Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Q9

NCOA3, Nuclear receptor coactivator 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA3Q9Y6Q9 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
NCOA3Q9Y6Q9 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC33.13■■■□□ 2.89
NCOA3Q9Y6Q9 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC33.12■■■□□ 2.89
NCOA3Q9Y6Q9 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
NCOA3Q9Y6Q9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
NCOA3Q9Y6Q9 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
NCOA3Q9Y6Q9 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
NCOA3Q9Y6Q9 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
NCOA3Q9Y6Q9 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
NCOA3Q9Y6Q9 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
NCOA3Q9Y6Q9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
NCOA3Q9Y6Q9 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
NCOA3Q9Y6Q9 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
NCOA3Q9Y6Q9 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
NCOA3Q9Y6Q9 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
NCOA3Q9Y6Q9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
NCOA3Q9Y6Q9 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
NCOA3Q9Y6Q9 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC33.1■■■□□ 2.89
NCOA3Q9Y6Q9 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
NCOA3Q9Y6Q9 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
NCOA3Q9Y6Q9 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
NCOA3Q9Y6Q9 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
NCOA3Q9Y6Q9 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
NCOA3Q9Y6Q9 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
NCOA3Q9Y6Q9 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
NCOA3Q9Y6Q9 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
NCOA3Q9Y6Q9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
NCOA3Q9Y6Q9 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
NCOA3Q9Y6Q9 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
NCOA3Q9Y6Q9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
NCOA3Q9Y6Q9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
NCOA3Q9Y6Q9 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
NCOA3Q9Y6Q9 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
NCOA3Q9Y6Q9 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
NCOA3Q9Y6Q9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
NCOA3Q9Y6Q9 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
NCOA3Q9Y6Q9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
NCOA3Q9Y6Q9 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
NCOA3Q9Y6Q9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
NCOA3Q9Y6Q9 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
NCOA3Q9Y6Q9 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
NCOA3Q9Y6Q9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
NCOA3Q9Y6Q9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
NCOA3Q9Y6Q9 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
NCOA3Q9Y6Q9 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
NCOA3Q9Y6Q9 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
NCOA3Q9Y6Q9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
NCOA3Q9Y6Q9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
NCOA3Q9Y6Q9 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
NCOA3Q9Y6Q9 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
NCOA3Q9Y6Q9 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
NCOA3Q9Y6Q9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
NCOA3Q9Y6Q9 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
NCOA3Q9Y6Q9 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
NCOA3Q9Y6Q9 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
NCOA3Q9Y6Q9 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
NCOA3Q9Y6Q9 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
NCOA3Q9Y6Q9 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
NCOA3Q9Y6Q9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
NCOA3Q9Y6Q9 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
NCOA3Q9Y6Q9 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
NCOA3Q9Y6Q9 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
NCOA3Q9Y6Q9 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
NCOA3Q9Y6Q9 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
NCOA3Q9Y6Q9 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
NCOA3Q9Y6Q9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
NCOA3Q9Y6Q9 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
NCOA3Q9Y6Q9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
NCOA3Q9Y6Q9 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
NCOA3Q9Y6Q9 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
NCOA3Q9Y6Q9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
NCOA3Q9Y6Q9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
NCOA3Q9Y6Q9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
NCOA3Q9Y6Q9 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
NCOA3Q9Y6Q9 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
NCOA3Q9Y6Q9 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
NCOA3Q9Y6Q9 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
NCOA3Q9Y6Q9 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC32.96■■■□□ 2.87
NCOA3Q9Y6Q9 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
NCOA3Q9Y6Q9 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
NCOA3Q9Y6Q9 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
NCOA3Q9Y6Q9 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
NCOA3Q9Y6Q9 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC32.95■■■□□ 2.87
NCOA3Q9Y6Q9 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
NCOA3Q9Y6Q9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC32.95■■■□□ 2.87
NCOA3Q9Y6Q9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
NCOA3Q9Y6Q9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
NCOA3Q9Y6Q9 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
NCOA3Q9Y6Q9 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
NCOA3Q9Y6Q9 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
NCOA3Q9Y6Q9 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
NCOA3Q9Y6Q9 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
NCOA3Q9Y6Q9 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
NCOA3Q9Y6Q9 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
NCOA3Q9Y6Q9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
NCOA3Q9Y6Q9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
NCOA3Q9Y6Q9 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
NCOA3Q9Y6Q9 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
NCOA3Q9Y6Q9 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
NCOA3Q9Y6Q9 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms