Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL0

RCOR1, REST corepressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCOR1Q9UKL0 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RCOR1Q9UKL0 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RCOR1Q9UKL0 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RCOR1Q9UKL0 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RCOR1Q9UKL0 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RCOR1Q9UKL0 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RCOR1Q9UKL0 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RCOR1Q9UKL0 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RCOR1Q9UKL0 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RCOR1Q9UKL0 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RCOR1Q9UKL0 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RCOR1Q9UKL0 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RCOR1Q9UKL0 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RCOR1Q9UKL0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
RCOR1Q9UKL0 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RCOR1Q9UKL0 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RCOR1Q9UKL0 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
RCOR1Q9UKL0 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
RCOR1Q9UKL0 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RCOR1Q9UKL0 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RCOR1Q9UKL0 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RCOR1Q9UKL0 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RCOR1Q9UKL0 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RCOR1Q9UKL0 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RCOR1Q9UKL0 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RCOR1Q9UKL0 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RCOR1Q9UKL0 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RCOR1Q9UKL0 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RCOR1Q9UKL0 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RCOR1Q9UKL0 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RCOR1Q9UKL0 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RCOR1Q9UKL0 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RCOR1Q9UKL0 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RCOR1Q9UKL0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RCOR1Q9UKL0 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RCOR1Q9UKL0 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RCOR1Q9UKL0 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RCOR1Q9UKL0 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RCOR1Q9UKL0 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RCOR1Q9UKL0 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RCOR1Q9UKL0 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RCOR1Q9UKL0 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RCOR1Q9UKL0 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RCOR1Q9UKL0 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RCOR1Q9UKL0 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RCOR1Q9UKL0 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RCOR1Q9UKL0 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RCOR1Q9UKL0 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RCOR1Q9UKL0 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RCOR1Q9UKL0 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RCOR1Q9UKL0 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RCOR1Q9UKL0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RCOR1Q9UKL0 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RCOR1Q9UKL0 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RCOR1Q9UKL0 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RCOR1Q9UKL0 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RCOR1Q9UKL0 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RCOR1Q9UKL0 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RCOR1Q9UKL0 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RCOR1Q9UKL0 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RCOR1Q9UKL0 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RCOR1Q9UKL0 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RCOR1Q9UKL0 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RCOR1Q9UKL0 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RCOR1Q9UKL0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RCOR1Q9UKL0 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RCOR1Q9UKL0 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
RCOR1Q9UKL0 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RCOR1Q9UKL0 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RCOR1Q9UKL0 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RCOR1Q9UKL0 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RCOR1Q9UKL0 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RCOR1Q9UKL0 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RCOR1Q9UKL0 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RCOR1Q9UKL0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RCOR1Q9UKL0 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RCOR1Q9UKL0 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RCOR1Q9UKL0 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RCOR1Q9UKL0 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RCOR1Q9UKL0 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RCOR1Q9UKL0 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RCOR1Q9UKL0 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RCOR1Q9UKL0 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RCOR1Q9UKL0 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RCOR1Q9UKL0 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RCOR1Q9UKL0 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RCOR1Q9UKL0 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RCOR1Q9UKL0 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RCOR1Q9UKL0 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RCOR1Q9UKL0 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RCOR1Q9UKL0 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RCOR1Q9UKL0 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RCOR1Q9UKL0 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RCOR1Q9UKL0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RCOR1Q9UKL0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RCOR1Q9UKL0 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RCOR1Q9UKL0 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
RCOR1Q9UKL0 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RCOR1Q9UKL0 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RCOR1Q9UKL0 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms