■■■□□ 2.78
PACSIN3-208ENST00000531226 IGF1RP08069 1367 aa32.32■■■□□ 2.77
PACSIN3-208ENST00000531226 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa32.32■■■□□ 2.76
PACSIN3-208ENST00000531226 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa32.32■■■□□ 2.76
PACSIN3-208ENST00000531226 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa32.32■■■□□ 2.76
PACSIN3-208ENST00000531226 CEP170Q5SW79 1584 aa32.3■■■□□ 2.76
PACSIN3-208ENST00000531226 ARHGEF11O15085 1522 aa32.28■■■□□ 2.76
PACSIN3-208ENST00000531226 NUP160Q12769 1436 aa32.27■■■□□ 2.76
PACSIN3-208ENST00000531226 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa32.24■■■□□ 2.75
PACSIN3-208ENST00000531226 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa32.16■■■□□ 2.74
PACSIN3-208ENST00000531226 SHROOM2Q13796 1616 aa32.11■■■□□ 2.73
PACSIN3-208ENST00000531226 CHIC1Q5VXU3 224 aa32.06■■■□□ 2.72
PACSIN3-208ENST00000531226 ARAP1Q96P48 1450 aa32.01■■■□□ 2.71
PACSIN3-208ENST00000531226 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa32.01■■■□□ 2.71
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