Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP55

BPIFA1, BPI fold-containing family A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA1Q9NP55 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BPIFA1Q9NP55 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
BPIFA1Q9NP55 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BPIFA1Q9NP55 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BPIFA1Q9NP55 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BPIFA1Q9NP55 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BPIFA1Q9NP55 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BPIFA1Q9NP55 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
BPIFA1Q9NP55 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BPIFA1Q9NP55 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BPIFA1Q9NP55 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BPIFA1Q9NP55 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BPIFA1Q9NP55 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BPIFA1Q9NP55 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BPIFA1Q9NP55 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
BPIFA1Q9NP55 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BPIFA1Q9NP55 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BPIFA1Q9NP55 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BPIFA1Q9NP55 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BPIFA1Q9NP55 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BPIFA1Q9NP55 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BPIFA1Q9NP55 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BPIFA1Q9NP55 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BPIFA1Q9NP55 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BPIFA1Q9NP55 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BPIFA1Q9NP55 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BPIFA1Q9NP55 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BPIFA1Q9NP55 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
BPIFA1Q9NP55 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BPIFA1Q9NP55 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
BPIFA1Q9NP55 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BPIFA1Q9NP55 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BPIFA1Q9NP55 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BPIFA1Q9NP55 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BPIFA1Q9NP55 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BPIFA1Q9NP55 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BPIFA1Q9NP55 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BPIFA1Q9NP55 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BPIFA1Q9NP55 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BPIFA1Q9NP55 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BPIFA1Q9NP55 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BPIFA1Q9NP55 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BPIFA1Q9NP55 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BPIFA1Q9NP55 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BPIFA1Q9NP55 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BPIFA1Q9NP55 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BPIFA1Q9NP55 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BPIFA1Q9NP55 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
BPIFA1Q9NP55 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BPIFA1Q9NP55 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BPIFA1Q9NP55 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BPIFA1Q9NP55 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BPIFA1Q9NP55 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BPIFA1Q9NP55 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BPIFA1Q9NP55 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BPIFA1Q9NP55 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BPIFA1Q9NP55 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BPIFA1Q9NP55 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BPIFA1Q9NP55 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BPIFA1Q9NP55 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BPIFA1Q9NP55 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BPIFA1Q9NP55 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BPIFA1Q9NP55 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BPIFA1Q9NP55 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BPIFA1Q9NP55 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BPIFA1Q9NP55 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BPIFA1Q9NP55 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BPIFA1Q9NP55 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BPIFA1Q9NP55 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BPIFA1Q9NP55 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BPIFA1Q9NP55 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BPIFA1Q9NP55 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BPIFA1Q9NP55 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BPIFA1Q9NP55 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BPIFA1Q9NP55 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BPIFA1Q9NP55 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BPIFA1Q9NP55 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BPIFA1Q9NP55 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BPIFA1Q9NP55 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BPIFA1Q9NP55 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BPIFA1Q9NP55 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
BPIFA1Q9NP55 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BPIFA1Q9NP55 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BPIFA1Q9NP55 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BPIFA1Q9NP55 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BPIFA1Q9NP55 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BPIFA1Q9NP55 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
BPIFA1Q9NP55 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BPIFA1Q9NP55 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BPIFA1Q9NP55 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BPIFA1Q9NP55 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BPIFA1Q9NP55 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BPIFA1Q9NP55 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BPIFA1Q9NP55 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
BPIFA1Q9NP55 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BPIFA1Q9NP55 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BPIFA1Q9NP55 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BPIFA1Q9NP55 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
BPIFA1Q9NP55 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BPIFA1Q9NP55 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.8 ms