RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567120.5

JMJD8-209, Transcript of jumonji domain containing 8, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene JMJD8, Length 2,205 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JMJD8-209ENST00000567120 NISCHQ9Y2I1 1504 aa60■■■■■ 7.2
JMJD8-209ENST00000567120 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa51.35■■■■■ 5.81
JMJD8-209ENST00000567120 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP50.73■■■■■ 5.71
JMJD8-209ENST00000567120 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa50.49■■■■■ 5.67
JMJD8-209ENST00000567120 DCAF8L2P0C7V8 631 aa49.4■■■■■ 5.5
JMJD8-209ENST00000567120 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa49.39■■■■■ 5.5
JMJD8-209ENST00000567120 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP49.3■■■■■ 5.48
JMJD8-209ENST00000567120 MYO15BQ96JP2 1530 aa48.15■■■■■ 5.3
JMJD8-209ENST00000567120 CHIC1Q5VXU3 224 aa47.91■■■■■ 5.26
JMJD8-209ENST00000567120 SCRIBQ14160 1630 aa47.83■■■■■ 5.25
JMJD8-209ENST00000567120 ABCC9O60706 1549 aa47.79■■■■■ 5.24
JMJD8-209ENST00000567120 NACADO15069 1562 aa47.51■■■■■ 5.2
JMJD8-209ENST00000567120 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP47.26■■■■■ 5.16
JMJD8-209ENST00000567120 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa46.77■■■■■ 5.08
JMJD8-209ENST00000567120 CECR2Q9BXF3 1484 aa46.72■■■■■ 5.07
JMJD8-209ENST00000567120 MROH2BQ7Z745 1585 aa46.56■■■■■ 5.04
JMJD8-209ENST00000567120 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa46.32■■■■■ 5.01
JMJD8-209ENST00000567120 WIZO95785 1651 aa46.28■■■■■ 5
JMJD8-209ENST00000567120 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP46.13■■■■■ 4.98
JMJD8-209ENST00000567120 UNC13AQ9UPW8 1703 aa46.08■■■■■ 4.97
JMJD8-209ENST00000567120 TRIM41Q8WV44 630 aa46.05■■■■■ 4.96
JMJD8-209ENST00000567120 PCGF6Q9BYE7 350 aa45.84■■■■■ 4.93
JMJD8-209ENST00000567120 SMARCA4P51532 1647 aa45.8■■■■■ 4.92
JMJD8-209ENST00000567120 HRCP23327 699 aa45.69■■■■■ 4.91
JMJD8-209ENST00000567120 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP45.66■■■■■ 4.9
JMJD8-209ENST00000567120 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP45.66■■■■■ 4.9
JMJD8-209ENST00000567120 BICRAQ9NZM4 1560 aa45.52■■■■■ 4.88
JMJD8-209ENST00000567120 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP45.51■■■■■ 4.88
JMJD8-209ENST00000567120 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP45.4■■■■■ 4.862e-6■■■■□ 24.9
JMJD8-209ENST00000567120 SMARCA2P51531 1590 aa45.37■■■■■ 4.85
JMJD8-209ENST00000567120 CCDC88BA6NC98 1476 aa45.35■■■■■ 4.85
JMJD8-209ENST00000567120 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP45.21■■■■■ 4.83
JMJD8-209ENST00000567120 PEG3Q9GZU2 1588 aa45.05■■■■■ 4.8
JMJD8-209ENST00000567120 ABCC8Q09428 1581 aa45.05■■■■■ 4.8
JMJD8-209ENST00000567120 EHMT2Q96KQ7 1210 aa44.99■■■■■ 4.79
JMJD8-209ENST00000567120 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa44.68■■■■■ 4.74
JMJD8-209ENST00000567120 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP44.66■■■■■ 4.74
JMJD8-209ENST00000567120 SOGA1O94964 1423 aa44.52■■■■■ 4.72
JMJD8-209ENST00000567120 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP44.51■■■■■ 4.72
JMJD8-209ENST00000567120 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP44.4■■■■■ 4.7
JMJD8-209ENST00000567120 EEA1Q15075 1411 aa44.4■■■■■ 4.7
JMJD8-209ENST00000567120 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa44.32■■■■■ 4.68
JMJD8-209ENST00000567120 SYNJ1O43426 1573 aa44.23■■■■■ 4.67
JMJD8-209ENST00000567120 CSRNP3Q8WYN3 585 aa44.22■■■■■ 4.67
JMJD8-209ENST00000567120 TNIKQ9UKE5 1360 aa44.18■■■■■ 4.66
JMJD8-209ENST00000567120 CEP162Q5TB80 1403 aa44.17■■■■■ 4.66
JMJD8-209ENST00000567120 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP44.07■■■■■ 4.64
JMJD8-209ENST00000567120 GOLGA3Q08378 1498 aa44.01■■■■■ 4.64
JMJD8-209ENST00000567120 HMGXB3Q12766 1538 aa43.95■■■■■ 4.63
JMJD8-209ENST00000567120 NCAPD3P42695 1498 aa43.93■■■■■ 4.62
JMJD8-209ENST00000567120 UBTFP17480 764 aaKnown RBP43.88■■■■■ 4.62
JMJD8-209ENST00000567120 KIF21BO75037 1637 aa43.83■■■■■ 4.61
JMJD8-209ENST00000567120 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.82■■■■■ 4.6
JMJD8-209ENST00000567120 TOP2BQ02880 1626 aa43.78■■■■■ 4.6
JMJD8-209ENST00000567120 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa43.67■■■■■ 4.58
JMJD8-209ENST00000567120 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa43.5■■■■■ 4.55
JMJD8-209ENST00000567120 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP43.48■■■■■ 4.55
JMJD8-209ENST00000567120 CFTRP13569 1480 aa43.45■■■■■ 4.55
JMJD8-209ENST00000567120 CLIP1P30622 1438 aa43.43■■■■■ 4.54
JMJD8-209ENST00000567120 CUX1P39880 1505 aa43.4■■■■■ 4.54
JMJD8-209ENST00000567120 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP43.38■■■■■ 4.53
JMJD8-209ENST00000567120 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP43.25■■■■■ 4.51
JMJD8-209ENST00000567120 VPS8Q8N3P4 1428 aa43.24■■■■■ 4.51
JMJD8-209ENST00000567120 PRXQ9BXM0 1461 aa43.22■■■■■ 4.51
JMJD8-209ENST00000567120 ERICH3Q5RHP9 1530 aa43.21■■■■■ 4.51
JMJD8-209ENST00000567120 PRDM2Q13029 1718 aa43.18■■■■■ 4.5
JMJD8-209ENST00000567120 KIF27Q86VH2 1401 aa43.06■■■■■ 4.48
JMJD8-209ENST00000567120 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.98■■■■■ 4.47
JMJD8-209ENST00000567120 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa42.97■■■■■ 4.47
JMJD8-209ENST00000567120 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP42.95■■■■■ 4.47
JMJD8-209ENST00000567120 ARAP1Q96P48 1450 aa42.85■■■■■ 4.45
JMJD8-209ENST00000567120 APLP2Q06481 763 aa42.82■■■■■ 4.45
JMJD8-209ENST00000567120 CUX2O14529 1486 aa42.7■■■■■ 4.43
JMJD8-209ENST00000567120 FGD5Q6ZNL6 1462 aa42.66■■■■■ 4.42
JMJD8-209ENST00000567120 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP42.62■■■■■ 4.41
JMJD8-209ENST00000567120 IGF1RP08069 1367 aa42.62■■■■■ 4.41
JMJD8-209ENST00000567120 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.56■■■■■ 4.4
JMJD8-209ENST00000567120 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa42.54■■■■■ 4.4
JMJD8-209ENST00000567120 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa42.4■■■■■ 4.38
JMJD8-209ENST00000567120 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP42.4■■■■■ 4.38
JMJD8-209ENST00000567120 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.38■■■■■ 4.37
JMJD8-209ENST00000567120 NESP48681 1621 aa42.33■■■■■ 4.37
JMJD8-209ENST00000567120 TOPBP1Q92547 1522 aa42.28■■■■■ 4.36
JMJD8-209ENST00000567120 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP42.23■■■■■ 4.35
JMJD8-209ENST00000567120 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa42.22■■■■■ 4.35
JMJD8-209ENST00000567120 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa42.22■■■■■ 4.35
JMJD8-209ENST00000567120 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP42.2■■■■■ 4.35
JMJD8-209ENST00000567120 DNAJC5BQ9UF47 199 aa42.19■■■■■ 4.34
JMJD8-209ENST00000567120 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP42.18■■■■■ 4.34
JMJD8-209ENST00000567120 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.13■■■■■ 4.33
JMJD8-209ENST00000567120 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP42.05■■■■■ 4.32
JMJD8-209ENST00000567120 MAP3K1Q13233 1512 aa42.05■■■■■ 4.32
JMJD8-209ENST00000567120 TIAM1Q13009 1591 aa42.03■■■■■ 4.32
JMJD8-209ENST00000567120 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42■■■■■ 4.31
JMJD8-209ENST00000567120 CCNB3Q8WWL7 1395 aa41.98■■■■■ 4.31
JMJD8-209ENST00000567120 CUL7Q14999 1698 aa41.97■■■■■ 4.31
JMJD8-209ENST00000567120 WDR97A6NE52 1622 aa41.94■■■■■ 4.3
JMJD8-209ENST00000567120 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP41.93■■■■■ 4.3
JMJD8-209ENST00000567120 FHAD1B1AJZ9 1412 aa41.89■■■■■ 4.3
JMJD8-209ENST00000567120 CLSPNQ9HAW4 1339 aa41.88■■■■■ 4.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.7 ms