Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2D1

CHD7, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 2,997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD7Q9P2D1 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHD7Q9P2D1 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHD7Q9P2D1 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHD7Q9P2D1 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHD7Q9P2D1 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHD7Q9P2D1 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHD7Q9P2D1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHD7Q9P2D1 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHD7Q9P2D1 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHD7Q9P2D1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHD7Q9P2D1 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHD7Q9P2D1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHD7Q9P2D1 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CHD7Q9P2D1 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHD7Q9P2D1 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHD7Q9P2D1 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHD7Q9P2D1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHD7Q9P2D1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHD7Q9P2D1 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHD7Q9P2D1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHD7Q9P2D1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHD7Q9P2D1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHD7Q9P2D1 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHD7Q9P2D1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHD7Q9P2D1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHD7Q9P2D1 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHD7Q9P2D1 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHD7Q9P2D1 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHD7Q9P2D1 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHD7Q9P2D1 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHD7Q9P2D1 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHD7Q9P2D1 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHD7Q9P2D1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHD7Q9P2D1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHD7Q9P2D1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHD7Q9P2D1 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHD7Q9P2D1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHD7Q9P2D1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHD7Q9P2D1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHD7Q9P2D1 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHD7Q9P2D1 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHD7Q9P2D1 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHD7Q9P2D1 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHD7Q9P2D1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHD7Q9P2D1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHD7Q9P2D1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHD7Q9P2D1 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHD7Q9P2D1 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHD7Q9P2D1 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHD7Q9P2D1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHD7Q9P2D1 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CHD7Q9P2D1 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHD7Q9P2D1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHD7Q9P2D1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHD7Q9P2D1 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHD7Q9P2D1 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHD7Q9P2D1 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHD7Q9P2D1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHD7Q9P2D1 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHD7Q9P2D1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHD7Q9P2D1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHD7Q9P2D1 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHD7Q9P2D1 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CHD7Q9P2D1 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHD7Q9P2D1 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHD7Q9P2D1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHD7Q9P2D1 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHD7Q9P2D1 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHD7Q9P2D1 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHD7Q9P2D1 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CHD7Q9P2D1 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHD7Q9P2D1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHD7Q9P2D1 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CHD7Q9P2D1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHD7Q9P2D1 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHD7Q9P2D1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHD7Q9P2D1 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHD7Q9P2D1 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHD7Q9P2D1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CHD7Q9P2D1 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CHD7Q9P2D1 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CHD7Q9P2D1 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CHD7Q9P2D1 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CHD7Q9P2D1 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CHD7Q9P2D1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHD7Q9P2D1 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHD7Q9P2D1 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CHD7Q9P2D1 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHD7Q9P2D1 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHD7Q9P2D1 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHD7Q9P2D1 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHD7Q9P2D1 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHD7Q9P2D1 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHD7Q9P2D1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHD7Q9P2D1 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHD7Q9P2D1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHD7Q9P2D1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHD7Q9P2D1 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHD7Q9P2D1 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHD7Q9P2D1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms