Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQM7

CAMK2A, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2AQ9UQM7 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAMK2AQ9UQM7 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAMK2AQ9UQM7 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAMK2AQ9UQM7 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAMK2AQ9UQM7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAMK2AQ9UQM7 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAMK2AQ9UQM7 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAMK2AQ9UQM7 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAMK2AQ9UQM7 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAMK2AQ9UQM7 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAMK2AQ9UQM7 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAMK2AQ9UQM7 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAMK2AQ9UQM7 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAMK2AQ9UQM7 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAMK2AQ9UQM7 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAMK2AQ9UQM7 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAMK2AQ9UQM7 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAMK2AQ9UQM7 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAMK2AQ9UQM7 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CAMK2AQ9UQM7 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAMK2AQ9UQM7 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAMK2AQ9UQM7 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAMK2AQ9UQM7 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAMK2AQ9UQM7 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAMK2AQ9UQM7 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAMK2AQ9UQM7 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAMK2AQ9UQM7 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAMK2AQ9UQM7 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAMK2AQ9UQM7 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAMK2AQ9UQM7 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAMK2AQ9UQM7 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAMK2AQ9UQM7 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAMK2AQ9UQM7 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAMK2AQ9UQM7 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAMK2AQ9UQM7 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAMK2AQ9UQM7 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAMK2AQ9UQM7 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAMK2AQ9UQM7 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAMK2AQ9UQM7 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAMK2AQ9UQM7 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAMK2AQ9UQM7 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAMK2AQ9UQM7 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAMK2AQ9UQM7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAMK2AQ9UQM7 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAMK2AQ9UQM7 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAMK2AQ9UQM7 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAMK2AQ9UQM7 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAMK2AQ9UQM7 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAMK2AQ9UQM7 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAMK2AQ9UQM7 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAMK2AQ9UQM7 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAMK2AQ9UQM7 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAMK2AQ9UQM7 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAMK2AQ9UQM7 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAMK2AQ9UQM7 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAMK2AQ9UQM7 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAMK2AQ9UQM7 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAMK2AQ9UQM7 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAMK2AQ9UQM7 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAMK2AQ9UQM7 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CAMK2AQ9UQM7 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAMK2AQ9UQM7 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAMK2AQ9UQM7 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAMK2AQ9UQM7 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CAMK2AQ9UQM7 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAMK2AQ9UQM7 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAMK2AQ9UQM7 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAMK2AQ9UQM7 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAMK2AQ9UQM7 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAMK2AQ9UQM7 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAMK2AQ9UQM7 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAMK2AQ9UQM7 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CAMK2AQ9UQM7 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAMK2AQ9UQM7 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAMK2AQ9UQM7 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAMK2AQ9UQM7 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAMK2AQ9UQM7 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CAMK2AQ9UQM7 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CAMK2AQ9UQM7 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CAMK2AQ9UQM7 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CAMK2AQ9UQM7 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CAMK2AQ9UQM7 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CAMK2AQ9UQM7 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CAMK2AQ9UQM7 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CAMK2AQ9UQM7 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CAMK2AQ9UQM7 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CAMK2AQ9UQM7 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CAMK2AQ9UQM7 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CAMK2AQ9UQM7 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CAMK2AQ9UQM7 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CAMK2AQ9UQM7 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CAMK2AQ9UQM7 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CAMK2AQ9UQM7 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CAMK2AQ9UQM7 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CAMK2AQ9UQM7 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CAMK2AQ9UQM7 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CAMK2AQ9UQM7 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CAMK2AQ9UQM7 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CAMK2AQ9UQM7 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CAMK2AQ9UQM7 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91 ms