Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQE4

SELENOS, Selenoprotein S, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENOSQ9BQE4 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
SELENOSQ9BQE4 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SELENOSQ9BQE4 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SELENOSQ9BQE4 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SELENOSQ9BQE4 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SELENOSQ9BQE4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SELENOSQ9BQE4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SELENOSQ9BQE4 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SELENOSQ9BQE4 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SELENOSQ9BQE4 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SELENOSQ9BQE4 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SELENOSQ9BQE4 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SELENOSQ9BQE4 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SELENOSQ9BQE4 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SELENOSQ9BQE4 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SELENOSQ9BQE4 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SELENOSQ9BQE4 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SELENOSQ9BQE4 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SELENOSQ9BQE4 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SELENOSQ9BQE4 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SELENOSQ9BQE4 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SELENOSQ9BQE4 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SELENOSQ9BQE4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SELENOSQ9BQE4 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SELENOSQ9BQE4 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SELENOSQ9BQE4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SELENOSQ9BQE4 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SELENOSQ9BQE4 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SELENOSQ9BQE4 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SELENOSQ9BQE4 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SELENOSQ9BQE4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SELENOSQ9BQE4 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SELENOSQ9BQE4 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SELENOSQ9BQE4 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SELENOSQ9BQE4 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SELENOSQ9BQE4 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SELENOSQ9BQE4 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SELENOSQ9BQE4 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SELENOSQ9BQE4 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SELENOSQ9BQE4 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SELENOSQ9BQE4 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SELENOSQ9BQE4 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SELENOSQ9BQE4 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SELENOSQ9BQE4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SELENOSQ9BQE4 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SELENOSQ9BQE4 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SELENOSQ9BQE4 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SELENOSQ9BQE4 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SELENOSQ9BQE4 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SELENOSQ9BQE4 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SELENOSQ9BQE4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SELENOSQ9BQE4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SELENOSQ9BQE4 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SELENOSQ9BQE4 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SELENOSQ9BQE4 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SELENOSQ9BQE4 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SELENOSQ9BQE4 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SELENOSQ9BQE4 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SELENOSQ9BQE4 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SELENOSQ9BQE4 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SELENOSQ9BQE4 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SELENOSQ9BQE4 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SELENOSQ9BQE4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SELENOSQ9BQE4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SELENOSQ9BQE4 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SELENOSQ9BQE4 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SELENOSQ9BQE4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SELENOSQ9BQE4 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SELENOSQ9BQE4 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SELENOSQ9BQE4 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SELENOSQ9BQE4 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SELENOSQ9BQE4 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SELENOSQ9BQE4 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SELENOSQ9BQE4 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SELENOSQ9BQE4 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SELENOSQ9BQE4 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SELENOSQ9BQE4 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SELENOSQ9BQE4 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SELENOSQ9BQE4 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SELENOSQ9BQE4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SELENOSQ9BQE4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SELENOSQ9BQE4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SELENOSQ9BQE4 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SELENOSQ9BQE4 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SELENOSQ9BQE4 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SELENOSQ9BQE4 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SELENOSQ9BQE4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SELENOSQ9BQE4 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SELENOSQ9BQE4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SELENOSQ9BQE4 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SELENOSQ9BQE4 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SELENOSQ9BQE4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SELENOSQ9BQE4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SELENOSQ9BQE4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SELENOSQ9BQE4 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SELENOSQ9BQE4 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SELENOSQ9BQE4 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SELENOSQ9BQE4 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SELENOSQ9BQE4 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SELENOSQ9BQE4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms