Protein–RNA interactions for Protein: Q99613

EIF3C, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3CQ99613 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EIF3CQ99613 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EIF3CQ99613 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EIF3CQ99613 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EIF3CQ99613 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EIF3CQ99613 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EIF3CQ99613 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EIF3CQ99613 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
EIF3CQ99613 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
EIF3CQ99613 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EIF3CQ99613 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
EIF3CQ99613 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
EIF3CQ99613 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
EIF3CQ99613 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
EIF3CQ99613 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EIF3CQ99613 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EIF3CQ99613 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EIF3CQ99613 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
EIF3CQ99613 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
EIF3CQ99613 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EIF3CQ99613 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EIF3CQ99613 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EIF3CQ99613 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EIF3CQ99613 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EIF3CQ99613 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EIF3CQ99613 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
EIF3CQ99613 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
EIF3CQ99613 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
EIF3CQ99613 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EIF3CQ99613 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EIF3CQ99613 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EIF3CQ99613 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EIF3CQ99613 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EIF3CQ99613 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
EIF3CQ99613 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EIF3CQ99613 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EIF3CQ99613 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
EIF3CQ99613 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EIF3CQ99613 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EIF3CQ99613 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EIF3CQ99613 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EIF3CQ99613 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EIF3CQ99613 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EIF3CQ99613 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EIF3CQ99613 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EIF3CQ99613 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
EIF3CQ99613 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EIF3CQ99613 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EIF3CQ99613 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EIF3CQ99613 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
EIF3CQ99613 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
EIF3CQ99613 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
EIF3CQ99613 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EIF3CQ99613 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EIF3CQ99613 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
EIF3CQ99613 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
EIF3CQ99613 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EIF3CQ99613 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EIF3CQ99613 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
EIF3CQ99613 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EIF3CQ99613 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EIF3CQ99613 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
EIF3CQ99613 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
EIF3CQ99613 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
EIF3CQ99613 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EIF3CQ99613 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EIF3CQ99613 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
EIF3CQ99613 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EIF3CQ99613 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EIF3CQ99613 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EIF3CQ99613 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EIF3CQ99613 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EIF3CQ99613 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EIF3CQ99613 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EIF3CQ99613 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EIF3CQ99613 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EIF3CQ99613 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EIF3CQ99613 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
EIF3CQ99613 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EIF3CQ99613 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EIF3CQ99613 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
EIF3CQ99613 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EIF3CQ99613 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
EIF3CQ99613 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EIF3CQ99613 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EIF3CQ99613 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
EIF3CQ99613 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
EIF3CQ99613 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
EIF3CQ99613 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
EIF3CQ99613 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
EIF3CQ99613 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
EIF3CQ99613 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
EIF3CQ99613 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
EIF3CQ99613 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
EIF3CQ99613 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
EIF3CQ99613 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
EIF3CQ99613 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
EIF3CQ99613 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
EIF3CQ99613 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
EIF3CQ99613 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms