RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000569396.5

JMJD8-213, Transcript of jumonji domain containing 8, humanhuman

TSL 5

Gene JMJD8, Length 729 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JMJD8-213ENST00000569396 NISCHQ9Y2I1 1504 aa58.38■■■■■ 6.94
JMJD8-213ENST00000569396 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa51.84■■■■■ 5.89
JMJD8-213ENST00000569396 ABCC9O60706 1549 aa50.57■■■■■ 5.69
JMJD8-213ENST00000569396 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa48.73■■■■■ 5.39
JMJD8-213ENST00000569396 NACADO15069 1562 aa48.72■■■■■ 5.39
JMJD8-213ENST00000569396 DCAF8L2P0C7V8 631 aa48.7■■■■■ 5.39
JMJD8-213ENST00000569396 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP48.67■■■■■ 5.38
JMJD8-213ENST00000569396 MYO15BQ96JP2 1530 aa48.51■■■■■ 5.36
JMJD8-213ENST00000569396 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa48.34■■■■■ 5.33
JMJD8-213ENST00000569396 UNC13AQ9UPW8 1703 aa47.5■■■■■ 5.2
JMJD8-213ENST00000569396 SCRIBQ14160 1630 aa47.29■■■■■ 5.16
JMJD8-213ENST00000569396 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP47.26■■■■■ 5.162e-6■■■■□ 24.9
JMJD8-213ENST00000569396 BICRAQ9NZM4 1560 aa47.2■■■■■ 5.15
JMJD8-213ENST00000569396 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa46.83■■■■■ 5.09
JMJD8-213ENST00000569396 DNAJC5BQ9UF47 199 aa46.21■■■■■ 4.99
JMJD8-213ENST00000569396 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP45.97■■■■■ 4.95
JMJD8-213ENST00000569396 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa45.73■■■■■ 4.91
JMJD8-213ENST00000569396 CECR2Q9BXF3 1484 aa45.43■■■■■ 4.86
JMJD8-213ENST00000569396 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP45.26■■■■■ 4.84
JMJD8-213ENST00000569396 SMARCA4P51532 1647 aa45.26■■■■■ 4.84
JMJD8-213ENST00000569396 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa44.98■■■■■ 4.79
JMJD8-213ENST00000569396 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.98■■■■■ 4.79
JMJD8-213ENST00000569396 SMARCA2P51531 1590 aa44.97■■■■■ 4.79
JMJD8-213ENST00000569396 NCAPD3P42695 1498 aa44.95■■■■■ 4.79
JMJD8-213ENST00000569396 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.82■■■■■ 4.77
JMJD8-213ENST00000569396 HMGXB3Q12766 1538 aa44.75■■■■■ 4.76
JMJD8-213ENST00000569396 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP44.65■■■■■ 4.74
JMJD8-213ENST00000569396 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP44.53■■■■■ 4.72
JMJD8-213ENST00000569396 WIZO95785 1651 aa44.46■■■■■ 4.71
JMJD8-213ENST00000569396 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP44.07■■■■■ 4.65
JMJD8-213ENST00000569396 NESP48681 1621 aa43.77■■■■■ 4.6
JMJD8-213ENST00000569396 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa43.74■■■■■ 4.59
JMJD8-213ENST00000569396 CADPSQ9ULU8 1353 aa43.66■■■■■ 4.58
JMJD8-213ENST00000569396 ERCC6Q03468 1493 aa43.62■■■■■ 4.57
JMJD8-213ENST00000569396 CCDC88BA6NC98 1476 aa43.53■■■■■ 4.56
JMJD8-213ENST00000569396 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP43.52■■■■■ 4.56
JMJD8-213ENST00000569396 PDS5BQ9NTI5 1447 aa43.48■■■■■ 4.55
JMJD8-213ENST00000569396 CFTRP13569 1480 aa43.42■■■■■ 4.54
JMJD8-213ENST00000569396 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.24■■■■■ 4.51
JMJD8-213ENST00000569396 FANCD2Q9BXW9 1451 aa43.15■■■■■ 4.5
JMJD8-213ENST00000569396 CUX2O14529 1486 aa43.11■■■■■ 4.49
JMJD8-213ENST00000569396 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.1■■■■■ 4.49
JMJD8-213ENST00000569396 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP43.09■■■■■ 4.49
JMJD8-213ENST00000569396 PRDM2Q13029 1718 aa43.04■■■■■ 4.48
JMJD8-213ENST00000569396 MRC2Q9UBG0 1479 aa43■■■■■ 4.47
JMJD8-213ENST00000569396 WDR62O43379 1518 aa42.84■■■■■ 4.45
JMJD8-213ENST00000569396 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.68■■■■■ 4.42
JMJD8-213ENST00000569396 ABCC8Q09428 1581 aa42.52■■■■■ 4.4
JMJD8-213ENST00000569396 TOPBP1Q92547 1522 aa42.47■■■■■ 4.39
JMJD8-213ENST00000569396 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.44■■■■■ 4.39
JMJD8-213ENST00000569396 IFT140Q96RY7 1462 aa42.2■■■■■ 4.35
JMJD8-213ENST00000569396 CUX1P39880 1505 aa42.19■■■■■ 4.34
JMJD8-213ENST00000569396 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP42.11■■■■■ 4.33
JMJD8-213ENST00000569396 FGD5Q6ZNL6 1462 aa42.04■■■■■ 4.32
JMJD8-213ENST00000569396 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP42.02■■■■■ 4.32
JMJD8-213ENST00000569396 SOGA1O94964 1423 aa41.96■■■■■ 4.31
JMJD8-213ENST00000569396 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP41.96■■■■■ 4.31
JMJD8-213ENST00000569396 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP41.93■■■■■ 4.3
JMJD8-213ENST00000569396 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.92■■■■■ 4.3
JMJD8-213ENST00000569396 TOP2BQ02880 1626 aa41.87■■■■■ 4.29
JMJD8-213ENST00000569396 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.86■■■■■ 4.29
JMJD8-213ENST00000569396 SYNJ1O43426 1573 aa41.84■■■■■ 4.29
JMJD8-213ENST00000569396 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP41.79■■■■■ 4.28
JMJD8-213ENST00000569396 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP41.72■■■■■ 4.273e-9■■■■■ 43.8
JMJD8-213ENST00000569396 WDR97A6NE52 1622 aa41.71■■■■■ 4.27
JMJD8-213ENST00000569396 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.69■■■■■ 4.26
JMJD8-213ENST00000569396 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.66■■■■■ 4.26
JMJD8-213ENST00000569396 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa41.56■■■■■ 4.24
JMJD8-213ENST00000569396 GRIN2BQ13224 1484 aa41.47■■■■■ 4.23
JMJD8-213ENST00000569396 GAPVD1Q14C86 1478 aa41.47■■■■■ 4.23
JMJD8-213ENST00000569396 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa41.45■■■■■ 4.23
JMJD8-213ENST00000569396 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.37■■■■■ 4.21
JMJD8-213ENST00000569396 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP41.35■■■■■ 4.21
JMJD8-213ENST00000569396 OSCARQ8IYS5 282 aa41.33■■■■■ 4.21
JMJD8-213ENST00000569396 PBRM1Q86U86 1689 aa41.33■■■■■ 4.21
JMJD8-213ENST00000569396 FBLN2P98095 1184 aa41.22■■■■■ 4.19
JMJD8-213ENST00000569396 CHD1O14646 1710 aa41.19■■■■■ 4.18
JMJD8-213ENST00000569396 SYNJ2O15056 1496 aa41.17■■■■■ 4.18
JMJD8-213ENST00000569396 ERICH3Q5RHP9 1530 aa41.16■■■■■ 4.18
JMJD8-213ENST00000569396 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP41.15■■■■■ 4.18
JMJD8-213ENST00000569396 KIF27Q86VH2 1401 aa41.15■■■■■ 4.18
JMJD8-213ENST00000569396 TRIM41Q8WV44 630 aa41.12■■■■■ 4.17
JMJD8-213ENST00000569396 ADAMTS12P58397 1594 aa41.06■■■■■ 4.16
JMJD8-213ENST00000569396 FHAD1B1AJZ9 1412 aa41.03■■■■■ 4.16
JMJD8-213ENST00000569396 GRIN2AQ12879 1464 aa40.92■■■■■ 4.14
JMJD8-213ENST00000569396 IGF1RP08069 1367 aa40.91■■■■■ 4.14
JMJD8-213ENST00000569396 CUL7Q14999 1698 aa40.81■■■■■ 4.12
JMJD8-213ENST00000569396 CLASP1Q7Z460 1538 aa40.8■■■■■ 4.12
JMJD8-213ENST00000569396 NUP160Q12769 1436 aa40.74■■■■■ 4.11
JMJD8-213ENST00000569396 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa40.72■■■■■ 4.11
JMJD8-213ENST00000569396 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa40.7■■■■■ 4.11
JMJD8-213ENST00000569396 CHIC1Q5VXU3 224 aa40.69■■■■■ 4.1
JMJD8-213ENST00000569396 CEP170Q5SW79 1584 aa40.68■■■■■ 4.1
JMJD8-213ENST00000569396 ARHGEF11O15085 1522 aa40.64■■■■■ 4.1
JMJD8-213ENST00000569396 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa40.6■■■■■ 4.09
JMJD8-213ENST00000569396 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa40.6■■■■■ 4.09
JMJD8-213ENST00000569396 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa40.6■■■■■ 4.09
JMJD8-213ENST00000569396 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa40.48■■■■■ 4.07
JMJD8-213ENST00000569396 EEA1Q15075 1411 aa40.48■■■■■ 4.07
JMJD8-213ENST00000569396 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa40.39■■■■■ 4.06
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