Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV0

CEP164, Centrosomal protein of 164 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP164Q9UPV0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.13
CEP164Q9UPV0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.13
CEP164Q9UPV0 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
CEP164Q9UPV0 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC40.87■■■■■ 4.13
CEP164Q9UPV0 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
CEP164Q9UPV0 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC40.86■■■■■ 4.13
CEP164Q9UPV0 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
CEP164Q9UPV0 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
CEP164Q9UPV0 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC40.85■■■■■ 4.13
CEP164Q9UPV0 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC40.85■■■■■ 4.13
CEP164Q9UPV0 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC40.85■■■■■ 4.13
CEP164Q9UPV0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
CEP164Q9UPV0 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC40.85■■■■■ 4.13
CEP164Q9UPV0 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
CEP164Q9UPV0 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
CEP164Q9UPV0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
CEP164Q9UPV0 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.83■■■■■ 4.13
CEP164Q9UPV0 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC40.83■■■■■ 4.13
CEP164Q9UPV0 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC40.82■■■■■ 4.12
CEP164Q9UPV0 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
CEP164Q9UPV0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.81■■■■■ 4.12
CEP164Q9UPV0 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
CEP164Q9UPV0 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC40.8■■■■■ 4.12
CEP164Q9UPV0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
CEP164Q9UPV0 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC40.8■■■■■ 4.12
CEP164Q9UPV0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.79■■■■■ 4.12
CEP164Q9UPV0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.79■■■■■ 4.12
CEP164Q9UPV0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.79■■■■■ 4.12
CEP164Q9UPV0 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
CEP164Q9UPV0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC40.78■■■■■ 4.12
CEP164Q9UPV0 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.78■■■■■ 4.12
CEP164Q9UPV0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
CEP164Q9UPV0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
CEP164Q9UPV0 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
CEP164Q9UPV0 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC40.77■■■■■ 4.12
CEP164Q9UPV0 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC40.77■■■■■ 4.12
CEP164Q9UPV0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC40.77■■■■■ 4.12
CEP164Q9UPV0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC40.77■■■■■ 4.12
CEP164Q9UPV0 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
CEP164Q9UPV0 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC40.77■■■■■ 4.12
CEP164Q9UPV0 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC40.77■■■■■ 4.12
CEP164Q9UPV0 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC40.77■■■■■ 4.12
CEP164Q9UPV0 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC40.77■■■■■ 4.12
CEP164Q9UPV0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC40.76■■■■■ 4.12
CEP164Q9UPV0 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC40.76■■■■■ 4.12
CEP164Q9UPV0 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
CEP164Q9UPV0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.74■■■■■ 4.11
CEP164Q9UPV0 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
CEP164Q9UPV0 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
CEP164Q9UPV0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
CEP164Q9UPV0 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
CEP164Q9UPV0 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
CEP164Q9UPV0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
CEP164Q9UPV0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
CEP164Q9UPV0 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.72■■■■■ 4.11
CEP164Q9UPV0 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
CEP164Q9UPV0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
CEP164Q9UPV0 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC40.71■■■■■ 4.11
CEP164Q9UPV0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.71■■■■■ 4.11
CEP164Q9UPV0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.71■■■■■ 4.11
CEP164Q9UPV0 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC40.7■■■■■ 4.11
CEP164Q9UPV0 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
CEP164Q9UPV0 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC40.7■■■■■ 4.11
CEP164Q9UPV0 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC40.7■■■■■ 4.11
CEP164Q9UPV0 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
CEP164Q9UPV0 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
CEP164Q9UPV0 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC40.69■■■■■ 4.1
CEP164Q9UPV0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.1
CEP164Q9UPV0 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC40.68■■■■■ 4.1
CEP164Q9UPV0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.68■■■■■ 4.1
CEP164Q9UPV0 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC40.68■■■■■ 4.1
CEP164Q9UPV0 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC40.67■■■■■ 4.1
CEP164Q9UPV0 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC40.67■■■■■ 4.1
CEP164Q9UPV0 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC40.67■■■■■ 4.1
CEP164Q9UPV0 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
CEP164Q9UPV0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
CEP164Q9UPV0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.66■■■■■ 4.1
CEP164Q9UPV0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC40.66■■■■■ 4.1
CEP164Q9UPV0 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.66■■■■■ 4.1
CEP164Q9UPV0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.66■■■■■ 4.1
CEP164Q9UPV0 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC40.65■■■■■ 4.1
CEP164Q9UPV0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC40.65■■■■■ 4.1
CEP164Q9UPV0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC40.65■■■■■ 4.1
CEP164Q9UPV0 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
CEP164Q9UPV0 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC40.64■■■■■ 4.1
CEP164Q9UPV0 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC40.64■■■■■ 4.1
CEP164Q9UPV0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC40.64■■■■■ 4.1
CEP164Q9UPV0 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.1
CEP164Q9UPV0 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC40.63■■■■■ 4.09
CEP164Q9UPV0 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC40.63■■■■■ 4.09
CEP164Q9UPV0 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC40.62■■■■■ 4.09
CEP164Q9UPV0 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
CEP164Q9UPV0 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC40.61■■■■■ 4.09
CEP164Q9UPV0 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
CEP164Q9UPV0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40.61■■■■■ 4.09
CEP164Q9UPV0 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
CEP164Q9UPV0 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC40.6■■■■■ 4.09
CEP164Q9UPV0 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC40.6■■■■■ 4.09
CEP164Q9UPV0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
CEP164Q9UPV0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC40.6■■■■■ 4.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.6 ms