Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKG1

APPL1, DCC-interacting protein 13-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APPL1Q9UKG1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
APPL1Q9UKG1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
APPL1Q9UKG1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
APPL1Q9UKG1 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
APPL1Q9UKG1 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
APPL1Q9UKG1 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
APPL1Q9UKG1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
APPL1Q9UKG1 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
APPL1Q9UKG1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
APPL1Q9UKG1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
APPL1Q9UKG1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
APPL1Q9UKG1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
APPL1Q9UKG1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
APPL1Q9UKG1 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
APPL1Q9UKG1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
APPL1Q9UKG1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
APPL1Q9UKG1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
APPL1Q9UKG1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
APPL1Q9UKG1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
APPL1Q9UKG1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
APPL1Q9UKG1 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
APPL1Q9UKG1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
APPL1Q9UKG1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
APPL1Q9UKG1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
APPL1Q9UKG1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
APPL1Q9UKG1 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
APPL1Q9UKG1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
APPL1Q9UKG1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
APPL1Q9UKG1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
APPL1Q9UKG1 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
APPL1Q9UKG1 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
APPL1Q9UKG1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
APPL1Q9UKG1 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
APPL1Q9UKG1 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
APPL1Q9UKG1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
APPL1Q9UKG1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
APPL1Q9UKG1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
APPL1Q9UKG1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
APPL1Q9UKG1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
APPL1Q9UKG1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
APPL1Q9UKG1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
APPL1Q9UKG1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
APPL1Q9UKG1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
APPL1Q9UKG1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
APPL1Q9UKG1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
APPL1Q9UKG1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
APPL1Q9UKG1 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
APPL1Q9UKG1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
APPL1Q9UKG1 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
APPL1Q9UKG1 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
APPL1Q9UKG1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
APPL1Q9UKG1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
APPL1Q9UKG1 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
APPL1Q9UKG1 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
APPL1Q9UKG1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
APPL1Q9UKG1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
APPL1Q9UKG1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
APPL1Q9UKG1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
APPL1Q9UKG1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
APPL1Q9UKG1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
APPL1Q9UKG1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
APPL1Q9UKG1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
APPL1Q9UKG1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
APPL1Q9UKG1 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
APPL1Q9UKG1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
APPL1Q9UKG1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
APPL1Q9UKG1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
APPL1Q9UKG1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
APPL1Q9UKG1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
APPL1Q9UKG1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
APPL1Q9UKG1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
APPL1Q9UKG1 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
APPL1Q9UKG1 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
APPL1Q9UKG1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
APPL1Q9UKG1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
APPL1Q9UKG1 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
APPL1Q9UKG1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
APPL1Q9UKG1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
APPL1Q9UKG1 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
APPL1Q9UKG1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
APPL1Q9UKG1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
APPL1Q9UKG1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
APPL1Q9UKG1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
APPL1Q9UKG1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
APPL1Q9UKG1 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
APPL1Q9UKG1 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
APPL1Q9UKG1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
APPL1Q9UKG1 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
APPL1Q9UKG1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
APPL1Q9UKG1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
APPL1Q9UKG1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
APPL1Q9UKG1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
APPL1Q9UKG1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
APPL1Q9UKG1 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
APPL1Q9UKG1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
APPL1Q9UKG1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
APPL1Q9UKG1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
APPL1Q9UKG1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
APPL1Q9UKG1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
APPL1Q9UKG1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms