Protein–RNA interactions for Protein: Q96QV1

HHIP, Hedgehog-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHIPQ96QV1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HHIPQ96QV1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HHIPQ96QV1 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HHIPQ96QV1 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HHIPQ96QV1 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HHIPQ96QV1 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HHIPQ96QV1 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HHIPQ96QV1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HHIPQ96QV1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HHIPQ96QV1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HHIPQ96QV1 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HHIPQ96QV1 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HHIPQ96QV1 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HHIPQ96QV1 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HHIPQ96QV1 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HHIPQ96QV1 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HHIPQ96QV1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HHIPQ96QV1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HHIPQ96QV1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HHIPQ96QV1 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
HHIPQ96QV1 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HHIPQ96QV1 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HHIPQ96QV1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HHIPQ96QV1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HHIPQ96QV1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HHIPQ96QV1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HHIPQ96QV1 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HHIPQ96QV1 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HHIPQ96QV1 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HHIPQ96QV1 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HHIPQ96QV1 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HHIPQ96QV1 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HHIPQ96QV1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HHIPQ96QV1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
HHIPQ96QV1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HHIPQ96QV1 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HHIPQ96QV1 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HHIPQ96QV1 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
HHIPQ96QV1 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HHIPQ96QV1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HHIPQ96QV1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HHIPQ96QV1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HHIPQ96QV1 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HHIPQ96QV1 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HHIPQ96QV1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HHIPQ96QV1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HHIPQ96QV1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HHIPQ96QV1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HHIPQ96QV1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HHIPQ96QV1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HHIPQ96QV1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HHIPQ96QV1 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HHIPQ96QV1 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
HHIPQ96QV1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HHIPQ96QV1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HHIPQ96QV1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HHIPQ96QV1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HHIPQ96QV1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HHIPQ96QV1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HHIPQ96QV1 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HHIPQ96QV1 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HHIPQ96QV1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HHIPQ96QV1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HHIPQ96QV1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HHIPQ96QV1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HHIPQ96QV1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HHIPQ96QV1 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HHIPQ96QV1 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HHIPQ96QV1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
HHIPQ96QV1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HHIPQ96QV1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HHIPQ96QV1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HHIPQ96QV1 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
HHIPQ96QV1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HHIPQ96QV1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HHIPQ96QV1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HHIPQ96QV1 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HHIPQ96QV1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HHIPQ96QV1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HHIPQ96QV1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HHIPQ96QV1 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HHIPQ96QV1 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HHIPQ96QV1 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HHIPQ96QV1 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HHIPQ96QV1 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
HHIPQ96QV1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HHIPQ96QV1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HHIPQ96QV1 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HHIPQ96QV1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HHIPQ96QV1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HHIPQ96QV1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HHIPQ96QV1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HHIPQ96QV1 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HHIPQ96QV1 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HHIPQ96QV1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HHIPQ96QV1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HHIPQ96QV1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HHIPQ96QV1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HHIPQ96QV1 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HHIPQ96QV1 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.9 ms