Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y239

NOD1, Nucleotide-binding oligomerization domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOD1Q9Y239 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NOD1Q9Y239 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NOD1Q9Y239 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NOD1Q9Y239 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NOD1Q9Y239 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NOD1Q9Y239 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NOD1Q9Y239 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
NOD1Q9Y239 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NOD1Q9Y239 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NOD1Q9Y239 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NOD1Q9Y239 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NOD1Q9Y239 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NOD1Q9Y239 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NOD1Q9Y239 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NOD1Q9Y239 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NOD1Q9Y239 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NOD1Q9Y239 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NOD1Q9Y239 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NOD1Q9Y239 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NOD1Q9Y239 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NOD1Q9Y239 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NOD1Q9Y239 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
NOD1Q9Y239 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NOD1Q9Y239 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NOD1Q9Y239 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NOD1Q9Y239 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NOD1Q9Y239 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NOD1Q9Y239 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NOD1Q9Y239 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NOD1Q9Y239 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NOD1Q9Y239 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NOD1Q9Y239 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NOD1Q9Y239 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NOD1Q9Y239 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NOD1Q9Y239 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NOD1Q9Y239 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NOD1Q9Y239 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NOD1Q9Y239 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
NOD1Q9Y239 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
NOD1Q9Y239 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NOD1Q9Y239 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NOD1Q9Y239 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NOD1Q9Y239 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NOD1Q9Y239 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NOD1Q9Y239 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NOD1Q9Y239 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NOD1Q9Y239 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NOD1Q9Y239 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NOD1Q9Y239 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NOD1Q9Y239 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NOD1Q9Y239 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NOD1Q9Y239 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NOD1Q9Y239 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NOD1Q9Y239 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NOD1Q9Y239 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NOD1Q9Y239 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NOD1Q9Y239 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
NOD1Q9Y239 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NOD1Q9Y239 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NOD1Q9Y239 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
NOD1Q9Y239 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
NOD1Q9Y239 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NOD1Q9Y239 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NOD1Q9Y239 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NOD1Q9Y239 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
NOD1Q9Y239 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
NOD1Q9Y239 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
NOD1Q9Y239 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NOD1Q9Y239 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NOD1Q9Y239 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NOD1Q9Y239 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NOD1Q9Y239 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NOD1Q9Y239 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NOD1Q9Y239 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NOD1Q9Y239 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NOD1Q9Y239 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NOD1Q9Y239 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
NOD1Q9Y239 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NOD1Q9Y239 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
NOD1Q9Y239 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NOD1Q9Y239 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NOD1Q9Y239 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NOD1Q9Y239 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NOD1Q9Y239 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NOD1Q9Y239 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NOD1Q9Y239 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NOD1Q9Y239 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NOD1Q9Y239 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NOD1Q9Y239 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NOD1Q9Y239 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NOD1Q9Y239 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NOD1Q9Y239 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NOD1Q9Y239 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NOD1Q9Y239 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NOD1Q9Y239 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NOD1Q9Y239 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NOD1Q9Y239 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NOD1Q9Y239 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NOD1Q9Y239 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NOD1Q9Y239 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms