Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP81

SARS2, Serine--tRNA ligase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SARS2Q9NP81 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SARS2Q9NP81 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SARS2Q9NP81 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SARS2Q9NP81 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SARS2Q9NP81 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SARS2Q9NP81 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SARS2Q9NP81 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SARS2Q9NP81 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SARS2Q9NP81 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SARS2Q9NP81 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SARS2Q9NP81 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SARS2Q9NP81 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SARS2Q9NP81 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SARS2Q9NP81 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SARS2Q9NP81 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SARS2Q9NP81 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SARS2Q9NP81 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SARS2Q9NP81 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SARS2Q9NP81 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SARS2Q9NP81 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SARS2Q9NP81 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SARS2Q9NP81 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SARS2Q9NP81 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SARS2Q9NP81 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SARS2Q9NP81 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SARS2Q9NP81 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SARS2Q9NP81 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SARS2Q9NP81 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SARS2Q9NP81 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SARS2Q9NP81 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SARS2Q9NP81 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SARS2Q9NP81 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SARS2Q9NP81 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SARS2Q9NP81 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SARS2Q9NP81 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SARS2Q9NP81 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SARS2Q9NP81 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SARS2Q9NP81 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SARS2Q9NP81 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SARS2Q9NP81 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SARS2Q9NP81 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SARS2Q9NP81 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SARS2Q9NP81 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SARS2Q9NP81 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SARS2Q9NP81 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SARS2Q9NP81 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SARS2Q9NP81 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SARS2Q9NP81 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SARS2Q9NP81 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SARS2Q9NP81 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SARS2Q9NP81 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SARS2Q9NP81 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SARS2Q9NP81 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SARS2Q9NP81 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SARS2Q9NP81 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SARS2Q9NP81 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SARS2Q9NP81 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SARS2Q9NP81 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SARS2Q9NP81 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SARS2Q9NP81 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SARS2Q9NP81 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SARS2Q9NP81 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SARS2Q9NP81 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SARS2Q9NP81 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SARS2Q9NP81 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SARS2Q9NP81 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SARS2Q9NP81 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SARS2Q9NP81 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SARS2Q9NP81 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SARS2Q9NP81 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SARS2Q9NP81 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SARS2Q9NP81 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SARS2Q9NP81 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SARS2Q9NP81 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SARS2Q9NP81 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SARS2Q9NP81 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SARS2Q9NP81 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SARS2Q9NP81 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SARS2Q9NP81 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SARS2Q9NP81 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SARS2Q9NP81 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SARS2Q9NP81 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SARS2Q9NP81 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SARS2Q9NP81 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SARS2Q9NP81 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SARS2Q9NP81 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SARS2Q9NP81 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SARS2Q9NP81 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SARS2Q9NP81 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SARS2Q9NP81 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SARS2Q9NP81 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SARS2Q9NP81 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SARS2Q9NP81 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SARS2Q9NP81 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SARS2Q9NP81 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SARS2Q9NP81 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SARS2Q9NP81 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SARS2Q9NP81 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SARS2Q9NP81 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SARS2Q9NP81 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms